GMP-morpholidate | 7390-53-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: GMP-morpholidate
• 英文别名: guanosine-5'-monophosphate morpholidate；[(2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-morpholin-4-ylphosphinic acid
• CAS: 7390-53-6
• 化学式: C₁₄H₂₁N₆O₈P
• 分子量: 432.33
• InChiKey: XOYIJFWXUQCONN-QYVSTXNMSA-N

物化性质

• 密度：
  2.13±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.2
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  194
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  GMP-morpholidate 在 吡啶 、 5-(乙硫基)-1H-四唑 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 、 三氟乙酸 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 (2S)-2-propylpentyl 2-(((((((2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9(6H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl)methoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)(2-aminoethoxy)phosphoryl)amino)propanoate
  参考文献：
  名称：

  共价催化位点抑制剂对致癌 K-Ras 的靶向治疗

  摘要：

  我们报告了 GDP 类似物 SML-8-73-1 和前药衍生物 SML-10-70-1 的合成，它们是 K-Ras G12C 突变体相对于野生型的选择性、直接作用共价抑制剂。键入 Ras。生化和生物物理测量表明，用 SML-8-73-1 修饰 K-Ras 会使蛋白质处于非活性状态。这些一流的共价 K-Ras 抑制剂表明，不可逆地靶向 K-Ras 鸟嘌呤核苷酸结合位点可能是抑制 Ras 信号传导的可行治疗策略。

  DOI：

  10.1002/anie.201307387
• 作为产物：
  描述：

  鸟苷酸 在 2,2'-二硫二吡啶 、 三苯基膦 作用下， 以 水 、 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 1.5h， 生成 GMP-morpholidate
  参考文献：
  名称：

  胺与磷酸咪唑啉化物活化的核苷的取代反应具有很大的空间效应。

  摘要：

  脂肪胺通过取代咪唑基团与鸟嘌呤和胞苷的磷酸咪唑并酯活化的衍生物反应（ImpN）。鸟苷5'-磷酸-2-甲基咪唑啉（2-MeImpG）与甘氨酸乙酯，甘氨酰胺，2-甲氧基乙胺，正丁胺，吗啉，二甲胺（Me2NH），乙基甲胺（EtNHMe），二乙胺（Et2NH）的反应动力学，吡咯烷和哌啶是在37°C的水中测定的。对于伯胺，质子化底物上胺被攻击的速率常数的对数log kSH（A）与胺的pKa的关系图与布朗斯台德斜率（βnuc = 0.48）具有良好的线性相关性。与相似的pKa的伯胺相比，测试的大多数仲胺的反应性略高。有趣的是 一些仲胺显示出比​​预期的低得多的反应性：EtNHMe反应约8倍，Et2NH反应至少100倍，比Me2NH慢，尽管所有这三种胺都具有相似的碱性。为了进行比较，用Me 2 NH，EtNHMe和Et 2 NH确定了鸟苷5'-磷酸咪唑啉（ImpG）和胞苷5'-磷酸咪唑啉（ImpC）的反

  DOI：

  10.1021/jo00108a027

文献信息

• Chemoenzymatic synthesis of l-galactosylated dimeric Sialyl Lewis X structures employing α-1,3-fucosyltransferase V
  作者：Arno Düffels、Luke G. Green、Roman Lenz、Steven V. Ley、Stephane P. Vincent、Chi-Huey Wong

  DOI：10.1016/s0968-0896(00)00187-5

  日期：2000.10

  L-Galactosylated dimeric sialyl Lewis X (SLeX) has been prepared employing a combination of chemical and enzymatic synthetic methods. GDP-L-galactose has been chemically synthesised. Enzymatic transfer of L-galactose onto the acceptor (Sia-alpha2,3-Gal-beta1,4-GlcNAc-beta1,3/6)2-Man-alpha1-OMe was achieved using the human alpha-1,3-fucosyltransferase V.

  L-半乳糖基化的二聚唾液酸路易斯X（SLeX）已采用化学和酶促合成方法的组合制备。GDP-L-半乳糖已化学合成。使用人alpha-1,3-岩藻糖基转移酶V将L-半乳糖酶转移到受体（Sia-alpha2,3-Gal-beta1,4-GlcNAc-beta1,3 / 6）2-Man-alpha1-OMe上。
• Chemoenzymatic Synthesis of C6-Modified Sugar Nucleotides To Probe the GDP-<scp>d</scp>-Mannose Dehydrogenase from <i>Pseudomonas aeruginosa</i>
  作者：Sanaz Ahmadipour、Giulia Pergolizzi、Martin Rejzek、Robert A. Field、Gavin J. Miller

  DOI：10.1021/acs.orglett.9b00967

  日期：2019.6.21

  for the GDP-d-ManA producing GDP-d-mannose dehydrogenase (GMD) from Pseudomonas aeruginosa. Using a common C6 aldehyde functionalization strategy, chemical synthesis introduces deuterium enrichment, alongside one-carbon homologation at C6 for a series of mannose 1-phosphates. These materials are shown to be substrates for the GDP-mannose pyrophosphorylase from Salmonella enterica, delivering the required

