[(2S,3S,4R)-4,5-diacetoxy-3-benzyloxy-2-(benzyloxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl]methyl acetate | 206055-48-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: [(2S,3S,4R)-4,5-diacetoxy-3-benzyloxy-2-(benzyloxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl]methyl acetate
• 英文别名: 4-C-(Acetoxymethyl)-1,2-di-O-acetyl-3,5-di-O-benzyl-D-ribofuranose；[(2S,3S,4R)-4,5-diacetyloxy-3-phenylmethoxy-2-(phenylmethoxymethyl)oxolan-2-yl]methyl acetate
• CAS: 206055-48-3
• 化学式: C₂₆H₃₀O₉
• 分子量: 486.519
• InChiKey: SGNUSNURWHZHHS-NNQWSVJYSA-N

物化性质

• 沸点：
  572.4±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.25±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.4
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  107
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [(2S,3S,4R)-4,5-diacetoxy-3-benzyloxy-2-(benzyloxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl]methyl acetate 在 palladium on activated charcoal ammonium hydroxide 、 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 1,4-环己二烯 、 sodium methylate 、 sodium hydride 、 对甲苯磺酰氯 作用下， 以 吡啶 、 甲醇 为溶剂， 反应 167.17h， 生成 (1S,3R,4R,7S)-3-(4-N-benzoylcytosin-1-yl)-7-hydroxy-1-hydroxymethyl-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane
  参考文献：
  名称：

  LNA（锁定核酸）：腺嘌呤，胞嘧啶，鸟嘌呤，5-甲基胞嘧啶，胸腺嘧啶和尿嘧啶双环核苷单体的合成，寡聚化和前所未有的核酸识别

  摘要：

  由2'- O，4'- C-亚甲基双环核苷单体组成的LNA（锁定核酸）被有效合成，并评估了其对六种不同核碱基（腺嘌呤，胞嘧啶，鸟嘌呤，5-甲基胞嘧啶，胸腺嘧啶）的核酸识别潜力和尿嘧啶。当评估部分或完全修饰的LNA的混合序列时，双链体对DNA和RNA的热稳定性出现了前所未有的提高（每个修饰+3至+8°C）。错配序列的研究表明，与相应的未修饰参考链相比，LNA遵循具有普遍提高的选择性的Watson-Crick碱基配对规则。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(98)00094-5
• 作为产物：
  描述：

  4-C-(ethanoyloxymethyl)-3,5-di-O-benzyl-1,2-O-isopropylidene-α-D-ribofuranose 在 溶剂黄146 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 反应 76.0h， 生成 [(2S,3S,4R)-4,5-diacetoxy-3-benzyloxy-2-(benzyloxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl]methyl acetate
  参考文献：
  名称：

  LNA（锁定核酸）：腺嘌呤，胞嘧啶，鸟嘌呤，5-甲基胞嘧啶，胸腺嘧啶和尿嘧啶双环核苷单体的合成，寡聚化和前所未有的核酸识别

  摘要：

  由2'- O，4'- C-亚甲基双环核苷单体组成的LNA（锁定核酸）被有效合成，并评估了其对六种不同核碱基（腺嘌呤，胞嘧啶，鸟嘌呤，5-甲基胞嘧啶，胸腺嘧啶）的核酸识别潜力和尿嘧啶。当评估部分或完全修饰的LNA的混合序列时，双链体对DNA和RNA的热稳定性出现了前所未有的提高（每个修饰+3至+8°C）。错配序列的研究表明，与相应的未修饰参考链相比，LNA遵循具有普遍提高的选择性的Watson-Crick碱基配对规则。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(98)00094-5

文献信息

• Compounds and oligomeric compounds comprising novel nucleobases
  申请人：——

  公开号：US20040033973A1

  公开（公告）日：2004-02-19

  The present invention relates to nucleoside compositions comprising novel nucleobases and oligomeric compounds comprising at least one such nucleoside. These oligomeric compounds typically have enhanced binding affinity properties compared to oligomeric compounds without the modification. The oligomeric compounds are useful, for example, for investigative and therapeutic purposes.

