sodium hydrogen 3-(N-(4-isopropylbenzyloxy)acetamido)propylphosphonate | 1417649-83-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 异戊烯醇脂质
• 英文名称: sodium hydrogen 3-(N-(4-isopropylbenzyloxy)acetamido)propylphosphonate
• 英文别名: sodium;hydron;N-(3-phosphonatopropyl)-N-[(4-propan-2-ylphenyl)methoxy]acetamide
• CAS: 1417649-83-2
• 化学式: C₁₅H₂₃NO₅P*Na
• 分子量: 351.315
• InChiKey: ZDYFGNRLMATPGG-UHFFFAOYSA-M

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.97
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  89.9
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  diethyl (3-(N-(benzyloxy)acetamido)propyl)phosphonate 在 palladium 10% on activated carbon 、 水 、 氢气 、 sodium hydride 、 sodium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 sodium hydrogen 3-(N-(4-isopropylbenzyloxy)acetamido)propylphosphonate
  参考文献：
  名称：

  Design of potential bisubstrate inhibitors against Mycobacterium tuberculosis (Mtb) 1-deoxy-d-xylulose 5-phosphate reductoisomerase (Dxr)—evidence of a novel binding mode

  摘要：

  在大多数细菌中，非梅瓦隆酸途径用于合成异构烯单位。该途径的第二步是Dxr，它催化NADPH依赖的1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸（DXP）转化为2-C-甲基-D-赤藓糖-4-磷酸（MEP）的还原异构化反应。Dxr受到天然产品fosmidomycin和FR900098的抑制，这些化合物与DXP结合位点结合。这些化合物虽然是Dxr的强效抑制剂，但由于其极性，缺乏对结核分枝杆菌（Mtb）的全细胞活性。我们的目标是利用Mtb Dxr-fosmidomycin共晶结构设计双底物配体，以同时结合DXP和NADPH位点。这类化合物预计由于其增强的疏水性而表现出更好的全细胞活性。设计并合成了两系列化合物。两系列中的化合物均抑制Mtb Dxr。最强效的化合物（8）的IC50为17.8 µM。分析表明，化合物8通过一种新颖的非双底物机制与Mtb Dxr结合。此外，化合物8的二乙酯抑制了Mtb的生长，这使得这一类化合物成为寻找新抗结核药物的有趣领先分子。

  DOI：

  10.1039/c3md00085k

文献信息

• [EN] COMPOUNDS FOR INHIBITING 1- DEOXY-D-XYLULOSE- 5 - PHOSPHATE REDUCTOISOMERASE<br/>[FR] COMPOSÉS DESTINÉS À INHIBER LA 1-DÉSOXY-D-XYLULOSE-5-PHOSPHATE RÉDUCTOISOMÉRASE
  申请人：UNIV GEORGE WASHINGTON

  公开号：WO2013006444A1

  公开（公告）日：2013-01-10

  [0082] In particular, the compound is effective to inhibit Dxr in Mycobacterium tuberculosis (Mtb). The present invention relates to compounds having general formula (I) or where X is an acidic group, such as carboxylate, phosphonate, sulfate, and tetrazole; Ar is a substituted or unsubstituted aromatic or heteroaromatic group; and n is 0, 1, 2, 3, or 4, preferably 2, 3, or 4. The compounds inhibits l-deoxy-D-xylulose-5-phosphate reductoisomerase (Dxr), particularly Dxr in Mycobacterium tuberculosis (Mtb).

  特别是，该化合物能有效抑制结核分枝杆菌（Mtb）中的Dxr。本发明涉及具有通式（I）的化合物，其中X是酸性基团，如羧酸盐、膦酸盐、硫酸盐和四唑基；Ar是取代或未取代的芳香或杂环芳基团；n为0、1、2、3或4，优选为2、3或4。这些化合物抑制l-脱氧-D-木糖-5-磷酸还原异构酶（Dxr），特别是结核分枝杆菌（Mtb）中的Dxr。
• COMPOUNDS FOR INHIBITING 1-DEOXY-D-XYLULOSE-5-PHOSPHATE REDUCTOISOMERASE
  申请人：Boshoff Helena I.

