9H-fluoren-9-ylmethyl N-[4-[[9-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]purin-6-yl]amino]-4-oxobutyl]-N-methylcarbamate | 1036758-20-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 9H-fluoren-9-ylmethyl N-[4-[[9-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]purin-6-yl]amino]-4-oxobutyl]-N-methylcarbamate
• CAS: 1036758-20-9
• 化学式: C₃₀H₃₂N₆O₆
• 分子量: 572.621
• InChiKey: XLADDXWFXIMJJZ-BFLUCZKCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.9
• 重原子数：
  42
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  152
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  9H-fluoren-9-ylmethyl N-[4-[[9-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]purin-6-yl]amino]-4-oxobutyl]-N-methylcarbamate 在 2-二甲氨基吡啶 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 吡啶 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 [(2R,3S,5R)-5-[6-[4-[9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonyl(methyl)amino]butanoylamino]purin-9-yl]-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] 4-oxopentanoate
  参考文献：
  名称：

  FUNCTIONAL MOLECULE, FUNCTIONAL MOLECULE SYNTHESIZING AMIDITE AND TARGET SUBSTANCE ANALYSIS METHOD

  摘要：

  提供一种包括具有引入基团的修饰核苷酸单元的功能分子，其中该基团可被可拆卸地引入到基部；一种合成酰胺基的功能分子合成物，其具有可拆卸地引入到其基部的基团，并用于制造功能分子；以及一种目标物质分析方法，包括：使用功能分子合成酰胺基准备功能分子的随机池；从随机池中筛选出与目标物质有亲和力的功能分子；扩增具有与目标物质有亲和力的功能分子，其中该方法在扩增步骤之前还包括从具有与目标物质有亲和力的功能分子中去除基团。

  公开号：

  US20130017973A1
• 作为产物：
  描述：

  、 在 吡啶 、 水 作用下， 反应 2.0h， 生成 9H-fluoren-9-ylmethyl N-[4-[[9-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]purin-6-yl]amino]-4-oxobutyl]-N-methylcarbamate
  参考文献：
  名称：

  Amidite for nucleic acid synthesis and nucleic acid synthesizing method

  摘要：

  提供一种用于核酸合成的酰胺，其使其中的保护基在温和条件下可以被去除并且可以实际应用，以及使用该核酸合成酰胺的核酸合成方法。具体来说，本发明涉及一种用下面的一般式（I）表示的用于核酸合成的酰胺，以及使用该核酸合成酰胺的核酸合成方法：其中X代表一种碱基；Y代表由4-氨基丁酸衍生物、o-氨基甲基苯甲酸衍生物、o-氨基苯乙酸衍生物、o-氨基乙基苯甲酸衍生物、o-氨基甲基苯乙酸衍生物、o-氨基苯丙酸衍生物和5-氨基戊酸衍生物中的任一形成的保护基；Q代表氢原子或羟基中的一个。

  公开号：

  US20080167459A1

文献信息

• US8288516B2
  申请人：——

  公开号：US8288516B2

  公开（公告）日：2012-10-16
• FUNCTIONAL MOLECULE, FUNCTIONAL MOLECULE SYNTHESIZING AMIDITE AND TARGET SUBSTANCE ANALYSIS METHOD
  申请人：Fujihara Tsuyoshi

  公开号：US20130017973A1

  公开（公告）日：2013-01-17

  To provide a functional molecule including a modified nucleotide unit having a substituent introduced to a base thereof, wherein the substituent is removably introduced to the base; a functional molecule synthesizing amidite that has a substituent removably introduced to its base and that is used for the manufacture of the functional molecule; and a target substance analysis method including: preparing a random pool of functional molecules using a functional molecule synthesizing amidite; screening a functional molecule having affinity for a target substance from the random pool; amplifying the functional molecules having affinity for the target substance, wherein the method further comprises, prior to the amplification step, removing a substituent from the functional molecule having affinity for the target substance.

  提供一种包括具有引入基团的修饰核苷酸单元的功能分子，其中该基团可被可拆卸地引入到基部；一种合成酰胺基的功能分子合成物，其具有可拆卸地引入到其基部的基团，并用于制造功能分子；以及一种目标物质分析方法，包括：使用功能分子合成酰胺基准备功能分子的随机池；从随机池中筛选出与目标物质有亲和力的功能分子；扩增具有与目标物质有亲和力的功能分子，其中该方法在扩增步骤之前还包括从具有与目标物质有亲和力的功能分子中去除基团。
• Amidite for nucleic acid synthesis and nucleic acid synthesizing method
  申请人：Fujihara Tsuyoshi

  公开号：US20080167459A1

  公开（公告）日：2008-07-10

  To provide an amidite for nucleic acid synthesis, which enables a protective group therein to be removed under moderate conditions and can be practically used, and a nucleic acid synthesizing method using the amidite for nucleic acid synthesis. Specifically, the present invention relates to an amidite for nucleic acid synthesis represented by General Formula (I) below, and a nucleic acid synthesizing method using the amidite for nucleic acid synthesis: where X denotes a base; Y denotes a protective group formed of any one of a 4-aminobutyric acid derivative, an o-aminomethylbenzoic acid derivative, an o-aminophenylacetic acid derivative, an o-aminoethylbenzoic acid derivative, an o-aminomethylphenylacetic acid derivative, an o-aminophenylpropionic acid derivative and a 5-aminovaleric acid derivative; and Q denotes one of a hydrogen atom and a hydroxyl group.

  提供一种用于核酸合成的酰胺，其使其中的保护基在温和条件下可以被去除并且可以实际应用，以及使用该核酸合成酰胺的核酸合成方法。具体来说，本发明涉及一种用下面的一般式（I）表示的用于核酸合成的酰胺，以及使用该核酸合成酰胺的核酸合成方法：其中X代表一种碱基；Y代表由4-氨基丁酸衍生物、o-氨基甲基苯甲酸衍生物、o-氨基苯乙酸衍生物、o-氨基乙基苯甲酸衍生物、o-氨基甲基苯乙酸衍生物、o-氨基苯丙酸衍生物和5-氨基戊酸衍生物中的任一形成的保护基；Q代表氢原子或羟基中的一个。