(-)-1-<(1S,3R,4S)-3-hydroxy-4-(hydroxymethyl)cyclopentyl>-1H,3H-pyrimidine-2,4-dione | 120963-44-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 核苷和核苷酸类似物
• 英文名称: (-)-1-<(1S,3R,4S)-3-hydroxy-4-(hydroxymethyl)cyclopentyl>-1H,3H-pyrimidine-2,4-dione
• 英文别名: (+/-)-1-[(1α,3β,4α)-3-hydroxy-4-(hydroxymethyl)cyclopentyl]-2,4(1H,3H)-pyrimidinedione；1-[(1α,3β,4α)-3-hydroxy-4-(hydroxymethyl)cyclopentyl]-2,4(1H,3H)-pyrimidinedione；(-)-1-[(1S,3R,4S)-3-hydroxy-4-(hydroxymethyl)cyclopentyl]-1H,3H-pyrimidine-2,4-dione；1-[(1S,3R,4S)-3-hydroxy-4-(hydroxymethyl)cyclopentyl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 120963-44-2
• 化学式: C₁₀H₁₄N₂O₄
• 分子量: 226.232
• InChiKey: JIFXFEDXEKJYAE-BIIVOSGPSA-N

物化性质

• 熔点：
  145-147 °C
• 密度：
  1.433±0.06 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.7
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  89.9
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (-)-1-<(1S,3R,4S)-3-hydroxy-4-(hydroxymethyl)cyclopentyl>-1H,3H-pyrimidine-2,4-dione 在 palladium diacetate 氢氧化钾 、 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 碘 、 硝酸 、 potassium hydrogencarbonate 、 三乙胺 、 三苯基膦 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 水 为溶剂， 反应 4.58h， 生成 (-)-1-<(1S,3R,4S)-3-hydroxy-4-(hydroxymethyl)cyclopentyl>-5-<(E)-2-bromovinyl>-1H,3H-pyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  carba-5-iodo-2'-deoxyuridine和carba-（E）-5-（2-bromovinyl）-2'-deoxyuridine的对映体形式的合成和抗病毒活性。

  摘要：

  5-碘-2'-脱氧尿苷（14和ent-14）和（E）-5-（2-溴-乙烯基）-2'-脱氧尿苷（16和ent-16）的碳环类似物的两个对映体都是通过分别使用（+）-或（-）-endo-norborn-5-en-2-yl乙酸盐或丁酸作为原料合成。针对单纯疱疹病毒1型（+）-C-BVDU（16）的活性仅略低于BVDU本身，而（-）-C-BVDU（ent-16）的有效性低10-400倍，具体取决于在调查的菌株上。针对HSV-2，（+）-和（-）-C-BVDU以及（+）-和（-）-C-IDU均显示出较小的活​​性。所有碳环类似物对TK-HSV-1菌株均无活性，这表明病毒胸苷激酶（TK）进行磷酸化（激活）的必要条件。

  DOI：

  10.1021/jm00128a029
• 作为产物：
  描述：

  1-((1S,3R,4S)-3-Methoxymethoxy-4-methoxymethoxymethyl-cyclopentyl)-1H-pyrimidine-2,4-dione 在 对甲苯磺酸 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 1.0h， 以90%的产率得到(-)-1-<(1S,3R,4S)-3-hydroxy-4-(hydroxymethyl)cyclopentyl>-1H,3H-pyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  A new synthesis of (±)-carbocyclic 2′-deoxyuridines

  摘要：

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)84090-3

文献信息

• Synthesis and Antiviral Activity of the Carbocyclic Analogue of the Highly Potent and Selective Anti-VZV Bicyclo Furano Pyrimidines
  作者：Marco D. Migliore、Nicola Zonta、Christopher McGuigan、Geoffrey Henson、Graciela Andrei、Robert Snoeck、Jan Balzarini

  DOI：10.1021/jm070357e

  日期：2007.12.27

  chemically more stable than the furano lead, but it was shown to be significantly less antivirally active than its parent nucleoside analogue. It was noted to have a 10-fold lower inhibitory activity against the VZV-encoded thymidine kinase. This reduction of activity may be attributed to the different conformation of the sugar and base, as predicted by computational studies and supported by NMR studies

  碳环核苷类似物是分解代谢稳定的，因为它们对嘧啶核苷磷酸化酶的磷酸裂解具有抗性。以碳环2'-脱氧尿苷为起始原料，合成了高效，高选择性的VZV双环核苷类似物（BCNA）6-戊基苯基呋喃[2,3-d]嘧啶-2'-脱氧核糖的碳环类似物（C-BCNA）。 。发现C-BCNA在化学上比呋喃诺铅更稳定，但已证明其抗病毒活性远低于其母体核苷类似物。注意到对VZV编码的胸苷激酶的抑制活性降低了10倍。活性的这种降低可以归因于糖和碱的不同构象，如通过计算研究预测并得到NMR研究支持。然而，
• Carbocyclic analogs of 5-substituted uracil nucleosides. Synthesis and antiviral activity
  作者：Y. Fulmer Shealy、C. Allen O'Dell、William M. Shannon、Gussie Arnett

  DOI：10.1021/jm00356a008

  日期：1983.2

  Carbocyclic analogues of 3'-deoxyuridines, 3'-deoxyuridines, and uridines with substituents at position 5 of the uracil moiety were prepared by direct halogenation (5-bromo and 5-iodo groups) and by displacement of the 5-bromo group by amino and substituted-amino groups. The analogue of 5-(hydroxymethyl)uridine was prepared via reaction of the isopropylidene derivative of the uridine analogue with paraformaldehyde

