methyl 4-(4-((2,4-diaminopyrimidin-5-yl)methyl)-2,6-dimethoxyphenoxy)butanoate | 1069120-58-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: methyl 4-(4-((2,4-diaminopyrimidin-5-yl)methyl)-2,6-dimethoxyphenoxy)butanoate
• 英文别名: Methyl 4-[4-[(2,4-diaminopyrimidin-5-yl)methyl]-2,6-dimethoxyphenoxy]butanoate；methyl 4-[4-[(2,4-diaminopyrimidin-5-yl)methyl]-2,6-dimethoxyphenoxy]butanoate
• CAS: 1069120-58-6
• 化学式: C₁₈H₂₄N₄O₅
• 分子量: 376.412
• InChiKey: GPACMHOFMZGGMX-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.58
• 重原子数：
  27.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.39
• 拓扑面积：
  131.81
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 4-(4-((2,4-diaminopyrimidin-5-yl)methyl)-2,6-dimethoxyphenoxy)butanoate 在 potassium carbonate 作用下， 以 甲醇 、 水 为溶剂， 以74 %的产率得到4-(4-((2, 4-diaminopyrimidin-5-yl)methyl)-2, 6-dimethoxyphenoxy)butanoic acid
  参考文献：
  名称：

  使用甲氧苄啶 PROTAC 调节 eDHFR 标记蛋白

  摘要：

  对细胞和活体动物中蛋白质水平的时间控制可用于提高我们对蛋白质功能的理解。此外，工程蛋白质的控制可用于治疗应用。蛋白水解靶向嵌合体 (PROTAC) 已成为一种小分子驱动策略，通过将 E3 连接酶招募到目标蛋白上，实现蛋白丰度的快速翻译后调节。在这里，我们通过将抗生素甲氧苄啶 (TMP) 与 Pomalidomide（E3 连接酶 Cereblon 的配体）共价连接来开发几种 PROTAC 分子。这些分子诱导与小蛋白结构域、大肠杆菌二氢叶酸还原酶 (eDHFR) 基因融合的感兴趣蛋白 (POI) 的降解，这是 TMP 的分子靶点。我们表明，使用 PROTAC 分子7c可以将各种 eDHFR 标记蛋白稳健地降解至最大表达量的 95%。此外，使用蛋白质组学和生化测定，基于 TMP 的 PROTAC 对免疫调节酰亚胺药物 (IMiD) 敏感的新底物的表达影响最小。最后，我们展示了另一个已知的降解决定子-PROTAC

  DOI：

  10.1038/s41467-023-42820-3
• 作为产物：
  描述：

  甲氧苄啶 在 氢溴酸 、 caesium carbonate 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 12.0h， 生成 methyl 4-(4-((2,4-diaminopyrimidin-5-yl)methyl)-2,6-dimethoxyphenoxy)butanoate
  参考文献：
  名称：

  [EN] CONTROL OF PROTEIN EXPRESSION WITH TMP-PROTAC COMPOUNDS
  [FR] RÉGULATION DE L'EXPRESSION PROTÉIQUE AVEC DES COMPOSÉS DE TMP-PROTAC

  摘要：

  本文介绍了式(I)的化合物或其药学上可接受的盐：(I)可用于控制带有eDHFR标签的蛋白质表达，并使用这些化合物控制蛋白质表达的方法，以及包含这些化合物的试剂盒。

  公开号：

  WO2022217295A1

文献信息

• Conditional Glycosylation in Eukaryotic Cells Using a Biocompatible Chemical Inducer of Dimerization
  作者：Jennifer L. Czlapinski、Michael W. Schelle、Lawrence W. Miller、Scott T. Laughlin、Jennifer J. Kohler、Virginia W. Cornish、Carolyn R. Bertozzi

  DOI：10.1021/ja8037728

  日期：2008.10.8

  Chemical inducers of dimerization (CIDs) are cell-permeable small molecules capable of dimerizing two protein targets. The most widely used CID, the natural product rapamycin and its relatives, is immunosuppressive due to interactions with endogenous targets and thus has limited utility in vivo. Here we report a new biocompatible CID, Tmp-SLF, which dimerizes E. coli DHFR and FKBP and has no endogenous mammalian targets that would lead to unwanted in vivo side effects. We employed Tmp-SLF to modulate gene expression in a yeast three-hybrid assay. Finally, we engineered the Golgi-resident glycosyltransferase FucT7 for tunable control by Tmp-SLF in mammalian cells.