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4-脱氧尿苷 | 3690-10-6

中文名称
4-脱氧尿苷
中文别名
2-嘧啶酮-B-核甙;泽布拉林
英文名称
Zebularine
英文别名
1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
4-脱氧尿苷化学式
CAS
3690-10-6
化学式
C9H12N2O5
mdl
——
分子量
228.205
InChiKey
RPQZTTQVRYEKCR-WCTZXXKLSA-N
BEILSTEIN
——
EINECS
——
  • 物化性质
  • 计算性质
  • ADMET
  • 安全信息
  • SDS
  • 制备方法与用途
  • 上下游信息
  • 反应信息
  • 文献信息
  • 表征谱图
  • 同类化合物
  • 相关功能分类
  • 相关结构分类

物化性质

  • 熔点:
    160-162?C
  • 沸点:
    499.0±55.0 °C(Predicted)
  • 密度:
    1.73±0.1 g/cm3(Predicted)
  • 溶解度:
    DMSO:16 mg/mL,可溶

计算性质

  • 辛醇/水分配系数(LogP):
    -1.5
  • 重原子数:
    16
  • 可旋转键数:
    2
  • 环数:
    2.0
  • sp3杂化的碳原子比例:
    0.56
  • 拓扑面积:
    103
  • 氢给体数:
    3
  • 氢受体数:
    5

安全信息

  • WGK Germany:
    3
  • 危险性防范说明:
    P261,P305+P351+P338
  • 危险性描述:
    H302,H315,H319
  • 储存条件:
    2-8℃

SDS

SDS:34018461a8796b266b6c72412d87e28b
查看
1.1 产品标识符
: Zebularine
产品名称
1.2 鉴别的其他方法
2-Pyrimidone-1-β-D-riboside
1-(β-D-Ribofuranosyl)-1,2-dihydropyrimidin-2-one
1.3 有关的确定了的物质或混合物的用途和建议不适合的用途
仅供科研用途,不作为药物、家庭备用药或其它用途。

模块 2. 危险性概述
2.1 GHS分类
根据化学品全球统一分类与标签制度(GHS)的规定,不是危险物质或混合物。
当心 - 物质尚未完全测试。
2.3 其它危害物 - 无

模块 3. 成分/组成信息
3.1 物 质
: 2-Pyrimidone-1-β-D-riboside
别名
1-(β-D-Ribofuranosyl)-1,2-dihydropyrimidin-2-one
: C9H12N2O5
分子式
: 228.2 g/mol
分子量


模块 4. 急救措施
4.1 必要的急救措施描述
吸入
如果吸入,请将患者移到新鲜空气处。 如果停止了呼吸,给于人工呼吸。
皮肤接触
用肥皂和大量的水冲洗。
眼睛接触
用水冲洗眼睛作为预防措施。
食入
切勿给失去知觉者从嘴里喂食任何东西。 用水漱口。
4.2 主要症状和影响,急性和迟发效应
4.3 及时的医疗处理和所需的特殊处理的说明和指示
无数据资料

模块 5. 消防措施
5.1 灭火介质
灭火方法及灭火剂
用水雾,耐醇泡沫,干粉或二氧化碳灭火。
5.2 源于此物质或混合物的特别的危害
碳氧化物, 氮氧化物
5.3 给消防员的建议
如必要的话,戴自给式呼吸器去救火。
5.4 进一步信息
无数据资料

模块 6. 泄露应急处理
6.1 人员的预防,防护设备和紧急处理程序
防止粉尘的生成。 防止吸入蒸汽、气雾或气体。
6.2 环境保护措施
不要让产物进入下水道。
6.3 抑制和清除溢出物的方法和材料
扫掉和铲掉。 存放进适当的闭口容器中待处理。
6.4 参考其他部分
丢弃处理请参阅第13节。

模块 7. 操作处置与储存
7.1 安全操作的注意事项
在有粉尘生成的地方,提供合适的排风设备。
7.2 安全储存的条件,包括任何不兼容性
贮存在阴凉处。 容器保持紧闭,储存在干燥通风处。
建议的贮存温度: 2 - 8 °C
7.3 特定用途
无数据资料

