(S)-tert-butyl (1-(benzylamino)-3-(1H-indol-3-yl)-1-oxopropan-2-yl)carbamate | 159098-71-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: (S)-tert-butyl (1-(benzylamino)-3-(1H-indol-3-yl)-1-oxopropan-2-yl)carbamate
• 英文别名: tert-butyl N-[(2S)-1-(benzylamino)-3-(1H-indol-3-yl)-1-oxopropan-2-yl]carbamate
• CAS: 159098-71-2
• 化学式: C₂₃H₂₇N₃O₃
• mdl: MFCD00824870
• 分子量: 393.486
• InChiKey: MEORLZZTUYTLFM-FQEVSTJZSA-N

物化性质

• 沸点：
  672.3±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.193±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.7
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  83.2
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (S)-tert-butyl (1-(benzylamino)-3-(1H-indol-3-yl)-1-oxopropan-2-yl)carbamate 在 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 (S)-2-amino-N-benzyl-3-(1H-indole-3-yl)propanamide
  参考文献：
  名称：

  脂质体腔内反应性的调节促进肽键的形成

  摘要：

  在活细胞中，反应发生在膜结合区室中，通常是对环境变化的反应。了解这种区室化如何影响反应将有助于我们在分子水平上获得对生物体的最佳理解，同时，将提供关于简单区室化系统行为的重要线索，例如细胞的益生元前体和细胞- 受启发的人工系统。在这项工作中，我们表明被困在脂质体腔中的反应性构建块（一种活化的氨基酸衍生物）受到保护免于水解，并与另一种具有膜渗透性且在溶液中游离的构建块几乎定量地反应，以形成二肽。相比之下，当在脂质体外发现活化的氨基酸时，水解是普遍的反应，表明脂质体的空腔促进了肽键的形成。从膜不可渗透分子的角度来看，我们将此结果归因于小隔室中的大脂质浓度。基于这一结果，我们展示了如何将反应结果预测为隔室大小的函数。考虑了这些结果对细胞隔室中生物分子行为、非生物发生和人工细胞启发系统设计的影响。

  DOI：

  10.1021/jacs.5b06207
• 作为产物：
  描述：

  L-色氨酸 在 O-(benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium tetrafluoroborate 、 三乙胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 4.5h， 生成 (S)-tert-butyl (1-(benzylamino)-3-(1H-indol-3-yl)-1-oxopropan-2-yl)carbamate
  参考文献：
  名称：

  具有吲哚帽作为新型组蛋白脱乙酰基酶抑制剂的N1-羟基对苯二甲酰胺衍生物的设计，合成和初步生物活性评估。

  摘要：

  组蛋白脱乙酰基酶抑制剂（HDACIs）已被广泛认为是治疗癌症的重要方法。在我们努力开发新型组蛋白脱乙酰基酶抑制剂（HDACIs）作为潜在的抗癌药的过程中，设计并合成了一系列带有吲哚帽基团的N1-羟基对苯二甲酰胺衍生物。化合物12m被确定为最有效的化合物（针对Hela核提取物的IC50 =0.074μM），并显示出比阳性对照SAHA（IC50 =0.131μM）更高的抑制活性，这也通过进一步的分子对接研究验证了该化合物的活性位点。 HDAC2。抑制HDAC的选择性结果显示12m具有与PXD101相当的总体同工型选择性分布。另外，根据初步肿瘤细胞筛选的结果，具有代表性的化合物在下一个抗增殖活性试验中显示出比SAHA更有效或可比的功效。总的来说，结果鼓励该化学模板的进一步开发以提供更有效的类似物如HDACI。本文受版权保护。版权所有。

  DOI：

  10.1111/cbdd.12819

文献信息

• Virtual Screening of Peptide and Peptidomimetic Fragments Targeted to Inhibit Bacterial Dithiol Oxidase DsbA
  作者：Wilko Duprez、Prabhakar Bachu、Martin J. Stoermer、Stephanie Tay、Róisín M. McMahon、David P. Fairlie、Jennifer L. Martin

