methyl (1R,3R)-3-[[(1R,3R)-3-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]cyclopentanecarbonyl]amino]cyclopentane-1-carboxylate | 489446-93-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: methyl (1R,3R)-3-[[(1R,3R)-3-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]cyclopentanecarbonyl]amino]cyclopentane-1-carboxylate
• CAS: 489446-93-7
• 化学式: C₁₈H₃₀N₂O₅
• 分子量: 354.447
• InChiKey: JNTJXANCWOQHQN-AAVRWANBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.9
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.83
• 拓扑面积：
  93.7
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (1R,3R)-3-[[(1R,3R)-3-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]cyclopentanecarbonyl]amino]cyclopentane-1-carboxylate 在 盐酸 、 sodium hydroxide 、 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 ((1R,3R)-3-{(1R,3R)-3-[(1R,3R)-3-(2-Cyano-ethylcarbamoyl)-cyclopentylcarbamoyl]-cyclopentylcarbamoyl}-cyclopentyl)-carbamic acid tert-butyl ester
  参考文献：
  名称：

  饱和二水霉素类似物的合成及其DNA结合特性。

  摘要：

  制备并检查了一系列的他霉素的饱和杂环类似物。对p [dA] -p [dT] DNA进行荧光嵌入剂置换（FID）分析以获得C（50）值，并使用含有富含A / T的结合位点的发夹脱氧寡核苷酸来评估DNA结合亲和力。观察到饱和杂环大大降低了相对于双霉素的DNA结合。

  DOI：

  10.1016/s0960-894x(02)00467-5
• 作为产物：
  描述：

  (1R,3R)-3-{{[(叔丁氧基)羰基]氨基}环戊烷-1-羧酸甲酯 在 lithium hydroxide 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 methyl (1R,3R)-3-[[(1R,3R)-3-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]cyclopentanecarbonyl]amino]cyclopentane-1-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  饱和二水霉素类似物的合成及其DNA结合特性。

  摘要：

  制备并检查了一系列的他霉素的饱和杂环类似物。对p [dA] -p [dT] DNA进行荧光嵌入剂置换（FID）分析以获得C（50）值，并使用含有富含A / T的结合位点的发夹脱氧寡核苷酸来评估DNA结合亲和力。观察到饱和杂环大大降低了相对于双霉素的DNA结合。

  DOI：

  10.1016/s0960-894x(02)00467-5

文献信息

• Synthesis and DNA binding properties of saturated distamycin analogues
  作者：Craig R. Woods、Nicolas Faucher、Bernd Eschgfaller、Kenneth W. Bair、Dale L. Boger

  DOI：10.1016/s0960-894x(02)00467-5

  日期：2002.9

  saturated heterocyclic analogues of distamycin were prepared and examined. A fluorescent intercalator displacement (FID) assay conducted on p[dA]-p[dT] DNA to obtain C(50) values and a hairpin deoxyoligonucleotide containing an A/T-rich binding site was used to evaluate DNA binding affinity. It is observed that saturated heterocycles greatly reduce the DNA binding relative to distamycin.

  制备并检查了一系列的他霉素的饱和杂环类似物。对p [dA] -p [dT] DNA进行荧光嵌入剂置换（FID）分析以获得C（50）值，并使用含有富含A / T的结合位点的发夹脱氧寡核苷酸来评估DNA结合亲和力。观察到饱和杂环大大降低了相对于双霉素的DNA结合。