3-(2,3,5-tri-O-benzyl-β-D-ribofuranosyl)benzamide | 138385-42-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 3-(2,3,5-tri-O-benzyl-β-D-ribofuranosyl)benzamide
• 英文别名: 3-[(2S,3S,4R,5R)-3,4-bis(phenylmethoxy)-5-(phenylmethoxymethyl)oxolan-2-yl]benzamide
• CAS: 138385-42-9
• 化学式: C₃₃H₃₃NO₅
• 分子量: 523.629
• InChiKey: ZDVWAMDTAKCAGE-IQLXHWPESA-N

物化性质

• 沸点：
  683.5±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.23±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.5
• 重原子数：
  39
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  80
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-(2,3,5-tri-O-benzyl-β-D-ribofuranosyl)benzamide 在 三溴化硼 、 对甲苯磺酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成 3-(2,3-O-isopropylidene-β-D-ribofuranosyl)benzamide
  参考文献：
  名称：

  用于分析 NAD 相互作用组的化学蛋白质组学方法

  摘要：

  烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD +）是一种多功能分子。除了氧化还原代谢之外，NAD +作为翻译后修饰酶的底物也具有同样重要的功能，最大的家族是聚 ADP 核糖聚合酶（PARP，人类有 17 个家族成员）。最近令人惊讶的发现非经典 NAD（NAD +/NADH) 结合蛋白表明 NAD 相互作用组可能比之前想象的要大；然而，用于分析和发现 NAD 结合蛋白的广泛有用的化学工具还不存在。在这里，我们描述了用于询问 NAD 相互作用组的可点击光亲和标记 (PAL) 探针 2- 和 6-ad-BAD 的设计、合成和验证。我们发现 2-ad-BAD 以依赖于 UV 的方式有效地标记 PARP。使用 2- 和 6-ad-BAD 进行的化学蛋白质组学实验鉴定了已知和未知的 NAD + /NADH 结合蛋白。总之，我们的研究展示了 2-ad-BAD 和 6-ad-BAD 作为可点击 PAL NAD 探针的实用性。

  DOI：

  10.1021/jacs.1c01302
• 作为产物：
  描述：

  间溴苯甲腈 在 三乙基硅烷 、 正丁基锂 、 乙醇 、 potassium trimethylsilonate 作用下， 以 四氢呋喃 、 正己烷 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 25.08h， 生成 3-(2,3,5-tri-O-benzyl-β-D-ribofuranosyl)benzamide
  参考文献：
  名称：

  靶向铜绿假单胞菌 NAD 激酶的 NAD+ 类似物的基于结构的设计、合成和生物学评价

  摘要：

  多重耐药性是一个重大的公共卫生问题，需要紧急开发新的抗生素，因此需要确定新的细菌靶标。烟酰胺腺嘌呤二核苷酸激酶 NADK 的活性在迄今为止测试的所有细菌中都是必不可少的，包括许多表现出抗生素耐药性导致当前治疗失败的人类病原体。因此，抑制 NADK 是一种有前途的创新抗菌策略，因为目前市场上还没有针对这种酶的药物。通过基于片段的药物设计方法，我们最近开发了一种 NAD +竞争性 NADK 抑制剂，它显示出体内对金黄色葡萄球菌的活性. 在这里，我们表明该化合物是一种双腺苷衍生物，对来自革兰氏阴性菌铜绿假单胞菌(PaNADK) 的 NADK 酶没有活性。这种缺乏活性可以用 PaNADK 的晶体结构来解释，在本研究中它是在与 NADP +的复合物中确定的。结构分析使我们设计并合成了一种苯甲酰胺腺嘌呤二核苷类似物，对 PaNADK 具有活性。这种新型化合物在体外有效抑制 PaNADK 酶活性，K i为

  DOI：

  10.1111/febs.16604

文献信息

• Efficient Synthesis of Benzamide Riboside, a Potential Anticancer Agent
  作者：Laurent F. Bonnac、Guang-Yao Gao、Liqiang Chen、Steven E. Patterson、Hiremagalur N. Jayaram、Krzysztof W. Pankiewicz

  DOI：10.1080/15257770701528222

  日期：2007.11.26

  An efficient five step synthesis of benzamide riboside (BR) amenable for a large scale synthesis has been developed. It allows for extensive pre-clinical studies of BR as a potential anticancer agent.