  本发明涉及包含新型核碱基的核苷酸组合物以及包含至少一种此类核苷酸的寡聚合物化合物。这些寡聚合物化合物通常具有比没有这种修饰的寡聚合物化合物更强的结合亲和性能。这些寡聚合物化合物可用于调查和治疗等用途。
• A Simplified and Efficient Route to 2‘-<i>O</i>, 4‘-<i>C</i>-Methylene-Linked Bicyclic Ribonucleosides (Locked Nucleic Acid)
  作者：Alexei A. Koshkin、Jef Fensholdt、Henrik M. Pfundheller、Christian Lomholt

  DOI：10.1021/jo010732p

  日期：2001.12.1

  can be prepared from D-glucose in multigram scale. Four different nucleobases were stereoselectively coupled to 8 using a modified Vorbrüggen procedure to give the corresponding 4'-C-branched nucleoside derivatives. Subsequent ring closing furnished the protected LNA nucleosides. The 5'-O-mesyl groups were efficiently displaced by nucleophilic substitution using sodium benzoate. Saponification of the

  描述了一种合成锁核酸（LNA）单体的新型有效方法。通过聚合合成制备了含有胸腺嘧啶，4-N-乙酰基和4-N-苯甲酰基胞嘧啶，6-N-苯甲酰腺嘌呤和2-N-异丁酰鸟嘌呤作为核碱基的LNA 5'，3'-二醇。该方法基于使用常见的糖中间体1,2-二-O-乙酰基-3-O-苄基-4-C-甲磺酰氧基甲基-5-O-甲磺酰-D-赤型戊呋喃糖（8）可以从D-葡萄糖以克数制得。使用改良的Vorbrüggen程序将四个不同的核碱基立体选择性地偶联到8个核碱基上，得到相应的4'-C-支链核苷衍生物。随后的闭环提供了受保护的LNA核苷。使用苯甲酸钠通过亲核取代有效地置换了5'-O-甲磺酰基。将5'-苯甲酸酯皂化，然后催化除去3'-O-苄基，得到游离的LNA二醇。腺苷和胞苷的环外氨基被选择性地酰化，得到4-N-乙酰基或4-N-苯甲酰基-LNA-C和6-N-苯甲酰基-LNA-A。在制备2-N-异丁酰基-LNA-G期间，鸟
• [EN] OLIGONUCLEOTIDES CONTAINING NUCLEOTIDE ANALOGS<br/>[FR] OLIGONUCLÉOTIDES CONTENANT DES ANALOGUES NUCLÉOTIDIQUES
  申请人：SANOFI SA

  公开号：WO2021044004A1

  公开（公告）日：2021-03-11

  The present disclosure relates to double-stranded oligonucleotides, including double-stranded oligonucleotides such as siRNAs, comprising a sense strand oligonucleotide and an antisense strand oligonucleotide, and wherein the antisense strand oligonucleotide comprises one or more nucleotide analogs of formula (I-A) which are neither the 5'-overhang nucleotide nor the 3'-overhang nucleotide of the said antisense strand oligonucleotide, and wherein a nucleotide analog of formula (I-A) is as described in the disclosure. Oligonucleotides containing these analogs have superior biological activity, for example, increased in vitro stability and improved in vivo potency especially improved off-target profiles. The improved oligonucleotides are useful for silencing (e.g., reducing or eradicating) the expression of a target gene.

