作者:Manas Seal、Orit Weil-Ktorza、Dragana Despotović、Dan S. Tawfik、Yaakov Levy、Norman Metanis、Liam M. Longo、Daniella Goldfarb
DOI:10.1021/jacs.2c03819
日期:2022.8.10
Peptide-RNA coacervates can result in the concentration and compartmentalization of simple biopolymers. Given their primordial relevance, peptide-RNA coacervates may have also been a key site of early protein evolution. However, the extent to which such coacervates might promote or suppress the exploration of novel peptide conformations is fundamentally unknown. To this end, we used electron paramagnetic
肽-RNA 凝聚层可导致简单生物聚合物的浓缩和区室化。鉴于它们的原始相关性,肽-RNA 凝聚层也可能是早期蛋白质进化的关键部位。然而,这种凝聚层可能促进或抑制新肽构象探索的程度基本上是未知的。为此,我们使用电子顺磁共振波谱 (EPR) 来表征一种古老且普遍存在的核酸结合元件螺旋-发夹-螺旋 (HhH) 基序的结构和动力学,该基序单独存在于 RNA 的情况下。它形成凝聚层。应用于含有一个 HhH 基序的单标记肽的双电子 - 电子共振 (DEER) 光谱揭示了二聚体的存在,即使在没有 RNA 的情况下也是如此。而且,RNA 结合后二聚体形成得到促进,并且在肽-RNA 凝聚层中可检测到。溶液中自旋稀释的双标记肽的 DEER 测量表明瞬时α-螺旋特征。二聚体中自旋标签之间的距离分布和α-螺旋折叠的特征与对称(HhH)一致2-折叠,它是在单个 HhH 基序的复制和融合时产生的,传统上与 dsDNA