5-O-(tert-butyldiphenylsilyl)inosine | 119898-64-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 5-O-(tert-butyldiphenylsilyl)inosine
• 英文别名: 9-[(2R,3R,4S,5R)-5-[[tert-butyl(diphenyl)silyl]oxymethyl]-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]-1H-purin-6-one
• CAS: 119898-64-5
• 化学式: C₂₆H₃₀N₄O₅Si
• 分子量: 506.634
• InChiKey: GKGKIQZGIUHHJW-PTGPVQHPSA-N

物化性质

• 沸点：
  727.1±60.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.33±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.32
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  118
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-O-(tert-butyldiphenylsilyl)inosine 在 sodium periodate 、 ammonium biborate tetrahydrate 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.5h， 生成 7-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-N-trityl morpholinoinosine
  参考文献：
  名称：

  由未保护的核糖核苷合成柔性保护的吗啉代单体的改进方案。

  摘要：

  已经开发了一种廉价且大大改进的方案，使用氧化乙二醇裂解和还原胺化策略从未保护的核糖核苷以高总收率合成受保护的吗啉代单体。与先前的方法不同，本策略允许在稍后的阶段安装环外胺保护剂，从而避免使用昂贵的或市售的环外胺保护的核糖核苷作为起始原料。为了证明本发明方法在选择保护基上的灵活性，已在环外胺位置用几个具有不同解嵌段性质的此类基团保护了单体。

  DOI：

  10.1080/15257770.2012.724491
• 作为产物：
  描述：

  肌苷 、 叔丁基二苯基氯硅烷 在 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 16.0h， 以74.7%的产率得到5-O-(tert-butyldiphenylsilyl)inosine
  参考文献：
  名称：

  2'，3'-seconucleosides III的化学。嘌呤2'，3'-核糖核苷的合成与反应

  摘要：

  用高碘酸将5'-0保护的嘌呤核糖核苷氧化，得到二醛，用硼氢化钠还原后得到5'-0-保护的嘌呤-2'，3'-核糖核苷，将其转化为2'，3'-二-0-甲磺酰基衍生物。它们被转化为2'，3'-二取代-2'，3'-二脱氧衍生物，并且由于2'-0-甲磺酰基的反应性明显低于3'-0-甲磺酰基，因此在2 '或3'-positiorts被实现。作为后一种方法的例子，描述了3'-alnino-3'-deoxy-2'，3'-secoadenosine和3'-deoxy-2'，3'-secoinosine的合成。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)89829-x

文献信息

• MORPHOLINO-BASED ANTISENSE AGENT
  申请人：Sinha Surajit

  公开号：US20120296087A1

  公开（公告）日：2012-11-22

  Morpholino-based oligomers suitable as antisense agent comprising modifications of phosphorodiamidate backbone or modification with 5-substituted pyrimidines of morpholino compound that is soluble in culture medium and sufficient for cell penetration thereby eliminating the need for injecting into the cells. Monomers comprising the said oligomers and its method of manufacture, method of manufacture of the said oligomers and its dye, flurophore, drug, biomolecule conjugate wherein the said oligomers find different end use but not limited to regulation of gene expression, tissue culture with improved transfection efficiency and related studies on cellular transfection.

  基于Morpholino的寡聚体适用作为反义物质，包括对磷酸二胺酰基骨架的修饰或对Morpholino化合物进行5-取代嘧啶的修饰，该化合物在培养基中溶解并足以渗透细胞，从而消除了注射到细胞中的需要。包括上述寡聚体的单体及其制造方法，上述寡聚体及其染料、荧光素、药物、生物分子共轭物的制造方法，其中上述寡聚体具有不同的最终用途，但不限于调控基因表达，具有改善转染效率的组织培养以及有关细胞转染的相关研究。
• Facile Solid-Phase Synthesis of AICAR 5′-Monophosphate (ZMP) and Its 4-<i>N</i>-Alkyl Derivatives
  作者：Giorgia Oliviero、Stefano D'Errico、Nicola Borbone、Jussara Amato、Vincenzo Piccialli、Gennaro Piccialli、Luciano Mayol

  DOI：10.1002/ejoc.200901271

  日期：2010.3

  solid-phase synthesis of 5-amino-1-β-D-ribofuranosylimidazole-4-carboxamide-5'-monophosphate (ZMP), a biosynthetic precursor of purine nucleotides, as well as a small collection of its 4-N-alkyl derivatives. The very difficult, direct, chemical phosphorylation of 5-amino-1-β-D-ribofuranosylimidazole-4-carboxamide (AICAR) was circumvented by installing a suitable, fully protected, phosphate group on the

