(+)-endo-β-bergamotene | 15438-93-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 异戊烯醇脂质
• 英文名称: (+)-endo-β-bergamotene
• 英文别名: trans-β-bergamotene；α-bergamotene；β-bergamotene；(+)-β-cis-Bergamoten；β-Bergamoten；(+)-Endo-beta-bergamotene；(1S,5S,6S)-6-methyl-2-methylidene-6-(4-methylpent-3-enyl)bicyclo[3.1.1]heptane
• CAS: 15438-93-4
• 化学式: C₁₅H₂₄
• 分子量: 204.356
• InChiKey: DGZBGCMPRYFWFF-KKUMJFAQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.1
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.73
• 拓扑面积：
  0
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  farnesyl pyrophosphate 在 santalene synthase from Santalumspicatum 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 12.0h， 生成 (+)-endo-β-bergamotene
  参考文献：
  名称：

  基于机理的萜烯合酶翻译后修饰和失活

  摘要：

  萜烯是无所不在的天然化学物质，具有跨越生命所有三个领域的多种生物学功能。在专门的代谢中，萜烯合酶（TPSs）的活性位点在形状和反应性方面不断发展，以指导多种化学型的生物合成，以实现机体适应性。由于大多数萜烯的生物合成机制涉及高反应性的碳阳离子中间体，因此催化这些级联反应的蛋白质表面具有反应区域，可能易于过早地捕获碳阳离子并可能使酶失活。在这里，我们使用蛋白质组学和X射线晶体学分析表明，阳离子中间体通过保守的活性位点残基捕获，从而导致抑制性自我烷基化。而且，阳离子介导的失活水平随着活性位点的突变而增加，会改变类异戊二烯二磷酸酯底物的大小和结构，同时会增加反应温度。与具有相对较高的产物特异性的TPS相比，单独合成多种产物的TPS较不容易自烷基化。总体而言，提出的结果表明，基于机理的烷基化代表了阳离子衍生的萜烯生物合成过程中被忽略的机械压力。

  DOI：

  10.1021/acschembio.5b00539

文献信息

• A Novel Pathway for Sesquiterpene Biosynthesis from<i>Z,Z</i>-Farnesyl Pyrophosphate in the Wild Tomato<i>Solanum habrochaites</i> 
  作者：Christophe Sallaud、Denis Rontein、Sandrine Onillon、Françoise Jabès、Philippe Duffé、Cécile Giacalone、Samuel Thoraval、Camille Escoffier、Gaëtan Herbette、Nathalie Leonhardt、Mathilde Causse、Alain Tissier

  DOI：10.1105/tpc.107.057885

  日期：2009.3.3

  In the wild tomato Solanum habrochaites, the Sst2 locus on chromosome 8 is responsible for the biosynthesis of several class II sesquiterpene olefins by glandular trichomes. Analysis of a trichome-specific EST collection from S. habrochaites revealed two candidate genes for the synthesis of Sst2-associated sesquiterpenes. zFPS encodes a protein with homology to Z-isoprenyl pyrophosphate synthases and SBS (for Santalene and Bergamotene Synthase) encodes a terpene synthase with homology to kaurene synthases. Both genes were found to cosegregate with the Sst2 locus. Recombinant zFPS protein catalyzed the synthesis of Z,Z-FPP from isopentenylpyrophosphate (IPP) and dimethylallylpyrophosphate (DMAPP), while coincubation of zFPS and SBS with the same substrates yielded a mixture of olefins identical to the Sst2-associated sesquiterpenes, including (+)-α-santalene, (+)-endo-β-bergamotene, and (−)-endo-α-bergamotene. In addition, headspace analysis of tobacco (Nicotiana sylvestris) plants expressing zFPS and SBS in glandular trichomes afforded the same mix of sesquiterpenes. Each of these proteins contains a putative plastid targeting sequence that mediates transport of a fused green fluorescent protein to the chloroplasts, suggesting that the biosynthesis of these sesquiterpenes uses IPP and DMAPP from the plastidic DXP pathway. These results provide novel insights into sesquiterpene biosynthesis and have general implications concerning sesquiterpene engineering in plants.