模块 8. 接触控制和个体防护
8.1 容许浓度
最高容许浓度
没有已知的国家规定的暴露极限。
8.2 暴露控制
适当的技术控制
常规的工业卫生操作。
个体防护设备
眼/面保护
请使用经官方标准如NIOSH (美国) 或 EN 166(欧盟) 检测与批准的设备防护眼部。
皮肤保护
所选择的保护手套必须符合EU的89/686/EEC规定和从它衍生出来的EN 376标准。
戴手套取 手套在使用前必须受检查。
请使用合适的方法脱除手套(不要接触手套外部表面),避免任何皮肤部位接触此产品.
使用后请将被污染过的手套根据相关法律法规和有效的实验室规章程序谨慎处理. 请清洗并吹干双手
身体保护
根据危险物质的类型,浓度和量,以及特定的工作场所来选择人体保护措施。,
防护设备的类型必须根据特定工作场所中的危险物的浓度和含量来选择。
呼吸系统防护
不需要保护呼吸。如需防护粉尘损害,请使用N95型(US)或P1型(EN 143)防尘面具。
呼吸器使用经过测试并通过政府标准如NIOSH(US)或CEN(EU)的呼吸器和零件。

模块 9. 理化特性
9.1 基本的理化特性的信息
a) 外观与性状
形状: 固体
b) 气味
无数据资料
c) 气味阈值
无数据资料
d) pH值
无数据资料
e) 熔点/凝固点
无数据资料
f) 起始沸点和沸程
无数据资料
g) 闪点
无数据资料
h) 蒸发速率
无数据资料
i) 易燃性(固体,气体)
无数据资料
j) 高的/低的燃烧性或爆炸性限度 无数据资料
k) 蒸汽压
无数据资料
l) 蒸汽密度
无数据资料
m) 相对密度
无数据资料
n) 水溶性
无数据资料
o) n-辛醇/水分配系数
无数据资料
p) 自燃温度
无数据资料
q) 分解温度
无数据资料
r) 粘度
无数据资料

模块 10. 稳定性和反应活性
10.1 反应性
无数据资料
10.2 稳定性
无数据资料
10.3 危险反应的可能性
无数据资料
10.4 应避免的条件
无数据资料
10.5 不兼容的材料
强氧化剂
10.6 危险的分解产物
其它分解产物 - 无数据资料

模块 11. 毒理学资料
11.1 毒理学影响的信息
急性毒性
无数据资料
皮肤刺激或腐蚀
无数据资料
眼睛刺激或腐蚀
无数据资料
呼吸道或皮肤过敏
无数据资料
生殖细胞突变性
无数据资料
致癌性
IARC:
此产品中没有大于或等于 0。1%含量的组分被 IARC鉴别为可能的或肯定的人类致癌物。
生殖毒性
无数据资料
特异性靶器官系统毒性(一次接触)
无数据资料
特异性靶器官系统毒性(反复接触)
无数据资料
吸入危险
无数据资料
潜在的健康影响
吸入 吸入可能有害。 可能引起呼吸道刺激。
摄入 如服入是有害的。
皮肤 如果通过皮肤吸收可能是有害的。 可能引起皮肤刺激。
眼睛 可能引起眼睛刺激。
附加说明
化学物质毒性作用登记: 无数据资料

模块 12. 生态学资料
12.1 生态毒性
无数据资料
12.2 持久存留性和降解性
无数据资料
12.3 潜在的生物蓄积性
无数据资料
12.4 土壤中的迁移性
无数据资料
12.5 PBT 和 vPvB的结果评价
无数据资料
12.6 其它不利的影响
无数据资料

模块 13. 废弃处置
13.1 废物处理方法
产品
将剩余的和未回收的溶液交给处理公司。
受污染的容器和包装
作为未用过的产品弃置。

模块 14. 运输信息
14.1 联合国危险货物编号
欧洲陆运危规: - 国际海运危规: - 国际空运危规: -
14.2 联合国(UN)规定的名称
欧洲陆运危规: 非危险货物
国际海运危规: 非危险货物
国际空运危规: 非危险货物
14.3 运输危险类别
欧洲陆运危规: - 国际海运危规: - 国际空运危规: -
14.4 包裹组
欧洲陆运危规: - 国际海运危规: - 国际空运危规: -
14.5 环境危险
欧洲陆运危规: 否 国际海运危规 海运污染物: 否 国际空运危规: 否
14.6 对使用者的特别提醒
无数据资料