  公开号：US20140378418A1

  公开（公告）日：2014-12-25

  In particular, the compound is effective to inhibit Dxr in Mycobacterium tuberculosis (Mtb). The present invention relates to compounds having general formula (I) or (II) where X is an acidic group, such as carboxylate, phosphonate, sulfate, and tetrazole; Ar is a substituted or unsubstituted aromatic or heteroaromatic group; and n is 0, 1, 2, 3, or 4, preferably 2, 3, or 4. The compounds inhibits 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate reductoisomerase (Dxr), particularly Dxr in Mycobacterium tuberculosis (Mtb).

  特别地，该化合物对于抑制结核分枝杆菌（Mtb）中的Dxr具有有效性。本发明涉及具有通式（I）或（II）的化合物，其中X是酸性基团，如羧酸盐、膦酸盐、硫酸盐和四唑基；Ar是取代或未取代的芳香或杂环芳香基团；n为0、1、2、3或4，优选为2、3或4。该化合物抑制1-脱氧-D-木糖-5-磷酸还原异构酶（Dxr），特别是在结核分枝杆菌（Mtb）中的Dxr。
• US9593136B2
  申请人：——

  公开号：US9593136B2

  公开（公告）日：2017-03-14
• Design of potential bisubstrate inhibitors against Mycobacterium tuberculosis (Mtb) 1-deoxy-d-xylulose 5-phosphate reductoisomerase (Dxr)—evidence of a novel binding mode
  作者：Géraldine San Jose、Emily R. Jackson、Eugene Uh、Chinchu Johny、Amanda Haymond、Lindsay Lundberg、Chelsea Pinkham、Kylene Kehn-Hall、Helena I. Boshoff、Robin D. Couch、Cynthia S. Dowd

  DOI：10.1039/c3md00085k

  日期：——

  In most bacteria, the nonmevalonate pathway is used to synthesize isoprene units. Dxr, the second step in the pathway, catalyzes the NADPH-dependent reductive isomerization of 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate (DXP) to 2-C-methyl-D-erythritol-4-phosphate (MEP). Dxr is inhibited by natural products fosmidomycin and FR900098, which bind in the DXP binding site. These compounds, while potent inhibitors of Dxr, lack whole cell activity against Mycobacterium tuberculosis (Mtb) due to their polarity. Our goal was to use the Mtb Dxr-fosmidomycin co-crystal structure to design bisubstrate ligands to bind to both the DXP and NADPH sites. Such compounds would be expected to demonstrate improved whole cell activity due to increased lipophilicity. Two series of compounds were designed and synthesized. Compounds from both series inhibited Mtb Dxr. The most potent compound (8) has an IC50 of 17.8 μM. Analysis shows 8 binds to Mtb Dxr via a novel, non-bisubstrate mechanism. Further, the diethyl ester of 8 inhibits Mtb growth making this class of compounds interesting lead molecules in the search for new antitubercular agents.

  在大多数细菌中，非梅瓦隆酸途径用于合成异构烯单位。该途径的第二步是Dxr，它催化NADPH依赖的1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸（DXP）转化为2-C-甲基-D-赤藓糖-4-磷酸（MEP）的还原异构化反应。Dxr受到天然产品fosmidomycin和FR900098的抑制，这些化合物与DXP结合位点结合。这些化合物虽然是Dxr的强效抑制剂，但由于其极性，缺乏对结核分枝杆菌（Mtb）的全细胞活性。我们的目标是利用Mtb Dxr-fosmidomycin共晶结构设计双底物配体，以同时结合DXP和NADPH位点。这类化合物预计由于其增强的疏水性而表现出更好的全细胞活性。设计并合成了两系列化合物。两系列中的化合物均抑制Mtb Dxr。最强效的化合物（8）的IC50为17.8 µM。分析表明，化合物8通过一种新颖的非双底物机制与Mtb Dxr结合。此外，化合物8的二乙酯抑制了Mtb的生长，这使得这一类化合物成为寻找新抗结核药物的有趣领先分子。