(3S,6S,9R,12R,16S)-3-[(1R)-1-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxyethyl]-9,12-di(propan-2-yl)-16-[(E)-4-tritylsulfanylbut-1-enyl]-6-(tritylsulfanylmethyl)-1-oxa-4,7,10,13-tetrazacyclohexadecane-2,5,8,11,14-pentone | 620568-02-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 肽模拟物
• 英文名称: (3S,6S,9R,12R,16S)-3-[(1R)-1-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxyethyl]-9,12-di(propan-2-yl)-16-[(E)-4-tritylsulfanylbut-1-enyl]-6-(tritylsulfanylmethyl)-1-oxa-4,7,10,13-tetrazacyclohexadecane-2,5,8,11,14-pentone
• CAS: 620568-02-7
• 化学式: C₆₈H₈₂N₄O₇S₂Si
• 分子量: 1159.64
• InChiKey: JLIIXFBHDJXBFD-ABDMFJQJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  12.36
• 重原子数：
  82
• 可旋转键数：
  20
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  203
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (3S,6S,9R,12R,16S)-3-[(1R)-1-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxyethyl]-9,12-di(propan-2-yl)-16-[(E)-4-tritylsulfanylbut-1-enyl]-6-(tritylsulfanylmethyl)-1-oxa-4,7,10,13-tetrazacyclohexadecane-2,5,8,11,14-pentone 在 碘 、 氢氟酸 作用下， 以 甲醇 、 乙腈 为溶剂， 反应 1.17h， 以63%的产率得到FR-901375
  参考文献：
  名称：

  十肽FR-901375的全合成。

  摘要：

  已经实现了FR-901375的首次全合成，这是一种从绿假单胞菌第2522号发酵液中分离出的新型双环二肽。合成方法涉及13个反应步骤，总产率为12％。成功的合成策略中的关键点是关键结构单元（3R，4E）-3-羟基-7-巯基-4-庚烯酸的简明不对称合成，温和的Mitsunobu宏观内酯化步骤以及I（2）-介导的脱保护作用，同时形成二硫键。

  DOI：

  10.1021/jo034765b
• 作为产物：
  描述：

  三苯甲硫醇 在 lithium hydroxide 、 aluminium amalgam 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 三氟甲磺酸二丁硼 、 双氧水 、 (benzotriazo-1-yloxy)tris(dimethylamino)phosphonium hexafluorophosphate 、 对甲苯磺酸 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 、 乙腈 、 苯 为溶剂， 反应 23.0h， 生成 (3S,6S,9R,12R,16S)-3-[(1R)-1-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxyethyl]-9,12-di(propan-2-yl)-16-[(E)-4-tritylsulfanylbut-1-enyl]-6-(tritylsulfanylmethyl)-1-oxa-4,7,10,13-tetrazacyclohexadecane-2,5,8,11,14-pentone
  参考文献：
  名称：

  十肽FR-901375的全合成。

  摘要：

  已经实现了FR-901375的首次全合成，这是一种从绿假单胞菌第2522号发酵液中分离出的新型双环二肽。合成方法涉及13个反应步骤，总产率为12％。成功的合成策略中的关键点是关键结构单元（3R，4E）-3-羟基-7-巯基-4-庚烯酸的简明不对称合成，温和的Mitsunobu宏观内酯化步骤以及I（2）-介导的脱保护作用，同时形成二硫键。

  DOI：

  10.1021/jo034765b

文献信息

• Total Synthesis of the Depsipeptide FR901375 and Preliminary Evaluation of Its Biological Activity
  作者：Koichi Narita、Yuya Katoh、Ken-ichi Ojima、Singo Dan、Takao Yamori、Akihiro Ito、Minoru Yoshida、Tadashi Katoh

  DOI：10.1002/ejoc.201601023

  日期：2016.12

  The bicyclic depsipeptide FR901375 was efficiently synthesized in a highly convergent manner. The synthesis involved the condensation of a d-valine–d-valine–d-cysteine-containing segment with a (3S,4E)-3-hydroxy-7-mercapto-4-heptenoic acid–l-threonine-containing segment to directly assemble the corresponding seco-amino acid, followed by cyclization to construct the desired 16-membered macrocyclic ring

  双环缩肽 FR901375 以高度收敛的方式有效合成。该合成涉及将含有 d-缬氨酸-d-缬氨酸-d-半胱氨酸的片段与含有 (3S,4E)-3-羟基-7-巯基-4-庚烯酸-l-苏氨酸的片段直接缩合为组装相​​应的 seco-氨基酸，然后环化以构建所需的 16 元大环。合成的 FR901375 的效力在组蛋白脱乙酰酶 (HDAC) 抑制和细胞生长抑制试验中确定，并将结果与​​临床批准的缩酚肽 FK228（罗米地辛）的结果进行比较。发现 FR901375 对 I 类 HDAC 1 (GI50 = 1.7 nm) 比 II 类 HDAC 6 (GI50 = 1627 nm) 显示出极高的选择性（957 倍），并显示低纳摩尔区域的细胞生长抑制 GI50 值。此外，揭示了双环缩酚肽 HDAC 抑制剂的构效关系的新方面。