模块 15 - 法规信息
N/A


模块16 - 其他信息
N/A

制备方法与用途

生物活性

Zebularine(NSC 309132,4-脱氧尿苷)是一种DNA甲基转移酶抑制剂,能够与DNA甲基转移酶形成共价复合物,并且还抑制胞苷脱氨酶。在无细胞试验中,其对胞苷脱氨酶的Ki值为2 μM。

靶点
Target Value
DNA methyltransferase
(无细胞试验)
-
Cytidine deaminase
(无细胞试验)
2 μM (Ki)
体外研究

Zebularine 是一种胞苷类似物,含有2-(1H)-嘧啶酮环,最初合成用作胞苷脱氨酶抑制剂。它与细菌甲基转移酶形成紧密的共价复合物,并作用于N. crassa,通过抑制DNA甲基化来重新激活因甲基化而沉默的基因。Zebularine 不是选择性抑制剂,而是类似于5-Aza-CR的DNA甲基化抑制剂。在T24膀胱癌细胞中,它能够重新激活沉默的p16基因,并去甲基化其启动子区域。与正常成纤维细胞相比,Zebularine 更优先地掺入癌细胞系的DNA 中,显著抑制细胞生长和基因表达。此外,与正常成纤维细胞相比,Zebularine 还能够优先耗尽癌细胞中的DNA甲基转移酶1(DNMT1),并诱导癌症相关抗原基因的表达。

体内研究

处理携带肿瘤的小鼠时,Zebularine 表现出轻微的细胞毒性。以1000 mg/kg剂量给小鼠口服或腹腔注射后,平均最大体重变化为11%(95% CI = 4%-19%)。与对照组相比,高剂量 Zebularine 处理的小鼠肿瘤体积显著减小。

上下游信息

  • 上游原料
    中文名称 英文名称 CAS号 化学式 分子量
  • 下游产品
    中文名称 英文名称 CAS号 化学式 分子量

反应信息

  • 作为反应物:
    描述:
    4-脱氧尿苷邻四氯苯醌对甲苯磺酸 作用下, 以 二甲基亚砜 为溶剂, 反应 61.0h, 生成 6-cyano-1-(2',3'-O-isopropylidene-β-D-ribofuranosyl)-O6,5'-cyclo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-2-one
    参考文献:
    名称:
    Rao, Kambhampati V. B.; Marquez, Victor E.; Kelley, James A., Journal of the Chemical Society. Perkin transactions I, 1983, # 1, p. 127 - 130
    摘要:
    DOI:
  • 作为产物:
    描述:
    2',3',5'-tri-O-acetyl-zebularine 在 甲醇 作用下, 以81%的产率得到4-脱氧尿苷
    参考文献:
    名称:
    α-吡喃酮和嘧啶酮作为基于亲和力的蛋白质谱分析的光亲和探针的评价
    摘要:
    α-吡喃酮和嘧啶酮是天然产物和生物活性化合物中常见的结构基序。它们还显示出产生高能中间体的光化学,该中间体可能具有蛋白质反应性。合成了吡喃酮和嘧啶酮的文库,并评估了它们在几种粗细胞裂解物中用作基于非定向亲和力的蛋白质谱分析的光亲和探针的潜力。进一步的“原理证明”实验表明,适当支架上的嘧啶酮标签具有与二苯甲酮同样的蛋白质组标记能力。
    DOI:
    10.1021/jo201281c
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文献信息

