methyl 5-acetamido-3,5-dideoxy-3-fluoro-D-erythro-α-L-gluco-non-2-ulopyranosonate | 117295-65-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: methyl 5-acetamido-3,5-dideoxy-3-fluoro-D-erythro-α-L-gluco-non-2-ulopyranosonate
• 英文别名: methyl 5-acetamido-5-acetamido-5-deoxy-3-fluoro-D-erythro-L-gluco-2-nonulopyranosonate；methyl (2R,3S,4R,5R,6R)-5-acetamido-3-fluoro-2,4-dihydroxy-6-[(1R,2R)-1,2,3-trihydroxypropyl]oxane-2-carboxylate
• CAS: 117295-65-5
• 化学式: C₁₂H₂₀FNO₉
• 分子量: 341.291
• InChiKey: YZIZSFGTBAWUMK-LLXLWUBISA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.84
• 重原子数：
  23.0
• 可旋转键数：
  5.0
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.83
• 拓扑面积：
  165.78
• 氢给体数：
  6.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 5-acetamido-3,5-dideoxy-3-fluoro-D-erythro-α-L-gluco-non-2-ulopyranosonate 在 4-二甲氨基吡啶 、 二乙胺基三氟化硫 、 hydrazine acetate 作用下， 以 吡啶 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 6.25h， 生成 methyl 5-acetamido-4,7,8,9-tetra-O-acetyl-2,3,5-trideoxy-3-fluoro-D-erythro-β-L-gluco-non-2-ulopyranosylonate fluoride
  参考文献：
  名称：

  基于调节机制的神经氨酸酶灭活剂：机理和结构的见解。

  摘要：

  3-氟唾液酸氟是唾液酸酶的抑制剂，可通过形成长寿命的共价活性位点加合物而发挥作用，并且如果针对病原体唾液酸酶具有特异性，则具有治疗潜力。令人惊讶的是，人类Neu2和克氏锥虫唾液酸唾液酸酶在C3处具有赤道氟离子的失活比其轴向差向异构体更快地失活，并按照相同的模式进行重新激活。为了探索可能的立体电子基础，测量了四个3-氟唾液酰氟的全系列的自发水解的速率常数，并计算了每个的基态能量。α（赤道）异头氟化物的水解速度比其β端基异构体快，这与它们较高的基态能量一致。但是，基态能量不能解释3氟表观分子的相对自发反应性。人类Neu2的两个3-氟-唾液酸酶中间体的三维结构得到了解决，揭示了Arg21和赤道的但轴向氟之间没有关键的稳定作用。

  DOI：

  10.1002/anie.201309675
• 作为产物：
  描述：

  N-acetyl-4,7,8,9-tetra-O-acetyl-2-chloro-2-deoxyneuraminic acid methyl ester 在 盐酸 、 xenon fluoride 、 三氟化硼乙醚 、 sodium methylate 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 苯 为溶剂， 反应 14.17h， 生成 methyl 5-acetamido-3,5-dideoxy-3-fluoro-D-erythro-α-L-gluco-non-2-ulopyranosonate
  参考文献：
  名称：

  基于调节机制的神经氨酸酶灭活剂：机理和结构的见解。

  摘要：

  3-氟唾液酸氟是唾液酸酶的抑制剂，可通过形成长寿命的共价活性位点加合物而发挥作用，并且如果针对病原体唾液酸酶具有特异性，则具有治疗潜力。令人惊讶的是，人类Neu2和克氏锥虫唾液酸唾液酸酶在C3处具有赤道氟离子的失活比其轴向差向异构体更快地失活，并按照相同的模式进行重新激活。为了探索可能的立体电子基础，测量了四个3-氟唾液酰氟的全系列的自发水解的速率常数，并计算了每个的基态能量。α（赤道）异头氟化物的水解速度比其β端基异构体快，这与它们较高的基态能量一致。但是，基态能量不能解释3氟表观分子的相对自发反应性。人类Neu2的两个3-氟-唾液酸酶中间体的三维结构得到了解决，揭示了Arg21和赤道的但轴向氟之间没有关键的稳定作用。

  DOI：

  10.1002/anie.201309675

文献信息

• Synthetic study of 3-fluorinated sialic acid derivatives
  作者：Katsuhiko Suzuki、Shusaku Daikoku、Sang-Hyun Son、Yukishige Ito、Osamu Kanie

  DOI：10.1016/j.carres.2014.12.010

  日期：2015.4

  Sialic acid derivatives, analogs, and their conjugates are expected to be pharmaceutical candidates such as anti-influenza drugs and also useful probes for investigating the biological role of glycoconjugates. Derivatives of 3-fluorinated sialic acid (3-F-Sia) have been found to be excellent probes in investigating functions and mechanisms of a series of proteins. Here, we describe the syntheses of 3-F-Sia derivatives, which are useful in making biologically important conjugate probes. A practical method for the construction of 3-fluorinated sialosides based on the stereoselective formation of the corresponding anomeric O-trimethylsilyl ether and their nucleophilic attack by an alkyl halide, an allyl halide in particular, was developed. In addition, details of the synthesis of cytidine monophosphate (CMP)-3-F-Sia bearing a fluorescent tag, which has been proven to show dual functions as a substrate of CMP-sialic acid transporter (CST) and an inhibitor of sialyltransferase (STase), are described. (C) 2015 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• NAKAJIMA, TATSUO;HORI, HIROSHI;OHRUI, HIROSHI;MEGURO, HIROSHI;IDO, TATSUO, AGR. AND BIOL. CHEM., 52,(1988) N 5, 1209-1215
  作者：NAKAJIMA, TATSUO、HORI, HIROSHI、OHRUI, HIROSHI、MEGURO, HIROSHI、IDO, TATSUO

  DOI：——

  日期：——