  3'-脱氧尿苷，3'-脱氧尿苷和尿嘧啶在尿嘧啶部分第5位具有取代基的碳环类似物是通过直接卤化（5-溴和5-碘基）并通过氨基置换5-溴基制备的和取代的氨基。5-（羟甲基）尿苷的类似物是通过尿苷类似物的亚丙基衍生物与多聚甲醛反应制备的。胸苷和5-溴-，5-碘-和5-（甲基氨基）-2'-脱氧尿苷的碳环类似物在体外对1型和2型单纯疱疹病毒具有很高的活性。5-取代的相应类似物3'-脱氧尿苷和5-取代的尿苷在该测定中没有活性。
• Synthesis and Antiviral Activity of the Carbocyclic Analogues of (E)-5-(2-Halovinyl)-2'-deoxyuridines and (E)-5-(2-Halovinyl)-2'-deoxycytidines
  作者：Piet Herdewijn、Erik De Clercq、Jan Balzarini、Hubert Vanderhaeghe

  DOI：10.1021/jm50001a003

  日期：1985.5

  The carbocyclic analogues of the potent and selective antiherpes agents (E)-5-(2-bromovinyl)-2'-deoxyuridine (BVDU), (E)-5-(2-iodovinyl)-2'-deoxyuridine (IVDU), and (E)-5-(2-bromovinyl)-2'-deoxycytidine (BVDC) were synthesized by conventional methods with use of carbocyclic 2'-deoxyuridine as starting material. C-BVDU, C-IVDU, and C-BVDC were equally selective, albeit slightly less potent, in their

  有效和选择性抗疱疹药（E）-5-（2-溴乙烯基）-2'-脱氧尿苷（BVDU），（E）-5-（2-碘乙烯基）-2'-脱氧尿苷（IVDU）的碳环类似物， （E）-5-（2-溴乙烯基）-2′-脱氧胞苷（BVDC）是以碳环2′-脱氧尿苷为原料通过常规方法合成的。C-BVDU，C-IVDU和C-BVDC具有比BVDU，IVDU和BVDC更好的抗疱疹作用，尽管抗性略强。尽管可以抵抗嘧啶核苷磷酸化酶的降解，但在全身（口服，腹膜内）或局部治疗小鼠HSV-1感染中，C-BVDU并未比BVDU更有效。
• Synthesis and antiviral activity of the carbocyclic analogs of 5-ethyl-2'-deoxyuridine and of 5-ethynyl-2'-deoxyuridine
  作者：Y. Fulmer Shealy、C. Allen O'Dell、Gussie Arnett、William M. Shannon

  DOI：10.1021/jm00151a013

  日期：1986.1

  The carbocyclic analogue of the antiviral agent 5-ethyl-2'-deoxyuridine (EDU) was synthesized by two routes. The pivotal step in the first route is the reaction of lithium dimethylcuprate with the carbocyclic analogue of 5-(bromomethyl)-2'-deoxyuridine dibenzoate (6). The second route is based on the synthesis of the carbocyclic analogue of 5-ethynyl-2'-deoxyuridine (12) by a coupling reaction catalyzed

  抗病毒剂5-乙基-2'-脱氧尿苷（EDU）的碳环类似物通过两种途径合成。第一条途径的关键步骤是使二甲基二甲基碳酸锂与5-（溴甲基）-2'-脱氧尿苷二苯甲酸酯的碳环类似物反应（6）。第二种路线是基于双（三苯基膦）氯化钯（II）和碘化铜（I）催化的偶合反应合成5-乙炔基-2'-脱氧尿苷（12）的碳环类似物。 （Robins and Barr）合成真正的核苷5-乙炔基-2'-脱氧尿苷（1b）。EDU的碳环类似物抑制Vero细胞中1型和2型单纯疱疹病毒的复制。5-乙炔基-2'-脱氧尿苷的碳环类似物对1型和2型单纯疱疹病毒具有适度的活性。
• Carbocyclic analogs of cytosine nucleosides
  作者：Y. Fulmer Shealy、C. Allen O'Dell

  DOI：10.1002/jhet.5570170228

  日期：1980.3

  cytosine derivatives were frequently accompanied by small amounts of the corresponding N,N-dimethylcytosine derivatives, which could be removed by ion-exchange chromatography. Carbodine (VIa), the carbocyclic analog of cytidine, was obtained in 84% yield from the pure 4-chloropyrimidinone intermediate, after the latter was prepared by deoxychlorination in carbon tetrachloride. Carbodine has antileukemic

  由类似的尿嘧啶衍生物合成了胞苷，2'-脱氧胞苷和3'-脱氧胞苷的碳环类似物。该途径包括尿嘧啶衍生物的完全苯甲酰化，选择性除去连接在嘧啶环上的苯甲酰基，用二甲基甲酰胺-亚硫酰氯试剂将4-氧代转化为4-氯基以及用氯代氨酯取代氯基。甲醇氨中的氨基 当使用脱氧氯化反应的总产物时，所需的胞嘧啶衍生物常常伴随着少量的相应的N，N-二甲基胞嘧啶衍生物，可以通过离子交换色谱法除去。从纯的4-氯嘧啶酮中间体通过在四氯化碳中进行脱氧氯化制备后，以84％的收率获得了胞嘧啶核苷的类似物卡铂（VIa）。卡博定具有抗白血病，抗病毒和抗菌活性。