  描述了一系列C6-修饰的GDP- d -Man糖核苷酸的化学酶法合成。这提供了GDP-第一结构-功能工具d -ManA产生GDP- d甘露糖脱氢酶（GMD）从绿脓杆菌。使用常见的C6醛官能化策略，化学合成引入了氘富集，以及一系列六价甘露糖1-磷酸在C6处的一碳同系物。这些材料被证明是肠炎沙门氏菌的GDP-甘露糖焦磷酸化酶的底物，可提供所需的改良GDP- d- Mans工具箱。C6-CH 3修饰的糖核苷酸能够可逆地阻止GMD生产GDP-ManA。通过高分辨率质谱法鉴定了由C6-CH 3修饰的类似物氧化产生的酮产物。
• Chemical synthesis of GDP-fucose analogs and their utilization by the Lewis *A(1 → 4) fucosyltransferase
  作者：Uday B. Gokhale、Ole Hindsgaul、Monica M. Palcic

  DOI：10.1139/v90-165

  日期：1990.7.1

  Chemical syntheses are reported for GDP-fucose (5), GDP-3-deoxy-fucose (6), and GDP-arabinose (7), the demethyl analog of 5. All three sugar nucleotides were found to act as donor substrates for an α(1 → 4) fucosyltransferase isolated from human milk when *BDGal(1 → 3)*BDGlcNAc-O(CH₂)₈COOMe (1) was used as the acceptor. The rate of transfer of sugar residues to 1 was measured using a coupled spectrophotometric assay and was found to be 100% (5), 2.3% (6), and 5.9% (7). The product Le^a-active oligosaccharide analogs were identified by both an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and by ¹H NMR spectroscopy. Keywords: glycosyltransferase, oligosaccharide synthesis, sugar-nucleotide analog, ELISA assay, fucosyltransferase.

  报道了GDP-岩藻糖（5）、GDP-3-去氧岩藻糖（6）和GDP-阿拉伯糖（7）的化学合成，其中7是5的去甲基类似物。当以*BDGal(1 → 3)*BDGlcNAc-O(CH₂)₈COOMe (1)作为受体时，发现这三种糖核苷酸都能作为人乳中分离的α(1 → 4)岩藻糖基转移酶的供体底物。使用耦合分光光度法测量糖残基转移速率，发现对1的转移率分别为100%（5）、2.3%（6）和5.9%（7）。通过酶联免疫吸附试验（ELISA）和¹H NMR光谱法鉴定了产物Le^a-活性寡糖类似物。关键词：糖基转移酶、寡糖合成、糖核苷酸类似物、ELISA检测、岩藻糖基转移酶。
• Large-scale synthesis of β-l-fucopyranosyl phosphate and the preparation of GDP-β-l-fucose
  作者：Kim Adelhorst、George M. Whitesides

  DOI：10.1016/0008-6215(93)80022-7

  日期：1993.4

  Abstract A practical 15-mmol large-scale synthesis of β- l -fucopyranosyl dicyclohexylammonium phosphate from l -fucose in 63% overall yield was developed. The synthesis took advantage of a neighboring Bz-2 group participating in a Koenigs-Knorr-like glycosylation. The sugar phosphate was transformed into the activated sugar nucleoside, guanosine diphosphate β- l -fucopyranose, on a gram scale.

  摘要开发了一种实用的由L-岩藻糖以15％的大规模收率合成15-mmol-β-岩藻糖基二环己基磷酸铵的化合物。该合成利用了参与Koenigs-Knorr样糖基化的相邻Bz-2基团的优势。以克为单位，将糖磷酸酯转化成活化的糖核苷，鸟苷二磷酸β-1-呋喃葡萄糖。
• FRET-Based Direct and Continuous Monitoring of Human Fucosyltransferases Activity: An Efficient synthesis of Versatile GDP-L-Fucose Derivatives from Abundantd-Galactose
  作者：Takahiro Maeda、Shin-Ichiro Nishimura

  DOI：10.1002/chem.200700760

  日期：2008.1.7

  acceptor substrate, sialyl-alpha2,3-LacNAc derivative (2) allowed us to carry out highly sensitive, direct, and continuous in vitro monitoring of the generation of sialyl Lewis X (SLe x), which is catalyzed by human alpha-1,3-fucosyltransferase VI (FUT-VI). A kinetic analysis revealed that compound 1 was an excellent donor substrate (KM=0.94 microM and Vmax=0.14 microM min(-1)) for detecting human FUT-VI

  我们已经开发了一种简便且通用的协议，用于通过使用荧光能量共振转移（FRET）连续监测人岩藻糖基转移酶的活性，并探索了其在抑制剂筛选测定中的可行性。具有荧光探针的便捷糖核苷酸6-脱氧-6-N-（2-萘-2-基乙酰胺）-β-L-吡喃半乳糖-1-基鸟苷5'-二磷酸二钠盐（1），由天然丰富的D-吡喃半乳糖通过关键中间体6-叠氮化物-1,2,3,4-四-O-苯甲酰基-6-脱氧-β-L-吡喃半乳糖有效地合成（10）。结果表明，糖基供体1和丹磺化受体底物唾液酸-α2,3-LacNAc衍生物（2）的联合使用使我们能够对唾液酸化路易斯的产生进行高度敏感，直接和连续的体外监测X（SLe x），它由人α-1,3-岩藻糖基转移酶VI（FUT-VI）催化。动力学分析表明，化合物1是检测人FUT-VI活性的优良供体底物（KM = 0.94 microM和Vmax = 0.14 microM min（-1））。据我们所