3-{1-[3-(4-isopropyl-phenyl)-propyl]-2-oxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl}-propionic acid methyl ester | 1415411-41-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 异戊烯醇脂质
• 英文名称: 3-{1-[3-(4-isopropyl-phenyl)-propyl]-2-oxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl}-propionic acid methyl ester
• 英文别名: methyl 3-[5-oxo-1-[3-(4-propan-2-ylphenyl)propyl]-2H-pyrrol-4-yl]propanoate
• CAS: 1415411-41-4
• 化学式: C₂₀H₂₇NO₃
• 分子量: 329.439
• InChiKey: KDIHDTSOAWCHAJ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.4
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  46.6
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-{1-[3-(4-isopropyl-phenyl)-propyl]-2-oxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl}-propionic acid methyl ester 在 羟胺钾盐 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 生成 N-hydroxy-3-{1-[3-(4-isopropyl-phenyl)-propyl]-2-oxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl}-propionamide
  参考文献：
  名称：

  基于内酰胺的HDAC抑制剂用于抗癌化学疗法：通过翻译后修饰和表观遗传控制恢复RUNX3

  摘要：

  肿瘤抑制子相关转录因子3（RUNX3）的表达和稳定性受组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）调节。HDAC抑制会改变RUNX3的表观遗传和翻译后稳定性，从而导致肿瘤抑制。但是，HDAC抑制剂可以通过染色质重塑非选择性地改变全局基因的表达。因此，筛选了基于内酰胺的HDAC抑制剂以鉴定有效的蛋白质稳定剂，该稳定剂可通过乙酰化保持RUNX3的稳定性。通过基于细胞的RUNX激活和HDAC抑制测定法确定了111种基于内酰胺的类似物的RUNX活性和HDAC抑制作用。3- [1-（4-溴苄基）-2-氧代-2,5-二氢-1 H-吡咯-3-基] -N-羟基丙酰胺（11-8）可显着提高RUNX3的乙酰化和稳定性，并具有相对较低的RUNX3 mRNA表达和HDAC抑制活性。在MKN28异种移植模型中，该化合物显示出显着的抗肿瘤作用，比SAHA强。因此，我们提出了一种新的策略，其中HDAC抑制剂用作选择性靶向RUNX3的表

  DOI：

  10.1002/cmdc.201300393
• 作为产物：
  描述：

  5-methoxy-2-methylene-5-oxopentanoic acid 在 RuCl2(1,3-dimesityl-imidazolidin-2-yl)(PCy3)(=CHPh) 、 4-二甲氨基吡啶 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成 3-{1-[3-(4-isopropyl-phenyl)-propyl]-2-oxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl}-propionic acid methyl ester
  参考文献：
  名称：

  基于内酰胺的HDAC抑制剂用于抗癌化学疗法：通过翻译后修饰和表观遗传控制恢复RUNX3

  摘要：

  肿瘤抑制子相关转录因子3（RUNX3）的表达和稳定性受组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）调节。HDAC抑制会改变RUNX3的表观遗传和翻译后稳定性，从而导致肿瘤抑制。但是，HDAC抑制剂可以通过染色质重塑非选择性地改变全局基因的表达。因此，筛选了基于内酰胺的HDAC抑制剂以鉴定有效的蛋白质稳定剂，该稳定剂可通过乙酰化保持RUNX3的稳定性。通过基于细胞的RUNX激活和HDAC抑制测定法确定了111种基于内酰胺的类似物的RUNX活性和HDAC抑制作用。3- [1-（4-溴苄基）-2-氧代-2,5-二氢-1 H-吡咯-3-基] -N-羟基丙酰胺（11-8）可显着提高RUNX3的乙酰化和稳定性，并具有相对较低的RUNX3 mRNA表达和HDAC抑制活性。在MKN28异种移植模型中，该化合物显示出显着的抗肿瘤作用，比SAHA强。因此，我们提出了一种新的策略，其中HDAC抑制剂用作选择性靶向RUNX3的表

  DOI：

  10.1002/cmdc.201300393

文献信息

• Property-Based Optimization of Hydroxamate-Based γ-Lactam HDAC Inhibitors to Improve Their Metabolic Stability and Pharmacokinetic Profiles
  作者：Eunhyun Choi、Chulho Lee、Misun Cho、Jeong Jea Seo、Jee Sun Yang、Soo Jin Oh、Kiho Lee、Song-Kyu Park、Hwan Mook Kim、Ho Jeong Kwon、Gyoonhee Han

  DOI：10.1021/jm3009376

  日期：2012.12.13

  Hydroxamate-based HDAC inhibitors have promising anticancer activities but metabolic instability and poor pharmacokinetics leading to poor in vivo results. QSAR and PK studies of HDAC inhibitors showed that a gamma-lactam core and a modified cap group, including halo, alkyl, and alkoxy groups with various carbon chain linkers, improved HDAC inhibition and metabolic stability. The biological properties of the gamma-lactam HDAC inhibitors were evaluated; the compound designated 8f had potent anticancer activity and high oral bioavailability.