将 Hoechst 33258 荧光团连接到平行链 DNA 三链体的聚嘧啶第三链的 5'-末端会导致复合物的 Tm 值增加,该值随溶液的 pH 值和目标 DNA 的序列而变化。这些 pH/序列效应可能与 M+-GC 碱基三联体的存在有关,这可能导致涉及碱基三联体和配体带电哌嗪环的电荷-电荷效应或小沟结合位点性质的变化由于引入 N2-环外氨基而产生。与 DNA 双链体一样,富含 AT 碱基对的序列靶标在利用这种配体诱导的稳定性方面最为有效。与三螺旋相邻的富含 AT 碱基对的双链序列似乎也允许相邻的配体结合;那是,三链体通过与三链体位点相邻的富含 AT 的双链体中拴系的小沟配体的结合而稳定。Hoechst 配体可以非常有效地...
DNA Triplex Stabilization Using a Tethered Minor Groove Binding Hoechst 33258 Analogue
作者:Jordi Robles、Larry W. McLaughlin
DOI:10.1021/ja963694d
日期:1997.7.1
Tethering the Hoechst33258 fluorophore to the 5‘-terminus of the polypyrimidine third strand of parallel-strandedDNAtriplexesresults in complexes with increased Tm values that vary with both the pH of the solution and the sequence of the target DNA. These pH/sequence effects are likely related to the presence of M+-G-C base triplets, which can result in either charge−charge effects involving the
将 Hoechst 33258 荧光团连接到平行链 DNA 三链体的聚嘧啶第三链的 5'-末端会导致复合物的 Tm 值增加,该值随溶液的 pH 值和目标 DNA 的序列而变化。这些 pH/序列效应可能与 M+-GC 碱基三联体的存在有关,这可能导致涉及碱基三联体和配体带电哌嗪环的电荷-电荷效应或小沟结合位点性质的变化由于引入 N2-环外氨基而产生。与 DNA 双链体一样,富含 AT 碱基对的序列靶标在利用这种配体诱导的稳定性方面最为有效。与三螺旋相邻的富含 AT 碱基对的双链序列似乎也允许相邻的配体结合;那是,三链体通过与三链体位点相邻的富含 AT 的双链体中拴系的小沟配体的结合而稳定。Hoechst 配体可以非常有效地...