  在野生番茄Solanum habrochaites中，第8号染色体上的Sst2基因座负责腺毛中多种II类倍半萜烯烃的生物合成。从S. habrochaites的腺毛特异性EST集合中分析发现，有两个候选基因可以合成Sst2相关的倍半萜烯烃。zFPS编码一个与Z-异戊二烯基焦磷酸合成酶同源的蛋白质，而SBS（Santalene和Bergamotene Synthase）编码一个与矮秆素合成酶同源的萜烯合成酶。这两个基因被发现与Sst2基因座共同分离。重组zFPS蛋白质催化从异戊基焦磷酸酯（IPP）和二甲基烯丙基焦磷酸酯（DMAPP）合成Z,Z-FPP，而将zFPS和SBS与相同底物共同孵育则产生与Sst2相关的倍半萜烯烃相同的烯烃混合物，包括（+）-α-矢车菊烯、（+）-内-β-佛手柑烯和（-）-内-α-佛手柑烯。此外，表达zFPS和SBS的腺毛中的烟草（Nicotiana sylvestris）植物的空气中也产生了相同的倍半萜烯烃混合物。这些蛋白质中的每一个都包含一个推测的质体定位序列，该序列介导了融合绿色荧光蛋白到叶绿体的转运，表明这些倍半萜烯烃的生物合成使用来自质体DXP途径的IPP和DMAPP。这些结果为倍半萜烯烃的生物合成提供了新的见解，并具有关于植物倍半萜烯烃工程的普遍意义。

• Syntheses of the (-)-.alpha.-and (+)-.beta.-cis-bergamotenes
  作者：Thomas W. Gibson、William F. Erman

  DOI：10.1021/ja01045a032

  日期：1969.8
• Identification of .alpha.-santalenoic and endo-.beta.-bergamotenoic acids as moth oviposition stimulants from wild tomato leaves
  作者：Robert M. Coates、Jon F. Denissen、John A. Juvik、Barbara A. Babka

  DOI：10.1021/jo00245a012

  日期：1988.5
• COATES, ROBERT M.;DENISSEN, JON F.;JUVIK, JOHN A.;BABKA, BARBARA A., J. ORG. CHEM., 53,(1988) N 10, 2186-2192
  作者：COATES, ROBERT M.、DENISSEN, JON F.、JUVIK, JOHN A.、BABKA, BARBARA A.

  DOI：——

  日期：——
• Mechanism-Based Post-Translational Modification and Inactivation in Terpene Synthases
  作者：Roland D. Kersten、Jolene K. Diedrich、John R. Yates、Joseph P. Noel

  DOI：10.1021/acschembio.5b00539

  日期：2015.11.20

  Terpenes are ubiquitous natural chemicals with diverse biological functions spanning all three domains of life. In specialized metabolism, the active sites of terpene synthases (TPSs) evolve in shape and reactivity to direct the biosynthesis of a myriad of chemotypes for organismal fitness. As most terpene biosynthesis mechanistically involves highly reactive carbocationic intermediates, the protein

  萜烯是无所不在的天然化学物质，具有跨越生命所有三个领域的多种生物学功能。在专门的代谢中，萜烯合酶（TPSs）的活性位点在形状和反应性方面不断发展，以指导多种化学型的生物合成，以实现机体适应性。由于大多数萜烯的生物合成机制涉及高反应性的碳阳离子中间体，因此催化这些级联反应的蛋白质表面具有反应区域，可能易于过早地捕获碳阳离子并可能使酶失活。在这里，我们使用蛋白质组学和X射线晶体学分析表明，阳离子中间体通过保守的活性位点残基捕获，从而导致抑制性自我烷基化。而且，阳离子介导的失活水平随着活性位点的突变而增加，会改变类异戊二烯二磷酸酯底物的大小和结构，同时会增加反应温度。与具有相对较高的产物特异性的TPS相比，单独合成多种产物的TPS较不容易自烷基化。总体而言，提出的结果表明，基于机理的烷基化代表了阳离子衍生的萜烯生物合成过程中被忽略的机械压力。