(1R,4S,5R)-1,4-di(tert-butyldimethylsilyloxy)-3-(thien-3-yl)methoxy-2-(thien-3-yl)methylcyclohex-2-en-1,5-carbolactone | 1198791-02-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 内酯类
• 英文名称: (1R,4S,5R)-1,4-di(tert-butyldimethylsilyloxy)-3-(thien-3-yl)methoxy-2-(thien-3-yl)methylcyclohex-2-en-1,5-carbolactone
• 英文别名: (1R,4S,5R)-1,4-di(tert-butyldimethylsilyloxy)-3-(thien-2-yl)methoxy-2-(thien-2-yl)methylcyclohex-2-ene-1,5-carbolactone；(1R,4S,5R)-1,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-3-(thiophen-2-ylmethoxy)-2-(thiophen-2-ylmethyl)-6-oxabicyclo[3.2.1]oct-2-en-7-one
• CAS: 1198791-02-4
• 化学式: C₂₉H₄₄O₅S₂Si₂
• 分子量: 592.968
• InChiKey: XQYOLHZKXKEQEB-OBZNHSRCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.3
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  111
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (1R,4S,5R)-1,4-di(tert-butyldimethylsilyloxy)-3-(thien-3-yl)methoxy-2-(thien-3-yl)methylcyclohex-2-en-1,5-carbolactone 在 四丁基氟化铵 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 反应 1.25h， 生成 sodium (1R,4S,5R)-1,4,5-trihydroxy-3-(thien-3-yl)methoxy-2-(thien-3-yl)methylcyclohex-2-ene-1-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  前药方法，以提高有效的结核分枝杆菌II型脱氢喹啉酶抑制剂的抗结核活性。

  摘要：

  的高亲和性可逆的竞争性抑制剂的合成中的结核分枝杆菌II型dehydroquinase，在一个必需酶的结核分枝杆菌的细菌被报告。此处报道的抑制剂是烯醇中间体的模拟物，研究了取代对C2的影响。结核分枝杆菌的晶体结构还描述了与三种报道的抑制剂复合的II型脱氢喹啉酶。结果表明，C2上的芳族取代基可通过阻止Arg108与柔性环的基本Tyr24的氢键相互作用（引发催化的残基）来阻止活性位点的封闭。还通过酯前药方法对报告的酸进行了化学修饰，以改善其在结核分枝杆菌中的内在化。丙酸酯被证明是实现最佳体外活性的最有效方法。

  DOI：

  10.1021/jm2006063
• 作为产物：
  描述：

  (1R,4S,5R)-1,4-bis(tert-butyldimethylsilyloxy)-3-oxocyclohexane-1,5-carbolactone 、 2-溴甲基噻吩 在 双(三甲基硅烷基)氨基钾 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 1.25h， 以35%的产率得到(1R,4S,5R)-1,4-di(tert-butyldimethylsilyloxy)-3-(thien-3-yl)methoxy-2-(thien-3-yl)methylcyclohex-2-en-1,5-carbolactone
  参考文献：
  名称：

  幽门螺杆菌II型脱氢喹啉酶的新型纳摩尔竞争抑制剂的合成和生物学评价。具有基本残基的芳香族部分作用的结构细节‡

  摘要：

  iki草酸途径对于许多病原体是必不可少的，但是在哺乳动物中是不存在的。因此，其途径中的酶是开发新型抗生素的合适靶标。脱氢喹啉酶是该途径的第三个酶，催化3-脱氢奎宁酸的可逆脱水形成3-脱氢shi草酸。在这里，我们提出了对幽门螺杆菌II型脱氢喹啉酶具有高亲和力和有效抑制特性的新型抑制剂的合成。幽门螺杆菌的结构与最有效的抑制剂配合使用的II型脱氢喹啉酶表明，芳香族官能团通过π堆积与催化的Tyr22相互作用，从而将Arg17侧链（对催化至关重要）从活性位点排出。因此，该结构解释了抑制剂的有利特性，并将有助于设计改良的抗生素。

  DOI：

  10.1021/jm9010466

文献信息

• Synthesis and Biological Evaluation of New Nanomolar Competitive Inhibitors of <i>Helicobacter pylori</i> Type II Dehydroquinase. Structural Details of the Role of the Aromatic Moieties with Essential Residues
  作者：Verónica F. V. Prazeres、Lorena Tizón、José M. Otero、Pablo Guardado-Calvo、Antonio L. Llamas-Saiz、Mark J. van Raaij、Luis Castedo、Heather Lamb、Alastair R. Hawkins、Concepción González-Bello

  DOI：10.1021/jm9010466

  日期：2010.1.14

  novel antibiotics. Dehydroquinase is the third enzyme of the pathway, catalyzing the reversible dehydratation of 3-dehydroquinic acid to form 3-dehydroshikimic acid. Here we present the synthesis of novel inhibitors with high affinity for Helicobacter pylori type II dehydroquinase and efficient inhibition characteristics. The structure of Helicobacter pylori type II dehydroquinase in complex with the

  iki草酸途径对于许多病原体是必不可少的，但是在哺乳动物中是不存在的。因此，其途径中的酶是开发新型抗生素的合适靶标。脱氢喹啉酶是该途径的第三个酶，催化3-脱氢奎宁酸的可逆脱水形成3-脱氢shi草酸。在这里，我们提出了对幽门螺杆菌II型脱氢喹啉酶具有高亲和力和有效抑制特性的新型抑制剂的合成。幽门螺杆菌的结构与最有效的抑制剂配合使用的II型脱氢喹啉酶表明，芳香族官能团通过π堆积与催化的Tyr22相互作用，从而将Arg17侧链（对催化至关重要）从活性位点排出。因此，该结构解释了抑制剂的有利特性，并将有助于设计改良的抗生素。
• A Prodrug Approach for Improving Antituberculosis Activity of Potent Mycobacterium tuberculosis Type II Dehydroquinase Inhibitors
  作者：Lorena Tizón、José M. Otero、Verónica F. V. Prazeres、Antonio L. Llamas-Saiz、Gavin C. Fox、Mark J. van Raaij、Heather Lamb、Alastair R. Hawkins、José A. Ainsa、Luis Castedo、Concepción González-Bello

  DOI：10.1021/jm2006063

  日期：2011.9.8

  competitive inhibitors of Mycobacterium tuberculosis type II dehydroquinase, an essential enzyme in Mycobacterium tuberculosis bacteria, is reported. The inhibitors reported here are mimics of the enol intermediate and the effect of substitution on C2 was studied. The crystal structures of Mycobacterium tuberculosis type II dehydroquinase in complex with three of the reported inhibitors are also described

  的高亲和性可逆的竞争性抑制剂的合成中的结核分枝杆菌II型dehydroquinase，在一个必需酶的结核分枝杆菌的细菌被报告。此处报道的抑制剂是烯醇中间体的模拟物，研究了取代对C2的影响。结核分枝杆菌的晶体结构还描述了与三种报道的抑制剂复合的II型脱氢喹啉酶。结果表明，C2上的芳族取代基可通过阻止Arg108与柔性环的基本Tyr24的氢键相互作用（引发催化的残基）来阻止活性位点的封闭。还通过酯前药方法对报告的酸进行了化学修饰，以改善其在结核分枝杆菌中的内在化。丙酸酯被证明是实现最佳体外活性的最有效方法。