methyl[phenyl 5-acetamido-8-O-(5-acetamido-4,7,8,9-tetra-O-acetyl-3,5-dideoxy-D-glycero-α-D-galacto-2-ulopyranosylono-1',9-lactone)-4,7-di-O-acetyl-3,5-dideoxy-2-thio-D-glycero-D-galacto-non-2-ulopyranosid]onate | 158111-03-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: methyl[phenyl 5-acetamido-8-O-(5-acetamido-4,7,8,9-tetra-O-acetyl-3,5-dideoxy-D-glycero-α-D-galacto-2-ulopyranosylono-1',9-lactone)-4,7-di-O-acetyl-3,5-dideoxy-2-thio-D-glycero-D-galacto-non-2-ulopyranosid]onate
• 英文别名: sialyl-α-(2->8)-sialyl phenylthioglycoside；methyl (4S,5R,6R)-5-acetamido-6-[(S)-[(2R,6S,8R,9R,10S)-9-acetamido-10-acetyloxy-5-oxo-8-[(1S,2R)-1,2,3-triacetyloxypropyl]-1,4,7-trioxaspiro[5.5]undecan-2-yl]-acetyloxymethyl]-4-acetyloxy-2-phenylsulfanyloxane-2-carboxylate
• CAS: 158111-03-6
• 化学式: C₄₁H₅₂N₂O₂₁S
• 分子量: 940.931
• InChiKey: OZPGAIHVVBWEQD-DODOFGRPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.4
• 重原子数：
  65
• 可旋转键数：
  23
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.61
• 拓扑面积：
  322
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  22

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl[phenyl 5-acetamido-8-O-(5-acetamido-4,7,8,9-tetra-O-acetyl-3,5-dideoxy-D-glycero-α-D-galacto-2-ulopyranosylono-1',9-lactone)-4,7-di-O-acetyl-3,5-dideoxy-2-thio-D-glycero-D-galacto-non-2-ulopyranosid]onate 在 palladium dihydroxide 3 A molecular sieve 、 氢气 、 sodium methylate 作用下， 以 甲醇 、 乙腈 为溶剂， 反应 173.0h， 生成 methyl O-[5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-α-D-galacto-non-2-ulopyranosylonic acid]-(2->8)-O-(5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-α-D-galacto-non-2-ulopyranosylonic acid)-(2->3)-β-D-galactopyranoside
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of ganglioside epitopes for oligosaccharide specific immunoadsorption therapy of Guillian-Barré syndrome

  摘要：

  吉兰-巴雷综合征是一种感染后自身免疫性神经病，会导致神经肌肉麻痹。自身抗体通常由细菌感染诱导，与具有单神经节苷脂和二神经节苷脂表位的人类神经节苷脂结合，损害神经连接的功能，而这些神经节苷脂结构在神经连接中高度富集。代表 GD3、GQ1b 和 GM2 表位的截短神经节苷脂已被合成为甲基糖苷和 11 个碳系的糖苷。合成的寡糖配体是这些高度复杂的神经节苷脂表位的结构模拟物，通过其中和或清除自身抗体的能力，具有治疗的潜力，既可以作为全身给药的可溶性阻断配体，也可以作为体外免疫吸附剂使用的免疫亲和配体。

  DOI：

  10.1039/b400029c
• 作为产物：
  描述：

  Methyl 5-acetamido-2,4,7-tri-O-acetyl-3,5-dideoxy-8-O-(5-acetamido-4,7,8,9-tetra-O-acetyl-3,5-dideoxy-D-glycero-α-D-galacto-2-nonulopyranosylono-1',9-lactone)-D-glycero-D-galacto-2-nonulopyranosonate 生成 methyl[phenyl 5-acetamido-8-O-(5-acetamido-4,7,8,9-tetra-O-acetyl-3,5-dideoxy-D-glycero-α-D-galacto-2-ulopyranosylono-1',9-lactone)-4,7-di-O-acetyl-3,5-dideoxy-2-thio-D-glycero-D-galacto-non-2-ulopyranosid]onate
  参考文献：
  名称：

  METHOD OF ALPHA-SELECTIVE GLYCOSYLATION

  摘要：

  公开号：

  EP1626053B1

文献信息

• A synthetic approach to polysialogangliosides containing α-sialyl-(2 → 8)-sialic acid: total synthesis of ganglioside GD3
  作者：Hideki Ishida、Yasuhiro Ohta、Yoji Tsukada、Makoto Kiso、Akira Hasegawa

  DOI：10.1016/0008-6215(93)84025-2

  日期：1993.8

  phenylthio. Compound 8 was converted into the methyl beta-thioglycoside via O-benzoylation, replacement of the 2-(trimethylsilyl)ethyl group by acetyl, and introduction of the methylthio group by reaction with methylthiotrimethylsilane. Compound 17 was converted, via O-acetylation, selective removal of the 2-(trimethylsilyl)ethyl group, and reaction with trichloroacetonitrile, into the alpha-trichloroacetimidate

