二嗪啉广泛用于光亲和标记 (PAL) 中,以捕获与
生物分子的非共价相互作用。然而,如果不了解二嗪嗪与蛋白质
生物分子的反应性,PAL 实验的设计和解释是具有挑战性的。在此,我们报告了烷基和芳基二嗪与单个
氨基酸、单个蛋白质和整个细胞蛋白质组中的标记偏好的系统评估。我们发现烷基二嗪以 pH 依赖性方式表现出酸性
氨基酸的优先标记,这是反应性烷基重氮中间体的特征,而芳基-
氟二嗪标记模式主要反映通过卡宾中间体的反应。从对 32 个烷基二嗪探针的调查中,我们使用这种反应性特征来合理化为什么烷基二嗪探针优先富集高酸性蛋白质或嵌入膜中的蛋白质,以及为什么具有净正电荷的探针往往在细胞和体外产生更高的标记产量。这些结果表明,烷基二嗪
嘧啶是研究膜蛋白质组的一种特别有效的
化学试剂,将有助于二嗪嗪
生物分子标记实验的设计和解释。