肽-RNA 凝聚层可导致简单
生物聚合物的浓缩和区室化。鉴于它们的原始相关性,肽-RNA 凝聚层也可能是早期蛋白质进化的关键部位。然而,这种凝聚层可能促进或抑制新肽构象探索的程度基本上是未知的。为此,我们使用电子顺磁共振波谱 (EPR) 来表征一种古老且普遍存在的核酸结合元件螺旋-发夹-螺旋 (HhH) 基序的结构和动力学,该基序单独存在于 RNA 的情况下。它形成凝聚层。应用于含有一个 HhH 基序的单标记肽的双电子 - 电子共振 (DEER) 光谱揭示了二聚体的存在,即使在没有 RNA 的情况下也是如此。而且,RNA 结合后二聚体形成得到促进,并且在肽-RNA 凝聚层中可检测到。溶液中自旋稀释的双标记肽的 DEER 测量表明瞬时α-螺旋特征。二聚体中自旋标签之间的距离分布和α-螺旋折叠的特征与对称(HhH)一致2-折叠,它是在单个 HhH 基序的复制和融合时产生的,传统上与 dsDNA