  已经开发出适于大规模合成的有效的五步合成苯甲酰胺核糖苷（BR）。它可以对BR作为潜在的抗癌药进行广泛的临床前研究。
• The Synthesis and Biological Evaluation of Benzamide Riboside and Its Phosphordiamidates Prodrugs
  作者：Jianning Zhou、Chunyan Tan、Nan Zhang、Jian Fan、Chun Guo、Yuyang Jiang

  DOI：10.1080/10426500701808135

  日期：2008.1.14

  penetration ability of benzamide riboside [BR, (1-β-D-ribofuranosyl) benzene-3-carboxamide], which is a novel C-glycoside analogue of nicotinamide riboside and has excellent cytotoxic activity, we designed and synthesized two phosphordiamidates (1a and 1b) as prodrugs to deliver phosphorylated BR into cells. However, the bioactivity evaluation shows that 1a and 1b have lower biological activity (IC50 > 200 μM

  为了克服耐药性并增强苯甲酰胺核苷[BR, (1-β-D-呋喃核糖基) benzo-3-carboxamide]的膜穿透能力，它是烟酰胺核苷的新型C-糖苷类似物，具有优异的细胞毒性活性，我们设计并合成了两种磷酰胺（1a 和 1b）作为前药，将磷酸化的 BR 递送到细胞中。然而，生物活性评估表明，与 BR 相比，1a 和 1b 具有较低的生物活性（IC50 > 200 μM 和 173 μM，分别）。这可能是因为 1a 和 1b 只能作为 BR 储存形式，因此不能代谢为磷酸化苯甲酰胺核苷。
• Synthesis and cytotoxic activity of C-glycosidic nicotinamide riboside analogs
  作者：Karsten Krohn、Heidi Heins、Klaus Wielckens

  DOI：10.1021/jm00081a012

  日期：1992.2

  The C-glycosidic nicotinamide riboside analogue (2) was prepared by reaction of ribonolactone 24 with the lithiated oxazoline 19 followed by triethylsilane reduction to 26 and deprotection. Selective phosphorylation to the pseudonucleotide 34 was effected via the isopropylidene compound 33. In contrast to the benzoic acid riboside (28) the benzamide riboside (2) showed extremely high cytotoxicity at nanomolar concentrations to S49.1 lymphoma cells but only slightly increased dexamethasone toxicity.
• Probing binding requirements of NAD kinase with modified substrate (NAD) analogues
  作者：Laurent Bonnac、Liqiang Chen、Rashmi Pathak、Guangyao Gao、Qian Ming、Eric Bennett、Krzysztof Felczak、Martin Kullberg、Steven E. Patterson、Francesca Mazzola、Giulio Magni、Krzysztof W. Pankiewicz

  DOI：10.1016/j.bmcl.2007.01.012

  日期：2007.3

  Synthesis of novel NAD(+) analogues that cannot be phosphorylated by NAD kinase is reported. In these analogues the C2' hydroxyl group of the adenosine moiety was replaced by fluorine in the ribo or arabino configuration (1 and 2, respectively) or was inverted into arabino configuration to give compound 3. Compounds 1 and 2 showed inhibition of human NAD kinase, whereas analogue 3 inhibited both the human and Mycobacterium tuberculosis NAD kinase. An uncharged benzamide adenine dinucleotide (BAD) was found to be the most potent competitive inhibitor (K-i = 90 mu M) of the human enzyme reported so far. (c) 2007 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• [EN] BENZAMIDE ADENINE DINUCLEOSIDE COMPOUNDS AND THEIR USES<br/>[FR] COMPOSÉS DE BENZAMIDE ADÉNINE DINUCLÉOSIDE ET LEURS UTILISATIONS
  申请人：[en]INSTITUT NATIONAL DE LA SANTÉ ET DE LA RECHERCHE MÉDICALE

  公开号：WO2024013349A1

  公开（公告）日：2024-01-18

  The inventors have now succeeded in developing compounds of Formula (I), described below, having the advantage of inhibiting NAD kinases, in particular P. aeruginosa NADK (PaNADK) enzyme, Listeria monocytogenes (LmNADK) enzyme and/or human cytosolic NADK (HsNADK) enzyme. The present invention relates to benzamide adenine dinucleoside compounds which are useful as inhibitors of NAD kinases, to pharmaceutical composition comprising such compounds, and to uses of such compounds in the treatment or prevention of bacterial infections.