  本公开涉及双链寡核苷酸，包括双链寡核苷酸，例如siRNA，包括一个sense链寡核苷酸和一个antisense链寡核苷酸，其中antisense链寡核苷酸包括一个或多个公式(I-A)的核苷酸类似物，这些类似物既不是所述antisense链寡核苷酸的5'-突出核苷酸也不是3'-突出核苷酸，并且公式(I-A)的核苷酸类似物如所述。含有这些类似物的寡核苷酸具有优越的生物活性，例如增加的体外稳定性和改善的体内效力，特别是改善的非靶向作用谱。改进的寡核苷酸对于沉默（例如减少或根除）靶基因的表达是有用的。
• Synthesis of purine locked nucleic acid analogues
  申请人：——

  公开号：US20020086998A1

  公开（公告）日：2002-07-04

  The present invention relates to a new method for the synthesis of purine LNA (Locked Nucleic Acid) analogues which provides a higher overall yield. The method comprising a regioselective 9-N purine glycosylation reaction followed by a one-pot nucleophilic aromatic substitution reaction of the 6-substituent in the purine ring and simultaneous nucleophile-induced intramolecular ring closure of the C-branched carbohydrate to form novel purine LNA analogues. The novel strategy is illustrated by the synthesis of the novel compound (1S,3R,4R,7S)-7-benzyloxy-1-methanesulfonylmethyl-3-(guanin-9-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane which is easily converted into (1S,3R,4R,7S)-7-hydroxy-1-hydroxymethyl-3-((2-N-isobutyrylguanin-9-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane after isobutyryl protection of the 2-amino purine group and subsequent substitution of 1-methanesulfonyl with benzoate, debenzoylation and debenzylation.

  本发明涉及一种用于合成嘌呤LNA（Locked Nucleic Acid）类似物的新方法，该方法提供了更高的总产率。该方法包括选择性区域9-N嘌呤糖基化反应，然后是在嘌呤环中的6-取代基上进行一锅核亲电芳香取代反应，同时核亲电引发的C-支链碳水化合物的分子内环闭合，形成新的嘌呤LNA类似物。新策略通过合成新化合物（1S,3R,4R,7S）-7-苄氧基-1-甲磺酰甲基-3-(鸟嘌呤-9-基)-2,5-二氧杂二环［2.2.1］庚烷来加以说明，该化合物易于转化为（1S,3R,4R,7S）-7-羟基-1-羟甲基-3-((2-N-异丁酰鸟嘌呤-9-基)-2,5-二氧杂二环［2.2.1］庚烷，经过对2-氨基嘌呤基的异丁酰保护和随后的1-甲磺酰与苯甲酸苄酯取代、去苯甲酰和去苄基化反应。
• Synthesis of [2.2.1]bicyclo nucleosides
  申请人：Exiqon A/S

  公开号：US20030092905A1

  公开（公告）日：2003-05-15

  A synthesis of [2.2.1]bicyclo nucleosides which is shorter and provides higher overall yields proceeds via the key intermediate of the general formula III, wherein R 4 and R 5 are, for instance, sulfonates and R 7 is, for instance, a halogen or an acetate. From compounds of the general formula II, such as 3-O-aryl-4-C-hydroxymethyl-1,2-O-isopropylidene-&agr;-D-ribofuranose, intermediates of the general formula III are suitable for coupling with silylated nucleobases. Upon one-pot base-induced ring-closure and desulfonation of the formed [2.2.1]bicyclo nucleoside, a short route to each the LNA (Locked Nucleic Acid) derivatives of adenosine, cytosine, uridine, thymidine and guanidine is demonstrated. The use of the 5′-sulfonated ring-closed intermediate also allows for synthesis of 5′-amino- and thio-LNAs. 1

  通过通式III的关键中间体进行合成[2.2.1]双环核苷，该方法较短且提供更高的总收率，其中R4和R5例如为磺酸盐，R7例如为卤素或醋酸盐。从通式II的化合物，例如3-O-芳基-4-C-羟甲基-1,2-O-异丙基亚-D-核糖，通式III的中间体适用于与硅化核苷碱进行偶联。通过一锅法碱催化环闭合和去磺酸化形成的[2.2.1]双环核苷，演示了腺嘌呤、胞嘧啶、尿嘧啶、胸腺嘧啶和鸟嘌呤的LNA（锁定核酸）衍生物的短路线。使用5'-磺酸化环闭合中间体还允许合成5'-氨基和硫代-LNA。