undecaprenyl pyrophosphate | 23-13-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 异戊烯醇脂质
• 英文名称: undecaprenyl pyrophosphate
• 英文别名: C55-PP；phosphono [(2E,6E,10E,14E,18E,22E,26E,30E,34E,38E)-3,7,11,15,19,23,27,31,35,39,43-undecamethyltetratetraconta-2,6,10,14,18,22,26,30,34,38,42-undecaenyl] hydrogen phosphate
• CAS: 23-13-2；31867-59-1
• 化学式: C₅₅H₉₂O₇P₂
• 分子量: 927.279
• InChiKey: NTXGVHCCXVHYCL-RDQGWRCRSA-N

物化性质

• 物理描述：
  Solid

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  17.4
• 重原子数：
  64
• 可旋转键数：
  35
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  113
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  undecaprenyl pyrophosphate 在 十二烷基-β-D-麦芽糖苷 、 recombinant Bacillus subtilis transmembrane PAP₂ type phosphatidylglycerol phosphate phosphatase N-terminally His₆-tagged 、 2-巯基乙醇 、 sodium chloride 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 0.17h， 生成 undecaprenyl phosphate
  参考文献：
  名称：

  枯草芽孢杆菌跨膜PAP2型磷脂酰甘油磷酸磷酸酶的晶体结构和生化特性。

  摘要：

  2型磷脂酸磷酸酶（PAP2s）可以是可溶性膜酶，也可以是整体膜酶。在细菌中，完整的膜PAP2s在甘油磷脂，十一碳烯基磷酸酯（C55-P）脂质载体和脂多糖的代谢中起主要作用。通过体内功能实验和生化特征，我们表明枯草芽孢杆菌yodM基因编码的膜PAP2是枯草芽孢杆菌的主要磷脂酰甘油磷酸（PGP）磷酸酶。我们还证实了该酶，重命名为bsPgpB，对C55-PP的活性较弱。此外，我们以2.25Å的分辨率解析了bsPgpB的晶体结构，其中钨酸盐（磷酸盐类似物）位于活性位点。该结构揭示了在活性位点附近的两条脂质链，允许进行PGP底物建模和分子动力学模拟。

  DOI：

  10.1007/s00018-017-2464-6

文献信息

• Crystal structure and biochemical characterization of the transmembrane PAP2 type phosphatidylglycerol phosphate phosphatase from Bacillus subtilis
  作者：Meriem El Ghachi、Nicole Howe、Rodolphe Auger、Alexandre Lambion、Annick Guiseppi、François Delbrassine、Guillaume Manat、Sophie Roure、Sabine Peslier、Eric Sauvage、Lutz Vogeley、Juan-Carlos Rengifo-Gonzalez、Paulette Charlier、Dominique Mengin-Lecreulx、Maryline Foglino、Thierry Touzé、Martin Caffrey、Frédéric Kerff

  DOI：10.1007/s00018-017-2464-6

  日期：2017.6

  that the membrane PAP2 coded by the Bacillus subtilis yodM gene is the principal phosphatidylglycerol phosphate (PGP) phosphatase of B. subtilis. We also confirm that this enzyme, renamed bsPgpB, has a weaker activity on C55-PP. Moreover, we solved the crystal structure of bsPgpB at 2.25 Å resolution, with tungstate (a phosphate analog) in the active site. The structure reveals two lipid chains in the

  2型磷脂酸磷酸酶（PAP2s）可以是可溶性膜酶，也可以是整体膜酶。在细菌中，完整的膜PAP2s在甘油磷脂，十一碳烯基磷酸酯（C55-P）脂质载体和脂多糖的代谢中起主要作用。通过体内功能实验和生化特征，我们表明枯草芽孢杆菌yodM基因编码的膜PAP2是枯草芽孢杆菌的主要磷脂酰甘油磷酸（PGP）磷酸酶。我们还证实了该酶，重命名为bsPgpB，对C55-PP的活性较弱。此外，我们以2.25Å的分辨率解析了bsPgpB的晶体结构，其中钨酸盐（磷酸盐类似物）位于活性位点。该结构揭示了在活性位点附近的两条脂质链，允许进行PGP底物建模和分子动力学模拟。