(N-Boc-D-Ser-Pip-Gly-Sar-NMe-Val)2(serine hydroxyl) dilactone | 151961-28-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 肽模拟物
• 英文名称: (N-Boc-D-Ser-Pip-Gly-Sar-NMe-Val)2(serine hydroxyl) dilactone
• 英文别名: tert-butyl N-[(3R,7S,16S,23R,27S,36S)-8,11,28,31-tetramethyl-23-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]-2,6,9,12,15,22,26,29,32,35-decaoxo-7,27-di(propan-2-yl)-5,25-dioxa-1,8,11,14,21,28,31,34-octazatricyclo[34.4.0.016,21]tetracontan-3-yl]carbamate
• CAS: 151961-28-3
• 化学式: C₅₀H₈₂N₁₀O₁₆
• 分子量: 1079.26
• InChiKey: GWHHCBYSZQYNKY-LAASPMKZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.25
• 重原子数：
  76.0
• 可旋转键数：
  4.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.76
• 拓扑面积：
  309.32
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  16.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (N-Boc-D-Ser-Pip-Gly-Sar-NMe-Val)2(serine hydroxyl) dilactone 在 盐酸 作用下， 以 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 0.5h， 以100%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  (-)-Sandramycin：DNA 结合特性的全合成和表征

  摘要：

  描述了强效抗肿瘤抗生素 (-)-sandramycin (1) 全合成的全部细节，这是一种具有 2 倍对称轴的环状十肽，并构成了不断增长的天然存在的一类成员的第一个全合成药物现在包括luzopeptins和quinaldopeptin。该方法的关键战略要素包括在后期引入杂芳族发色团，从而获得具有改变嵌入能力的类似物、对称的五肽偶联和在单个仲酰胺位点以极好的转化率 (90%) 进行的 32 元大环化，以及前体五肽的会聚组合，其中在最终关键偶联反应中引入了潜在不稳定的酯键。这种方法还提供了缺少两个发色团的环状十肽 24-26，并扩展到提供了缺少两个发色团之一的 32 个。DNA结合蛋白的表征...

  DOI：

  10.1021/ja952799y
• 作为产物：
  描述：

  BOC-Gly-Sar-OMe 在 palladium on activated charcoal 盐酸 、 4-二甲氨基吡啶 、 lithium hydroxide 、 叠氮磷酸二苯酯 、 四丁基氟化铵 、 氢气 、 碳酸氢钠 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 25.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 反应 228.5h， 生成 (N-Boc-D-Ser-Pip-Gly-Sar-NMe-Val)2(serine hydroxyl) dilactone
  参考文献：
  名称：

  (-)-Sandramycin：DNA 结合特性的全合成和表征

  摘要：

  描述了强效抗肿瘤抗生素 (-)-sandramycin (1) 全合成的全部细节，这是一种具有 2 倍对称轴的环状十肽，并构成了不断增长的天然存在的一类成员的第一个全合成药物现在包括luzopeptins和quinaldopeptin。该方法的关键战略要素包括在后期引入杂芳族发色团，从而获得具有改变嵌入能力的类似物、对称的五肽偶联和在单个仲酰胺位点以极好的转化率 (90%) 进行的 32 元大环化，以及前体五肽的会聚组合，其中在最终关键偶联反应中引入了潜在不稳定的酯键。这种方法还提供了缺少两个发色团的环状十肽 24-26，并扩展到提供了缺少两个发色团之一的 32 个。DNA结合蛋白的表征...

  DOI：

  10.1021/ja952799y

文献信息

• Synthesis of key sandramycin analogs: systematic examination of the intercalation chromophore
  作者：Dale L. Boger、Jyun-Hung Chen、Kurt W. Saionz、Qing Jin

  DOI：10.1016/s0968-0896(97)10014-1

  日期：1998.1

  The preparation and examination of 2-22 constituting a systematic study of the chromophore of sandramycin (1) are detailed. Fluorescence quenching studies were used to establish binding constants for 1-24 within calf thymus DNA, within a single high affinity bis-intercalation binding site 5'-d(GCATGC)(2), and to establish the preference for sandramycin binding to 5'-d(GCXXGC)(2) where XX = AT, TA, GC, and CG. From the latter studies, sandramycin was found to exhibit a preference that follows the order: 5'-d(GCATGC)(2) > 5'-d(GCGCGC)(2), Delta Delta G degrees = 0.3 kcal/mol > 5'-d(GCTAGC)(2), 5'-d(GCCGGC)(2), Delta Delta G degrees = 0.6 kcal/mol although it binds with high affinity to all four deoxyoligonucleotides. The two highest affinity sequences constitute repeating 5'-PuPy motifs with each intercalation event occurring at a 5'-PyPu step. The most effective sequence constitutes the less stable duplex, contains the sterically most accessible minor groove central to the bis-intercalation site, and the ability to accept two gly-NH/T C2 carbonyl H-bonds identified in prior NMR studies. Similarly, the contribution of the individual structural features of the chromophore were assessed with the high affinity duplex sequence 5'-d(GCATGC)(2). To a first approximation, the cytotoxic properties were found to parallel trends established in the DNA binding affinities. The exception to this generalization was 4 which lacks the sandramycin chromophore phenol. Although typically 4-10x less potent than sandramycin against leukemia cell lines, it proved to be 1-10,000x more potent against melanomas, carcinomas, and adenocarcinomas exhibiting IC50 values of IpM-10 nM placing it among the most potent agents identified to date. Additionally, the first disclosure of the HIV-1 reverse transcriptase inhibitory activity of sandramycin (1) as well as that of its key analogs are described and define the chromophore structural features required for their exceptional potency. Two analogs, 18 and 3, roughly maintain the HIV-I reverse transcriptase inhibitory potency of 1 but exhibit substantially diminished cytotoxic activity (10(2) - 10(3)x). (C) 1998 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.
• (-)-Sandramycin: total synthesis and preliminary DNA binding properties
  作者：Dale L. Boger、Jyun Hung Chen

  DOI：10.1021/ja00077a082

  日期：1993.12
• An exceptionally potent analog of sandramycin
  作者：Dale L. Boger、J.-H. Chen

  DOI：10.1016/s0960-894x(97)00129-7

  日期：1997.1

  The preparation and preliminary evaluation of 2, an analog of sandramycin, are detailed. Although 2 was typically 4-10x less potent than sandramycin against leukemia cell lines, it was found to be 1-10,000x more potent against melanomas, carcinomas, and adenocarcinomas exhibiting typical IC50 values of 200-1 pM and placing it among the most potent agents identified to date. (C) 1997 Elsevier Science Ltd.