  我们在此报告了一种简便的固相合成 5-amino-1-β-D-ribofuranosylimidazole-4-carboxamide-5'-monophosphate (ZMP)，一种嘌呤核苷酸的生物合成前体，以及它的一小部分4-N-烷基衍生物。5-amino-1-β-D-ribofuranosylimidazole-4-carboxamide (AICAR) 非常困难、直接的化学磷酸化通过在 N-1-的 5'-位安装一个合适的、完全保护的磷酸基团来规避(2,4-二硝基苯基)-肌苷，在嘌呤降解之前通过 2',3'-位连接到固体支持物，导致 5-氨基-咪唑-4-甲酰胺部分。还报道了形成 ZMP 咪唑的合理反应机制。
• Total Synthesis of a Cyclic Adenosine 5′-Diphosphate Ribose Receptor Agonist
  作者：Joanna M. Swarbrick、Barry V. L. Potter

  DOI：10.1021/jo202319f

  日期：2012.5.4

  cyclic adenosine 5′-diphosphate ribose (cADPR) analogues are chemical biology tools that can probe the Ca2+ release mechanism and structure–activity relationships of this emerging potent second messenger. However, analogues with an intact “northern” ribose have been inaccessible due to the difficulty of generating the sensitive N1-ribosyl link. We report the first total synthesis of the membrane permeant

  稳定的环状腺苷 5'-二磷酸核糖 (cADPR) 类似物是化学生物学工具，可以探测这种新兴的强效第二信使的 Ca 2+释放机制和构效关系。然而，由于难以产生敏感的N 1-核糖基连接，因此无法获得具有完整“北”核糖的类似物。我们报告了膜渗透性、水解稳定的 cADPR 受体激动剂 8-Br- N 1-cIDPR 通过受保护的 8-溴肌苷的区域选择性和立体选择性N 1-核糖基化的首次全合成。
• Nucleic Acid Related Compounds. 105. Synthesis of 2‘,3‘-Didehydro-2‘,3‘-dideoxynucleosides from Ribonucleoside Cyclic 2‘,3‘-(Sulfates or Phosphates) or 2‘,3‘-Dimesylates via Reductive Elimination with Sodium Naphthalenide¹
  作者：Morris J. Robins、Elzbieta Lewandowska、Stanislaw F. Wnuk

  DOI：10.1021/jo981013m

  日期：1998.10.1

  gave the 2',3'-unsaturated nucleosides. Parallel treatment of adenosine cyclic 2',3'-phosphate gave the 2',3'-olefin. The adenine, hypoxanthine, and 2-amino-6-methoxypurine 2',3'-didehydro-2',3'-dideoxynucleosides were prepared efficiently (40-60% overall yields of crystalline, analytically pure products; 3-5 steps, some combined into one-flask procedures) by treatment of 5'-O-protected 2',3'-di-O-mesylribonucleosides

  用亚硫酰氟处理嘌呤核糖核苷导致形成环状2'，3'-亚硫酸酯。5'-羟基的乙酰化和Sharpless氧化（NaIO（4）/ RuCl（3））得到环状2'，3'-硫酸酯衍生物。用亚硫酰氯处理5'-O-甲硅烷基保护的核糖核苷，然后氧化，得到了环状2'，3'-硫酸盐的另一种途径。用萘钠（THF / -50℃）还原消除，得到2′，3′-不饱和核苷。腺苷环2'，3'-磷酸的平行处理得到2'，3'-烯烃。有效地制备了腺嘌呤，次黄嘌呤和2-氨基-6-甲氧基嘌呤2'，3'-二氢-2'，3'-二脱氧核苷（结晶，分析纯产品的总收率为40-60％； 3-5个步骤，通过将5'-O-保护的2'，3'-di-O-甲磺酰基核糖核苷用萘钠处理来将它们合并成一个烧瓶。反应是在环境温度或低于环境温度的条件下使用容易获得的试剂和标准实验室条件进行的。
• A solid-phase approach to the synthesis of N-1-alkyl analogues of cyclic inosine-diphosphate-ribose (cIDPR)
  作者：Giorgia Oliviero、Stefano D'Errico、Nicola Borbone、Jussara Amato、Vincenzo Piccialli、Michela Varra、Gennaro Piccialli、Luciano Mayol

  DOI：10.1016/j.tet.2010.01.013

  日期：2010.3

  We report here an efficient solid-phase synthesis of N-1-alkyl-substituted analogues of cyclic inosine-diphosphate-ribose (cIDPR), a mimic of cyclic ADP-ribose (cADPR). Our synthetic strategy makes use of a polystyrene support to which inosine was bonded through a 2',3'-acetal linkage. Insertion of a ea-hydroxy-polymethylene chain of variable length on N-1, followed by conversion into N-1-alkylinosine-bisphosphate derivatives and cyclization, allowed to obtain analogues of cIDPR of various ring size. The cyclization step was carried out both in solid-phase and in solution by pyrophosphate bond formation. The effect of the N-1-polymethylene chain length on the cyclization yields as well as the reaction conditions, which led to the solid-phase pyrophosphate bond formation, were thoroughly investigated. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.