  • CLEAVABLE CONJUGATES OF TLR7/8 AGONIST COMPOUNDS, METHODS FOR PREPARATION, AND USES THEREOF
    申请人:Dynavax Technologies Corporation
    公开号:US20190151462A1
    公开(公告)日:2019-05-23
    The present disclosure relates to cleavable conjugates (for example, particle-based or antibody-based conjugates) of TLR7/8 agonists (for example, 1H-imidazo[4,5-c]quinoline derivatives) containing a conjugation linker, a cleavable linker, and a self-eliminating linker. The present disclosure also related to methods for preparation of the cleavable conjugates, uses thereof for stimulating an effective immune response, and uses thereof for the treatment of cancer.
    本公开涉及可切割的结合物(例如,基于颗粒或抗体的结合物),其中包含TLR7/8激动剂(例如,1H-咪唑[4,5-c]喹啉衍生物),包括结合连接物、可切割连接物和自消除连接物。本公开还涉及制备可切割结合物的方法,以及将其用于刺激有效的免疫反应和用于癌症治疗的用途。
  • THERAPEUTICALLY ACTIVE COMPOUNDS AND THEIR METHODS OF USE
    申请人:Lemieux Rene M.
    公开号:US20150031627A1
    公开(公告)日:2015-01-29
    Provided are methods of treating a cancer characterized by the presence of a mutant allele of IDH1/2 comprising administering to a subject in need thereof a compound described here.
    提供的方法是治疗一种由IDH1/2突变等位基因特征性存在的癌症,包括向需要此治疗的患者施用此处描述的化合物。
  • [EN] THERAPEUTICALLY ACTIVE COMPOUNDS AND THEIR METHODS OF USE<br/>[FR] COMPOSÉS THÉRAPEUTIQUEMENT ACTIFS ET LEURS MÉTHODES D'UTILISATION
    申请人:AGIOS PHARMACEUTICALS INC
    公开号:WO2015010297A1
    公开(公告)日:2015-01-29
    Provided are methods of treating a cancer characterized by the presence of a mutant allele of IDH1/2 comprising administering to a subject in need thereof a compound described here.
    提供的方法是治疗一种由IDH1/2突变等位基因特征性存在的癌症,包括向需要此治疗的患者施用此处描述的化合物。
  • [EN] NOVEL COMPOUNDS AS DUAL INHIBITORS OF HISTONE METHYLTRANSFERASES AND DNA METHYLTRANSFERASES<br/>[FR] NOUVEAUX COMPOSÉS UTILISÉS COMME INHIBITEURS DOUBLES D'HISTONE MÉTHYLTRANSFÉRASES ET D'ADN MÉTHYLTRANSFÉRASES
    申请人:FUNDACIÓN PARA LA INVESTIGACIÓN MÉDICA APLIC
    公开号:WO2015192981A1
    公开(公告)日:2015-12-23
    It relates to the use of compounds of formula (I'), or their pharmaceutically or veterinary acceptable salts, or their stereoisomers or mixtures thereof, as anticancer agents and as agents for generating induced pluripotent stem cells. Compounds of formula (I'), wherein R2' is an alcoxy group, a hydrocarbon chain or a ring system, and R1, R3, and R4 are as defined herein, are dual inhibitors of histone methyltransferases and DNA methyltransferases. It also relates to the compounds of formula (I'), or their pharmaceutically or veterinary acceptable salts, or their stereoisomers or mixtures thereof, wherein R2' is phenyl or 5- to 6-membered heteroaromatic ring, both optionally fused to another rings (i.e., compounds of formula (I)). It also relates to pharmaceutical or veterinary compositions containing compounds of formula (I).
    这里讨论的是使用公式(I')的化合物,或其药用或兽药可接受的盐,或它们的立体异构体或混合物,作为抗癌剂和诱导多能干细胞生成的剂。其中,R2' 是一个醇氧基团、一个碳氢链或一个环系,而 R1、R3 和 R4 如本文所述定义,是组蛋白甲基转移酶和DNA甲基转移酶的双重抑制剂。还涉及到公式(I')的化合物,或其药用或兽药可接受的盐,或它们的立体异构体或混合物,其中 R2' 是苯基或5至6员的杂芳环,两者都可以选择与其他环融合(即公式(I)的化合物)。还涉及到含有公式(I)化合物的药用或兽药组合物。
  • POLYMER PARTICLES OR NANO-VECTORS AND USE THEREOF AS A DRUG AND/OR DIAGNOSTIC AGENT
    申请人:Bertrand Philippe
    公开号:US20140219925A1
    公开(公告)日:2014-08-07
    Novel polymer nanovectors or particles and use thereof as medication and/or diagnostic agents.
    新型聚合物纳米载体或颗粒及其作为药物和/或诊断试剂的用途。
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