  DOI：10.1371/journal.pone.0133805

  日期：——

  Antibacterial drugs with novel scaffolds and new mechanisms of action are desperately needed to address the growing problem of antibiotic resistance. The periplasmic oxidative folding system in Gram-negative bacteria represents a possible target for anti-virulence antibacterials. By targeting virulence rather than viability, development of resistance and side effects (through killing host native microbiota) might be minimized. Here, we undertook the design of peptidomimetic inhibitors targeting the interaction between the two key enzymes of oxidative folding, DsbA and DsbB, with the ultimate goal of preventing virulence factor assembly. Structures of DsbB - or peptides - complexed with DsbA revealed key interactions with the DsbA active site cysteine, and with a hydrophobic groove adjacent to the active site. The present work aimed to discover peptidomimetics that target the hydrophobic groove to generate non-covalent DsbA inhibitors. The previously reported structure of a Proteus mirabilis DsbA active site cysteine mutant, in a non-covalent complex with the heptapeptide PWATCDS, was used as an in silico template for virtual screening of a peptidomimetic fragment library. The highest scoring fragment compound and nine derivatives were synthesized and evaluated for DsbA binding and inhibition. These experiments discovered peptidomimetic fragments with inhibitory activity at millimolar concentrations. Although only weakly potent relative to larger covalent peptide inhibitors that interact through the active site cysteine, these fragments offer new opportunities as templates to build non-covalent inhibitors. The results suggest that non-covalent peptidomimetics may need to interact with sites beyond the hydrophobic groove in order to produce potent DsbA inhibitors.

  迫切需要具有新型骨架和新作用机制的抗菌药物来解决日益严重的抗生素抗药性问题。革兰氏阴性菌中的周质氧化折叠系统代表了抗毒力抗菌药物可能的靶点。通过针对毒力而非生存能力，可能最大限度地减少耐药性的发展和副作用（通过杀死宿主的原生微生物群）。在此，我们进行了设计，旨在针对氧化折叠的两个关键酶DsbA和DsbB之间的相互作用，设计出肽模拟物抑制剂，最终目标是阻止毒力因子组装。DsbB或肽与DsbA复合物的结构揭示了与DsbA活性位点半胱氨酸以及活性位点附近的一个疏水性凹槽的关键相互作用。目前的工作目标是发现靶向疏水性凹槽的肽模拟物，以生成非共价DsbA抑制剂。先前报道的变形杆菌DsbA活性位点半胱氨酸突变体的结构，在非共价复合物中与七肽PWATCDS结合，被用作计算机模拟筛选肽模拟物片段库的模板。得分最高的片段化合物及其九个衍生物被合成，并评估其DsbA结合和抑制作用。这些实验发现了在毫摩尔浓度下具有抑制活性的肽模拟物片段。尽管相对于通过活性位点半胱氨酸相互作用的大分子共价肽抑制剂而言，这些片段的效力较弱，但它们提供了作为构建非共价抑制剂模板的新机会。结果表明，非共价肽模拟物可能需要与疏水性凹槽以外的位点相互作用，才能产生强效的DsbA抑制剂。
• NOVEL BINDER-DRUG CONJUGATES (ADCs) AND USE OF SAME
  申请人：SEATTLE GENETICS, INC.

  公开号：US20150246136A1

  公开（公告）日：2015-09-03

  The present patent application relates to novel binder-drug conjugates (ADCs) of N,N-dialkylauristatins directed against the target epidermal growth factor receptor (EGFR, gene ID 1956), effective metabolites of these ADCs, methods for producing these ADCs, use of these ADCs for treatment and or prevention of diseases as well as the use of these ADCs to produce pharmaceutical drugs for treatment and/or prevention of diseases, in particular hyperproliferative and/or angiogenic diseases such as cancer, for example. Such treatments may be administered as monotherapy or in combination with other pharmaceutical drugs or other therapeutic measures.

  本专利申请涉及针对靶向表皮生长因子受体（EGFR，基因ID 1956）的新型结合物-药物共轭物（ADCs）N，N-二烷基月桂酰基蛋白酶抑制剂，这些ADCs的有效代谢物，生产这些ADCs的方法，利用这些ADCs治疗和/或预防疾病，以及利用这些ADCs生产用于治疗和/或预防疾病的药物，特别是治疗高增殖和/或血管生成性疾病，如癌症。这种治疗可以作为单药疗法或与其他药物或其他治疗措施联合使用。
• C ring may be dispensable for β-carboline: Design, synthesis, and bioactivities evaluation of tryptophan analog derivatives based on the biosynthesis of β-carboline alkaloids
  作者：Yuanqiong Huang、Yongxian Liu、Yuxiu Liu、Hongjian Song、Qingmin Wang