  描述了神经节苷脂GD3的立体控制的，容易的全合成，该方法是拟议的系统方法的一个实例，该方法用于制备神经节苷脂，该神经节苷脂包含一个α-唾液酸-（2-> 8）-唾液酸单元，其α-糖基与O-3的O-3连接在其寡糖链中的D-半乳糖残基。2-（三甲基甲硅烷基）乙基6-O-苯甲酰基-，3-O-苯甲酰基-或3-O-苄基-β-D-吡喃半乳糖苷或2-（三甲基甲硅烷基）乙基2,3,6的糖基化2′，6′-戊-O-苄基-β-乳糖苷（7），与甲基[苯基5-乙酰氨基-8-O-（5-乙酰氨基-4,7,8,9-四-O-乙酰基- 3,5-二甲氧基-D-甘油-α-D-半乳糖-2-壬基吡喃并1'，9内酯）-4,7-二-O-乙酰基-3,5-二甲氧基-2-硫代-D-甘油-D-半乳糖-2-nonulopyrano sid] onate（3），使用N-碘琥珀酰亚胺-三氟甲磺酸作为促进剂，得到相应的α糖苷8（32％），13（33％），
• Ganglioside GQ1b: Efficient Total Synthesis and the Expansion to Synthetic Derivatives To Elucidate Its Biological Roles
  作者：Akihiro Imamura、Hiromune Ando、Hideharu Ishida、Makoto Kiso

  DOI：10.1021/jo8027888

  日期：2009.4.17

  The convergent total synthesis of ganglioside GQ1b based on the “cassette approach” between the nonreducing end GQ1b-core heptasaccharide and glucosylceramide building blocks was accomplished in high overall yield. The use of a sialylα(2→8)sialylα(2→3)galactose sequence as the key building block enhanced the efficiency of the glycan assembly and led to preparative-scale synthesis readily applicable

  基于“盒式方法”，在非还原性末端GQ1b核心七糖和葡萄糖基神经酰胺结构单元之间实现了神经节苷脂GQ1b的聚合全合成，从而获得了较高的总收率。使用唾液酸基α（2→8）唾液酸基α（2→3）半乳糖序列作为关键构建基块提高了聚糖组装体的效率，并导致易于用于大规模制备的制备规模合成。另外，p的明智选择葡糖神经酰胺上的-甲氧基苄基保护基为先前的合成问题提供了解决方案，包括降低脱保护步骤的收率，并导致总收率的提高。此外，为了阐明其生物学作用，利用相似的方法系统地合成了高产率的非天然GQ1b衍生物。
• Total synthesis of ganglioside GQ1b and the related polysialogangliosides
  作者：Hide-Ki Ishida、Hideharu Ishida、Makoto Kiso、Akira Hasegawa

  DOI：10.1016/s0957-4166(00)80396-1

  日期：1994.12

  The first total synthesis of ganglio-series gangliosides GQ1b, GT1b and GD1b, which contain α-sialyl-(2→8)-α-sialic acid residue in the structure, will be described. Glycosylation of 2-(trimethylsilyl)ethyl O-(2-acetamido-6-O-benzyl-2-deoxy-3,4-O-iso-propylidene-β-D-galactopyranosyl)-(1→4)-O-(2,6-di-O-benzyl-β-D-galactopyranosyl)-(1→4)-2,3,6-tri-O-benzyl-β-D-glucopyranoside (7) with methyl [phenyl

  将描述在结构中含有α-唾液酸-（2→8）-α-唾液酸残基的神经节系列神经节苷脂GQ1b，GT1b和GD1b的第一全合成。的糖基化2-（三甲基硅烷基）乙基ø - （2-乙酰氨基-6- ø -苄基-2-脱氧-3,4- ø -异亚丙基β-d吡喃半乳糖基） - （1→4） - ø - （2,6-二-O-苄基-β-D-吡喃半乳糖基）-（1→4）-2,3,6-三-O-苄基-β-D-吡喃葡萄糖苷（7）与甲基[苯基5-乙酰氨基-8- ø - （5-乙酰氨基-4,7,8,9-四- ø -乙酰基-3,5-二脱氧D-甘油基-α-D-半乳-2- nonulopyranosylono-1'，9-内酯）-4,7-二-O在乙腈中使用N-碘丁二酰亚胺（NIS）-三氟甲磺酸（TfOH）生成-乙酰基3,5-二甲氧基-2-硫代-D-甘油基-D-半乳糖基-2-壬基吡喃糖苷（8），得到受保护的GD2五糖9，其通过脱-O-异丙基亚丙
• Synthesis of a novel CMP-Neu5Ac analogue: CMP- [α-Neu5Ac- (2 → 8)-Neu5Ac]
  作者：Yasuhiro Kajihara、Koshi Koseki、Takashi Ebata、Hisashi Kodama、Hajime Matsushita、Hironobu Hashimoto

  DOI：10.1016/0008-6215(94)00281-9

  日期：1994.11
• Efficient synthesis of 3′-glycosylated LacNAc-based oligosaccharides
  作者：Yili Ding、Minrou Fukuda、Ole Hindsgaul

  DOI：10.1016/s0960-894x(98)00332-1

  日期：1998.7

  LacNAc-based oligosaccharides, including sialyl-(2 --> 3)-LacNAc, dimeric sialyl-(2 --> 3) -LacNAc, trimeric sialyl-(2 --> 3)-LacNAc, beta-glucuronyl-(1 --> 3)-LacNAc, and 3-sulfo-beta-glucuronyl-(1 --> 3)-LacNAc, were synthesized efficiently from a single protected LacNAc derivative having both OH-3' and 4' unprotected. (C) 1998 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.