硫肽是一组结构复杂的肽类
天然产物,在
生物工程应用中具有广阔的前景。先前建立的
硫肽/mRNA展示平台能够从头发现具有设计
生物活性的类似
天然产物的
硫肽。然而,与天然
硫肽相比,所发现的结构主要由蛋白
氨基酸组成,这在许多情况下导致代谢稳定性较低。在这里,我们重新开发了该平台,并证明在 mRNA 展示库中利用紧凑的重编程遗传密码可以发现主要由非蛋白结构元件组成的
硫肽。我们通过针对 Traf2 和 NCK 相互作用激酶 (TNIK) 进行亲和力选择来证明我们设计的可行性。实验鉴定出一系列与目标蛋白具有高亲和力(最佳K D = 2.1 nM)和激酶抑制活性(最佳IC 50 = 0.15 μM)的
硫肽。这些发现的化合物在 18 个残基大环中含有多达 15 个非蛋白
氨基酸,在人血清中表现出高代谢稳定性,半衰期长达 99 小时。 TNIK 与发现的
硫肽复合物的 X 射线共晶结构揭示了非蛋白结构单元如何促进靶标