6-N-tert-butoxycarbonyl-2',3'-O-isopropylidene-5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)adenosine | 913823-87-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 6-N-tert-butoxycarbonyl-2',3'-O-isopropylidene-5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)adenosine
• 英文别名: tert-butyl N-[9-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]purin-6-yl]carbamate
• CAS: 913823-87-7
• 化学式: C₂₄H₃₉N₅O₆Si
• 分子量: 521.689
• InChiKey: CBSJRIRNDOMMTH-WVSUBDOOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.61
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.75
• 拓扑面积：
  119
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-N-tert-butoxycarbonyl-2',3'-O-isopropylidene-5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)adenosine 在 四丁基氟化铵 、 sodium hydride 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙二醇二甲醚 、 mineral oil 为溶剂， 反应 12.67h， 生成 N⁶-tert-butoxycarbonyl-2',3'-O-isopropylidene-5'-O-(sulfamoyl)adenosine
  参考文献：
  名称：

  通过腺苷酸化结构域的亲和探针特异性富集非核糖体肽合成酶模块

  摘要：

  我们针对腺苷酸化（A）域的亲和力探针的开发目标，该亲和力探针可促进非核糖体肽合成酶（NRPS）-聚酮化合物合酶（PKS）杂种和NRPSs中含有A域的模块的富集，鉴定和定量。已经报道了单磷酸腺苷（AMP）的5'- O-氨磺酰腺苷（AMS）不可水解类似物作为支架的支架，用于设计表现出腺苷酸化酶紧密结合的抑制剂。在这里，我们描述了针对A域的亲和探针的应用。我们的合成探针，一种生物素化的I -Phe-AMS（I -Phe-AMS-生物素）专门针对NRPS模块中的A结构域，从而激活I -Phe-AMS。-在重组NRPS酶系统和整个蛋白质组中均转化为氨基酰基腺苷酸中间体。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2013.12.082
• 作为产物：
  描述：

  2',3'-异丙叉腺苷 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 sodium hydride 作用下， 以 四氢呋喃 、 mineral oil 为溶剂， 反应 17.0h， 生成 6-N-tert-butoxycarbonyl-2',3'-O-isopropylidene-5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)adenosine
  参考文献：
  名称：

  通过腺苷酸化结构域的亲和探针特异性富集非核糖体肽合成酶模块

  摘要：

  我们针对腺苷酸化（A）域的亲和力探针的开发目标，该亲和力探针可促进非核糖体肽合成酶（NRPS）-聚酮化合物合酶（PKS）杂种和NRPSs中含有A域的模块的富集，鉴定和定量。已经报道了单磷酸腺苷（AMP）的5'- O-氨磺酰腺苷（AMS）不可水解类似物作为支架的支架，用于设计表现出腺苷酸化酶紧密结合的抑制剂。在这里，我们描述了针对A域的亲和探针的应用。我们的合成探针，一种生物素化的I -Phe-AMS（I -Phe-AMS-生物素）专门针对NRPS模块中的A结构域，从而激活I -Phe-AMS。-在重组NRPS酶系统和整个蛋白质组中均转化为氨基酰基腺苷酸中间体。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2013.12.082

文献信息

• Antibacterial Agents
  申请人：Aldrich Courtney

  公开号：US20080293666A1

  公开（公告）日：2008-11-27

  The invention provides compounds of formula (I) and salts thereof: R 1 -L-R 2 —B wherein R 1 , L, R 2 , and B have any of the values defined herein, as well as compositions comprising such compounds, and therapeutic methods comprising the administration of such compounds or salts. The compounds block siderophore production in bacteria and are useful as antibacterial agents.

  这项发明提供了化合物的公式(I)及其盐：R1-L-R2—B，其中R1、L、R2和B具有本文中定义的任何值，以及包含这种化合物的组合物，以及包含这种化合物或盐的治疗方法。这些化合物可以阻断细菌中的铁载体产生，并可用作抗菌剂。
• Exploiting Ligand Conformation in Selective Inhibition of Non-Ribosomal Peptide Synthetase Amino Acid Adenylation with Designed Macrocyclic Small Molecules
  作者：Justin S. Cisar、Julian A. Ferreras、Rajesh K. Soni、Luis E. N. Quadri、Derek S. Tan

  DOI：10.1021/ja0721521

  日期：2007.6.1

  or three-carbon linker between Cβ of the amino acid moiety and C8 of the adenine ring and a sulfamate in place of the phosphate group. These compounds are potent inhibitors of the cysteine adenylation domain activity of the yersiniabactin siderophore synthetase HMWP2 and, unlike the corresponding linear aminoacyl-AMP analogs, do not inhibit protein translation in vitro. Selective small molecule inhibitors

  已开发出大环氨酰基-AMP 类似物，通过模拟晶体结构中观察到的 cisoid 配体结合构象，选择性地抑制非核糖体肽合成酶氨基酸腺苷酸化结构域。相比之下，这些大环化合物不抑制氨酰-tRNA 合成酶，它们在机制上密切相关，但以不同的转体构象结合它们的配体。大环在氨基酸部分的 Cβ 和腺嘌呤环的 C8 之间包含一个两碳或三碳连接器，以及一个氨基磺酸盐代替磷酸基团。这些化合物是耶尔森菌素铁载体合成酶 HMWP2 的半胱氨酸腺苷酸化结构域活性的有效抑制剂，并且与相应的线性氨酰基-AMP 类似物不同，它们不抑制体外蛋白质翻译。
• Efficient Synthesis of Exo-<i>N</i>-carbamoyl Nucleosides: Application to the Synthesis of Phosphoramidate Prodrugs
  作者：Jong Hyun Cho、Steven J. Coats、Raymond F. Schinazi

