ethyl 2-O-(p-methoxybenzyl)-3,6-dideoxy-1-thio-β-D-xylo-hexopyranoside | 362608-24-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: ethyl 2-O-(p-methoxybenzyl)-3,6-dideoxy-1-thio-β-D-xylo-hexopyranoside
• CAS: 362608-24-0
• 化学式: C₁₆H₂₄O₄S
• 分子量: 312.43
• InChiKey: DGHHVGKTEFPLMR-MPESAESLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.83
• 重原子数：
  21.0
• 可旋转键数：
  6.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  47.92
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  5.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ethyl 2-O-(p-methoxybenzyl)-3,6-dideoxy-1-thio-β-D-xylo-hexopyranoside 在 di-tert-butyl-4-methylpyridine 、 sodium hydride 、 三氟甲烷磺酸甲酯 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.5h， 生成 methyl 2-O-benzoyl-6-O-benzyl-4-O-(p-methoxybenzyl)-3-O-(2'-O-(p-methoxybenzyl)-4'-O-benzyl-3',6'-dideoxy-α-D-xylo-hexopyranosyl)-α-D-mannopyranoside
  参考文献：
  名称：

  三种束缚三糖的合成，以探索熵在碳水化合物-蛋白质相互作用中的作用

  摘要：

  晶体结构数据表明，支链三糖1构成了沙门氏菌血清群B抗原的完全抗原决定簇，该抗原决定簇被单克隆抗体SE155.4识别。为了表征与在结合状态下固定糖苷扭转角相关的熵成本，已经合成了该三糖2-4的三种不同的分子内束缚类似物。两个三糖通过3,6-二脱氧己糖的O-2位置通过亚甲基乙缩醛进行束缚，后者与半乳糖（2）的O- 2或甘露糖（3）的O-4相当。第三根系绳，α，α′-二硫代-p-二甲苯，跨越甘露糖和半乳糖残基的C-6原子，以创建三糖4。2和3的缩醛系链跨越了羟基中心，已知与分子内糖-糖氢键有关，但是由于不能容纳在抗体结合位点的扭曲构象，这两种三糖都没有生物学活性。三糖4是有活性的，因为半乳糖和甘露糖的羟甲基都在结合状态下暴露于溶剂，并且4的约束构象实际上与1的结合构象重叠。尽管保留了互补性并显着降低了扭转柔韧性，但三糖4个表现出Δ ģ °= -7.6千卡摩尔-1相比Δ ģ °= -7.1千卡摩尔

  DOI：

  10.1560/yxqt-2jju-ylaa-l04q
• 作为产物：
  描述：

  4-甲氧基氯苄 、 Ethyl 3,6-dideoxy-1-thio-β-D-xylo-hexopyranoside 在 sodium hydride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.17h， 以26%的产率得到ethyl 2,4-di-O-(p-methoxybenzyl)-3,6-dideoxy-1-thio-β-D-xylo-hexopyranoside
  参考文献：
  名称：

  三种束缚三糖的合成，以探索熵在碳水化合物-蛋白质相互作用中的作用

  摘要：

  晶体结构数据表明，支链三糖1构成了沙门氏菌血清群B抗原的完全抗原决定簇，该抗原决定簇被单克隆抗体SE155.4识别。为了表征与在结合状态下固定糖苷扭转角相关的熵成本，已经合成了该三糖2-4的三种不同的分子内束缚类似物。两个三糖通过3,6-二脱氧己糖的O-2位置通过亚甲基乙缩醛进行束缚，后者与半乳糖（2）的O- 2或甘露糖（3）的O-4相当。第三根系绳，α，α′-二硫代-p-二甲苯，跨越甘露糖和半乳糖残基的C-6原子，以创建三糖4。2和3的缩醛系链跨越了羟基中心，已知与分子内糖-糖氢键有关，但是由于不能容纳在抗体结合位点的扭曲构象，这两种三糖都没有生物学活性。三糖4是有活性的，因为半乳糖和甘露糖的羟甲基都在结合状态下暴露于溶剂，并且4的约束构象实际上与1的结合构象重叠。尽管保留了互补性并显着降低了扭转柔韧性，但三糖4个表现出Δ ģ °= -7.6千卡摩尔-1相比Δ ģ °= -7.1千卡摩尔

  DOI：

  10.1560/yxqt-2jju-ylaa-l04q