N,N-dibenzyl-D-glutamic acid dibenzyl ester | 1237769-99-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N,N-dibenzyl-D-glutamic acid dibenzyl ester
• 英文别名: dibenzyl N,N-dibenzyl-L-glutamate；dibenzyl N,N-dibenzyl-D-glutamate；dibenzyl (2R)-2-(dibenzylamino)pentanedioate
• CAS: 1237769-99-1
• 化学式: C₃₃H₃₃NO₄
• 分子量: 507.629
• InChiKey: YYCQOYRNOSTTNL-WJOKGBTCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.4
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.21
• 拓扑面积：
  55.8
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N,N-dibenzyl-D-glutamic acid dibenzyl ester 在 二异丁基氢化铝 作用下， 以 四氢呋喃 、 正庚烷 、 二氯甲烷 、 水 、 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 1.25h， 生成 benzyl (S)-2-(dibenzylamino)-5-oxopentanoate
  参考文献：
  名称：

  基于机制的人类Sirtuin 5脱酰基酶的抑制剂：结构与活性的关系，生物结构和动力学的见解。

  摘要：

  sirtuin酶在各种生化环境中是重要的调节性去酰基化酶，因此可能通过小分子的激活或抑制而成为潜在的治疗靶标。在这里，我们描述了迄今为止报道的最有效的sirtuin 5（SIRT5）抑制剂的发现。通过解决与人类和斑马鱼SIRT5复杂的选定抑制剂的共晶体结构，我们提供了结合模式的合理化方法，这为进一步优化具有更多“类药物”性质的抑制剂提供了见识。重要的是，酶动力学评估显示出缓慢，紧密的抑制机制，这对于SIRT5而言是前所未有的。当将抑制剂应用于生物学探测机制时，这是重要的信息。

  DOI：

  10.1002/anie.201709050
• 作为产物：
  描述：

  D-谷氨酸 、 溴甲苯 在 potassium carbonate 、 sodium hydroxide 作用下， 以 水 为溶剂， 以60%的产率得到N,N-dibenzyl-D-glutamic acid dibenzyl ester
  参考文献：
  名称：

  特定三氟酮对 dd-Peptidases 的抑制作用：与 Actinomadura R39 dd-Peptidase 复合物的晶体结构

  摘要：

  细菌抑制剂DD -peptidases代表潜在的抗生素。在寻求替代β内酰胺类，我们已经调查了一系列设计成在与反应，以生成过渡态类似物的结构的化合物的DD -peptidases。该化合物包含肽聚糖模拟物特异性手柄和能够将四面体阴离子递送至酶活性位点的弹头的组合。后者包括一种硼酸、两种醇、一种醛和一种三氟酮。针对两种低分子量 C 类dd -肽酶测试了化合物。正如之前的观察所预期的那样，硼酸是一种有效的抑制剂，但出乎意料的是，三氟酮 [ d-α-aminopimelyl(1,1,1-trifluoro-3-amino)butan-2-one] 也非常有效。考虑到竞争的水合作用，我们发现trifluoroketone是最强的抑制剂马杜拉放线R39 DD 1-肽，具有亚纳摩尔（游离酮）抑制常数。三氟酮和 R39 酶之间的复合物的晶体结构表明，确实与活性位点丝氨酸亲核试剂形成了四面体加​​合物。的t

  DOI：

  10.1021/bi400048s

文献信息

• [EN] HETEROARYL(HETEROCYCLYL)METHANOL COMPOUNDS USEFUL IN THE TREATMENT OF HYPERGLYCAEMIA<br/>[FR] COMPOSÉS D'HÉTÉROARYL(HÉTÉROCYCLYL)MÉTHANOL UTILES DANS LE TRAITEMENT DE L'HYPERGLYCÉMIE
  申请人：ATROGI AB

  公开号：WO2020188299A1

  公开（公告）日：2020-09-24

  There is herein provided a compound of formula I (I) or a pharmaceutically acceptable salt thereof, wherein the ring comprising Q1 to Q5, R1, m, X1 and ring A have meanings as provided in the description.

  在此提供了一个式I（I）的化合物或其药用可接受的盐，其中包含Q1至Q5、R1、m、X1和环A的含义如描述中所提供。
• Crystal Structure of a Complex between the <i>Actinomadura</i> R39 <scp>dd</scp>-Peptidase and a Peptidoglycan-mimetic Boronate Inhibitor: Interpretation of a Transition State Analogue in Terms of Catalytic Mechanism
  作者：Liudmila Dzhekieva、Mathieu Rocaboy、Frédéric Kerff、Paulette Charlier、Eric Sauvage、R. F. Pratt

  DOI：10.1021/bi100757c

  日期：2010.8.3

  describes the synthesis of (d-α-aminopimelylamino)-d-1-ethylboronic acid, designed to be a peptidoglycan-mimetic transition state analogue inhibitor of the R39 dd-peptidase. The boronate was found to be a potent inhibitor of the peptidase with a Ki value of 32 ± 6 nM. Since it binds some 30 times more strongly than the analogous peptide substrate, the boronate may well be a transition state analogue. A crystal

  的马杜拉放线菌R39 DD 1-肽是一种细菌的低分子量C类青霉素结合蛋白。先前已经显示催化水解和小的氨解d -alanyl- d丙氨酸端接肽，尤其是那些具有一个侧链模仿阀杆肽前体的氨基末端到细菌细胞壁。本文描述的合成（d -α-aminopimelylamino） - d -1-乙基硼酸，设计为R39的肽聚糖模拟物的过渡态类似物抑制剂DD 1-肽。发现硼酸酯是具有K i的肽酶的有效抑制剂。值为32±6 nM。由于它的结合强度是类似肽底物的30倍，因此硼酸酯很可能是过渡态类似物。抑制性复合物的晶体结构显示出硼酸酯共价键合到亲核活性位点Ser49。氨基庚二烯侧链结合到先前鉴定为对该部分特异的位点。在氧阴离子孔中保持一种硼酸氧。另一个占据酰化的离去基团位点或去酰化的亲核基团位点，似乎与氢键合到Ser 298的羟基上。Ser49氧似乎与氢键合到Lys 52上。在催化过程中的结构确实类似于高能四面体中间体，Ser
• HETEROARYL(HETEROCYCLYL)METHANOL COMPOUNDS USEFUL IN THE TREATMENT OF HYPERGLYCAEMIA
  申请人：Atrogi AB

  公开号：EP3941913A1

  公开（公告）日：2022-01-26