methyl 2-[[2-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)acetyl]-[2-[[2-[2-[[2-[2-[[2-[2-[[2-[2-[[2-[[2-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)acetyl]-[2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]ethyl]amino]acetyl]amino]ethyl-[2-[2-oxo-4-(phenylmethoxycarbonylamino)pyrimidin-1-yl]acetyl]amino]acetyl]amino]ethyl-[2-[2-oxo-4-(phenylmethoxycarbonylamino)pyrimidin-1-yl]acetyl]amino]acetyl]amino]ethyl-[2-[2-oxo-4-(phenylmethoxycarbonylamino)pyrimidin-1-yl]acetyl]amino]acetyl]amino]ethyl-[2-[6-(phenylmethoxycarbonylamino)purin-9-yl]acetyl]amino]acetyl]amino]ethyl]amino]acetate | 676555-72-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: methyl 2-[[2-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)acetyl]-[2-[[2-[2-[[2-[2-[[2-[2-[[2-[2-[[2-[[2-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)acetyl]-[2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]ethyl]amino]acetyl]amino]ethyl-[2-[2-oxo-4-(phenylmethoxycarbonylamino)pyrimidin-1-yl]acetyl]amino]acetyl]amino]ethyl-[2-[2-oxo-4-(phenylmethoxycarbonylamino)pyrimidin-1-yl]acetyl]amino]acetyl]amino]ethyl-[2-[2-oxo-4-(phenylmethoxycarbonylamino)pyrimidin-1-yl]acetyl]amino]acetyl]amino]ethyl-[2-[6-(phenylmethoxycarbonylamino)purin-9-yl]acetyl]amino]acetyl]amino]ethyl]amino]acetate
• CAS: 676555-72-9
• 化学式: C₁₀₀H₁₁₃N₃₃O₂₉
• 分子量: 2241.2
• InChiKey: BJVZUAVAJUSHGP-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4
• 重原子数：
  162
• 可旋转键数：
  61
• 环数：
  12.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  762
• 氢给体数：
  13
• 氢受体数：
  34

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 2-[[2-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)acetyl]-[2-[[2-[2-[[2-[2-[[2-[2-[[2-[2-[[2-[[2-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)acetyl]-[2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]ethyl]amino]acetyl]amino]ethyl-[2-[2-oxo-4-(phenylmethoxycarbonylamino)pyrimidin-1-yl]acetyl]amino]acetyl]amino]ethyl-[2-[2-oxo-4-(phenylmethoxycarbonylamino)pyrimidin-1-yl]acetyl]amino]acetyl]amino]ethyl-[2-[2-oxo-4-(phenylmethoxycarbonylamino)pyrimidin-1-yl]acetyl]amino]acetyl]amino]ethyl-[2-[6-(phenylmethoxycarbonylamino)purin-9-yl]acetyl]amino]acetyl]amino]ethyl]amino]acetate 在 氢溴酸 作用下， 以 水 、 溶剂黄146 为溶剂， 反应 72.0h， 以40%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  针对HIV-1 TAR RNA的基于环状PNA的化合物：建模，液相合成和TAR结合。

  摘要：

  设计并合成了包含六聚体PNA序列的环状分子，以通过形成“类似复合物”靶向HIV-1的TAR RNA环。为了比较，还研究了其线性类似物。环状和线性PNA的合成已按照液相策略，使用混合的PNA和完全N保护的（氨基乙基甘氨酰胺）片段完成。已经研究了该环状PNA及其线性类似物与TAR RNA的相互作用，结果清楚地表明，环状反义PNA与TAR RNA之间未发生相互作用，而其线性PNA类似物检测到微弱的相互作用。

  DOI：

  10.1039/b311775h
• 作为产物：
  描述：

  、 {(2-tert-Butoxycarbonylamino-ethyl)-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-acetyl]-amino}-acetic acid 在 (benzotriazo-1-yloxy)tris(dimethylamino)phosphonium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.0h， 以75%的产率得到methyl 2-[[2-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)acetyl]-[2-[[2-[2-[[2-[2-[[2-[2-[[2-[2-[[2-[[2-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)acetyl]-[2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]ethyl]amino]acetyl]amino]ethyl-[2-[2-oxo-4-(phenylmethoxycarbonylamino)pyrimidin-1-yl]acetyl]amino]acetyl]amino]ethyl-[2-[2-oxo-4-(phenylmethoxycarbonylamino)pyrimidin-1-yl]acetyl]amino]acetyl]amino]ethyl-[2-[2-oxo-4-(phenylmethoxycarbonylamino)pyrimidin-1-yl]acetyl]amino]acetyl]amino]ethyl-[2-[6-(phenylmethoxycarbonylamino)purin-9-yl]acetyl]amino]acetyl]amino]ethyl]amino]acetate
  参考文献：
  名称：

  针对HIV-1 TAR RNA的基于环状PNA的化合物：建模，液相合成和TAR结合。

  摘要：

  设计并合成了包含六聚体PNA序列的环状分子，以通过形成“类似复合物”靶向HIV-1的TAR RNA环。为了比较，还研究了其线性类似物。环状和线性PNA的合成已按照液相策略，使用混合的PNA和完全N保护的（氨基乙基甘氨酰胺）片段完成。已经研究了该环状PNA及其线性类似物与TAR RNA的相互作用，结果清楚地表明，环状反义PNA与TAR RNA之间未发生相互作用，而其线性PNA类似物检测到微弱的相互作用。

  DOI：

  10.1039/b311775h