  DOI：10.1016/j.bmc.2015.08.016

  日期：2016.2

  According to our previous work and the latest research on the biosynthesis of β-carboline, and using the reverse thinking strategy, tryptophan, the biosynthesis precursor of β-carboline alkaloids, and their derivatives were synthesized, and their biological activities and structure–activity relationships were studied. This bioassay showed that these compounds exhibited good inhibitory activities against

  根据我们先前对β-咔啉生物合成的研究和最新研究，并采用逆向思维策略，合成了色氨酸，β-咔啉生物碱的生物合成前体及其衍生物，以及它们的生物活性和构效关系被研究了。这项生物测定结果表明，这些化合物对烟草花叶病毒（TMV）表现出良好的抑制活性。尤其是（S）-2-氨基-3-（1 H-吲哚-3-基）-N-辛基丙酰胺（4）（63.3±2.1％，67.1±1.9％，68.7±1.3％和64.5±3.1％， 500μg/ mL）在体外和体内均表现出最佳的抗病毒活性。化合物4选择该化合物用于野外试验和急性口服毒性试验，结果表明该化合物在野外具有良好的抗TMV活性，而急性口服毒性较低。我们还发现这些化合物显示出抗真菌活性和杀虫活性。
• Identification of a dual acting SARS-CoV-2 proteases inhibitor through in silico design and step-by-step biological characterization
  作者：Veronica Di Sarno、Gianluigi Lauro、Simona Musella、Tania Ciaglia、Vincenzo Vestuto、Marina Sala、Maria Carmina Scala、Gerardina Smaldone、Francesca Di Matteo、Sara Novi、Mario Felice Tecce、Ornella Moltedo、Giuseppe Bifulco、Pietro Campiglia、Isabel M. Gomez-Monterrey、Robert Snoeck、Graciela Andrei、Carmine Ostacolo、Alessia Bertamino

  DOI：10.1016/j.ejmech.2021.113863

  日期：2021.12

  campaign, is the only drug approved, so far, for the treatment of the infection. Nevertheless, WHO in later 2020 has recommended against its use in COVID-19. In the present paper, we describe a step-by-step in silico design of a small library of compounds as main protease (Mpro) inhibitors. All the molecules were screened by an enzymatic assay on Mpro and, then, cellular activity was evaluated using Vero

  从最近的 2019 年开始，由 SARS-CoV-2 病原体引起的 COVID-19 大流行导致了上个世纪最严重的健康-社会-经济灾难。尽管付出了巨大的科学努力，主要集中在疫苗的开发上，但有效且有效的抗 SARS-CoV-2 疗法的鉴定仍然是一个未满足的需求。Remdesivir 是一种从再利用运动中选出的抗埃博拉药物，是迄今为止唯一获准用于治疗感染的药物。尽管如此，世卫组织在 2020 年晚些时候建议不要将其用于 COVID-19。在本文中，我们描述了作为主要蛋白酶 (M pro ) 抑制剂的小型化合物库的计算机设计的逐步过程。通过对 M pro 的酶促测定筛选所有分子然后，使用 Vero 细胞病毒感染模型评估细胞活性。细胞筛选显示化合物29和34在无毒浓度（0.32 < EC 50  < 5.98 μM）下作为体外 SARS-CoV-2 复制抑制剂。为了使这些结果合理化，进行了额外的体外测定，重点关注木瓜蛋白酶样蛋白酶
• Hafnium-Catalyzed Direct Amide Formation at Room Temperature
  作者：Helena Lundberg、Hans Adolfsson

  DOI：10.1021/acscatal.5b00385

  日期：2015.6.5

  [Hf(Cp)2Cl2], as catalyst. Amino acids are transformed into their corresponding amides without racemization, and the catalyst displays full selectivity for the amidation of carboxylic acids over esters. Electronic properties of the carboxylic acids were found to have a strong influence on the rate of the amidation reaction, and the need for a balanced amount of molecular sieves was observed to be

  本文介绍了在环境温度（26°C）下直接酰胺化未活化羧酸的金属催化方案的第一个例子。温和的反应条件，使用市售的[络合物[Hf（Cp）2 Cl 2 ]作为催化剂，可在短至90分钟的反应时间内获得高产率的一系列酰胺。氨基酸不消旋地转化为它们相应的酰胺，催化剂对羧酸酰胺上酯的酰胺化显示出完全的选择性。发现羧酸的电子性质对酰胺化反应的速率有很大的影响，并且观察到需要平衡量的分子筛对于获得最佳反应结果非常重要。