  DOI：10.1021/ol300777p

  日期：2012.5.18

  efficient protection protocol for the 6-exo-amino group of purine nucleosides with various chloroformates was developed utilizing N-methylimidazole (NMI). The reaction of an exo-N6-group of adenosine analogue 1 with alkyl/and aryl chloroformates under optimized conditions provided the N6-carbamoyl adenosines (2a–j) in good to excellent yields. The reaction of N6-Cbz-protected nucleosides (5a–c) with

  利用N-甲基咪唑 (NMI)开发了一种使用各种氯甲酸酯对嘌呤核苷的 6-外-氨基基团的有效保护方案。腺苷类似物1的外型- N 6 -基团与氯甲酸烷基酯/和芳基氯甲酸酯在优化条件下的反应提供了N 6 -氨基甲酰基腺苷 ( 2a – j ) 的良好收率。的反应Ñ 6 -Cbz保护的核苷（5A - ç用苯基磷酰氯（）7）使用吨-BuMgCl 然后催化氢化以优异的产率提供相应的氨基磷酸酯前核苷酸（8a - c）。
• Chemical Proteomics Approach for Profiling the NAD Interactome
  作者：Justina Šileikytė、Sunil Sundalam、Larry L. David、Michael S. Cohen

  DOI：10.1021/jacs.1c01302

  日期：2021.5.12

  discovering NAD-binding proteins do not exist. Here, we describe the design, synthesis, and validation of clickable, photoaffinity labeling (PAL) probes, 2- and 6-ad-BAD, for interrogating the NAD interactome. We found that 2-ad-BAD efficiently labels PARPs in a UV-dependent manner. Chemical proteomics experiments with 2- and 6-ad-BAD identified known and unknown NAD+/NADH-binding proteins. Together, our study

  烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD +）是一种多功能分子。除了氧化还原代谢之外，NAD +作为翻译后修饰酶的底物也具有同样重要的功能，最大的家族是聚 ADP 核糖聚合酶（PARP，人类有 17 个家族成员）。最近令人惊讶的发现非经典 NAD（NAD +/NADH) 结合蛋白表明 NAD 相互作用组可能比之前想象的要大；然而，用于分析和发现 NAD 结合蛋白的广泛有用的化学工具还不存在。在这里，我们描述了用于询问 NAD 相互作用组的可点击光亲和标记 (PAL) 探针 2- 和 6-ad-BAD 的设计、合成和验证。我们发现 2-ad-BAD 以依赖于 UV 的方式有效地标记 PARP。使用 2- 和 6-ad-BAD 进行的化学蛋白质组学实验鉴定了已知和未知的 NAD + /NADH 结合蛋白。总之，我们的研究展示了 2-ad-BAD 和 6-ad-BAD 作为可点击 PAL NAD 探针的实用性。
• [EN] COMPOUNDS FOR USE IN PREVENTION AND TREATMENT OF NEURODEGENERATIVE DISEASES AND PAIN<br/>[FR] COMPOSÉS DESTINÉS À ÊTRE UTILISÉS DANS LA PRÉVENTION ET LE TRAITEMENT DE MALADIES NEURODÉGÉNÉRATIVES ET DE LA DOULEUR
  申请人：ACADEMIA SINICA

  公开号：WO2015061426A1

  公开（公告）日：2015-04-30

  Compounds for use in prevention and treatment of neurodegenerative disease and pain are disclosed. In one embodiment of the invention, the compound is selected from the group consisting of N6-[(3-halothien-2-yl)methyl]adenosine, N6-[(4-halothien-2-yl)methyl]adenosine, and N6-[(5-halothien-2-yl)methyl]adenosine. In another embodiment of the invention, the compound is selected from the group consisting of N6-[(2-bromothien-3-yl)methyl]adenosine, N6-[(4-bromothien-3-yl)methyl]adenosine, N6-[(5-bromothien-3-yl)methyl]adenosine N6-[(2-chlorothien-3-yl)methyl]adenosine, N6-[(4-chlorothien-3-yl)methyl]adenosine, and N6-[(5-chlorothien-3-yl)methyl]adenosine. Also disclosed are methods of making and using the same.

  揭示了用于预防和治疗神经退行性疾病和疼痛的化合物。在发明的一个实施例中，该化合物被选择自N6-[(3-卤噻吩-2-基)甲基]腺苷、N6-[(4-卤噻吩-2-基)甲基]腺苷和N6-[(5-卤噻吩-2-基)甲基]腺苷所组成的组中。在发明的另一个实施例中，该化合物被选择自N6-[(2-溴噻吩-3-基)甲基]腺苷、N6-[(4-溴噻吩-3-基)甲基]腺苷、N6-[(5-溴噻吩-3-基)甲基]腺苷、N6-[(2-氯噻吩-3-基)甲基]腺苷、N6-[(4-氯噻吩-3-基)甲基]腺苷和N6-[(5-氯噻吩-3-基)甲基]腺苷所组成的组中。还公开了制备和使用这些化合物的方法。