N2-(2-((2R,5S)-5-(((S)-2-amino-4-(tert-butoxy)-4-oxobutanamido)methyl)-1,4-dibenzyl-3,6-dioxopiperazin-2-yl)acetyl)-Nw-((4-methoxy-2,3,6-trimethylphenyl)sulfonyl)-L-arginylglycine | 1389332-53-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N2-(2-((2R,5S)-5-(((S)-2-amino-4-(tert-butoxy)-4-oxobutanamido)methyl)-1,4-dibenzyl-3,6-dioxopiperazin-2-yl)acetyl)-Nw-((4-methoxy-2,3,6-trimethylphenyl)sulfonyl)-L-arginylglycine
• CAS: 1389332-53-9
• 化学式: C₄₇H₆₃N₉O₁₂S
• 分子量: 978.136
• InChiKey: KNBOYDSQYRZTNL-KFIZHRIMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.26
• 重原子数：
  69.0
• 可旋转键数：
  22.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  308.82
• 氢给体数：
  8.0
• 氢受体数：
  13.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N2-(2-((2R,5S)-5-(((S)-2-amino-4-(tert-butoxy)-4-oxobutanamido)methyl)-1,4-dibenzyl-3,6-dioxopiperazin-2-yl)acetyl)-Nw-((4-methoxy-2,3,6-trimethylphenyl)sulfonyl)-L-arginylglycine 在 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 N,N-二异丙基乙胺 、 Methanaminium,N-[(dimethylamino)(3H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-3-yloxy)methylene]-N-methyl-, hexafluorophosphate(1-) 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.0h， 以58%的产率得到tert-butyl 2-((1S,5S,11S,15R)-16,18-dibenzyl-11-(3-(3-((4-methoxy-2,3,6-trimethylphenyl)sulfonyl)guanidino)propyl)-4,7,10,13,17,19-hexaoxo-3,6,9,12,16,18-hexaazabicyclo[13.2.2]nonadecan-5-yl)acetate
  参考文献：
  名称：

  包含新型双功能整合素配体的双功能二酮哌嗪支架的环状RGD拟肽。

  摘要：

  描述了八个双功能二酮哌嗪（DKP）支架的合成。它们正式衍生自2,3-二氨基丙酸和天冬氨酸（DKP - 1 – DKP - 7）或谷氨酸（DKP - 8），具有胺和羧酸官能团。支架在两个立体中心的构型和在二酮哌嗪氮原子上的取代不同。将双功能二酮哌嗪引入了八个具有Arg-Gly-Asp（RGD）序列的环状拟肽中。将所得的肽模拟RGD筛选的能力抑制生物素化的玻连蛋白结合到纯化的整α v β3和α v β 5，其参与肿瘤血管生成。从反式DKP支架（DKP ‐ 2 – DKP ‐ 8）衍生的RGD拟肽获得了纳摩尔IC 50值。通过水溶液中的1 H NMR光谱实验（VT-NMR和NOESY光谱）和Monte Carlo /随机动力学（MC / SD）模拟对环状RGD拟肽进行构象研究，结果表明，亲和力最高的配体具有分子内明确定义的优选构象氢键转弯基序和RGD序列的扩展排列[Cβ（Arg）Cβ（Asp）平均距离≥8

  DOI：

  10.1002/chem.201200457
• 作为产物：
  描述：

  methyl 2-((2R,5S)-1,4-dibenzyl-5-(((tert-butoxycarbonyl)amino)methyl)-3,6-dioxopiperazin-2-yl)acetate 在 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 lithium hydroxide monohydrate 、 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 N,N-二异丙基乙胺 、 Methanaminium,N-[(dimethylamino)(3H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-3-yloxy)methylene]-N-methyl-, hexafluorophosphate(1-) 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 20.0 ℃ 、100.0 kPa 条件下， 反应 4.0h， 生成 N2-(2-((2R,5S)-5-(((S)-2-amino-4-(tert-butoxy)-4-oxobutanamido)methyl)-1,4-dibenzyl-3,6-dioxopiperazin-2-yl)acetyl)-Nw-((4-methoxy-2,3,6-trimethylphenyl)sulfonyl)-L-arginylglycine
  参考文献：
  名称：

  包含新型双功能整合素配体的双功能二酮哌嗪支架的环状RGD拟肽。

  摘要：

  描述了八个双功能二酮哌嗪（DKP）支架的合成。它们正式衍生自2,3-二氨基丙酸和天冬氨酸（DKP - 1 – DKP - 7）或谷氨酸（DKP - 8），具有胺和羧酸官能团。支架在两个立体中心的构型和在二酮哌嗪氮原子上的取代不同。将双功能二酮哌嗪引入了八个具有Arg-Gly-Asp（RGD）序列的环状拟肽中。将所得的肽模拟RGD筛选的能力抑制生物素化的玻连蛋白结合到纯化的整α v β3和α v β 5，其参与肿瘤血管生成。从反式DKP支架（DKP ‐ 2 – DKP ‐ 8）衍生的RGD拟肽获得了纳摩尔IC 50值。通过水溶液中的1 H NMR光谱实验（VT-NMR和NOESY光谱）和Monte Carlo /随机动力学（MC / SD）模拟对环状RGD拟肽进行构象研究，结果表明，亲和力最高的配体具有分子内明确定义的优选构象氢键转弯基序和RGD序列的扩展排列[Cβ（Arg）Cβ（Asp）平均距离≥8

  DOI：

  10.1002/chem.201200457