Binding to Large Enzyme Pockets: Small-Molecule Inhibitors of Trypanothione Reductase
作者:Elke Persch、Steve Bryson、Nickolay K. Todoroff、Christian Eberle、Jonas Thelemann、Natalie Dirdjaja、Marcel Kaiser、Maria Weber、Hassan Derbani、Reto Brun、Gisbert Schneider、Emil F. Pai、R. Luise Krauth-Siegel、François Diederich
DOI:10.1002/cmdc.201402032
日期:2014.4.30
conjunction of biological activities, mutation studies, and virtual ligand docking simulations led to the prediction of a binding mode that was confirmed by crystal structure analysis. The crystal structures revealed that the ligands bind to the hydrophobic wall of the so‐called “mepacrine binding site”. The binding conformation and potency of the inhibitors varied for TR from Trypanosoma brucei and T
人类非洲锥虫病寄生虫病的病原体属于锥虫科。这些寄生虫的原生动物具有独特的巯基氧化还原代谢,该代谢基于黄素酶锥虫硫酮还原酶(TR)。TR被确定为潜在的药物靶标,并具有一个较大的活性位点,可以实现多种可能的配体取向,这使得合理的基于结构的抑制剂设计极具挑战性。在本文中,我们描述了一系列新的TR小分子抑制剂的合成,结合特性和动力学分析。生物活性,突变研究和虚拟配体对接模拟的结合导致对结合模式的预测,该结合模式已通过晶体结构分析得到证实。晶体结构表明,配体与所谓的“ mepacrine结合位点”的疏水壁结合。抑制剂对TR的结合构象和效价从布氏锥虫和克鲁斯锥虫。