Peptide/Peptoid Hybrid Oligomers: The Influence of Hydrophobicity and Relative Side-Chain Length on Antibacterial Activity and Cell Selectivity
作者:Nicki Frederiksen、Paul R. Hansen、Fredrik Björkling、Henrik Franzyk
DOI:10.3390/molecules24244429
日期:——
relationships within a subclass of oligomers displaying variation of three structural features: (i) cationic side-chain length, (ii) hydrophobic side-chain length, and (iii) type of residue that is of a flexible peptoid nature. Increased side-chain length of cationic residues led to reduced hydrophobicity till the side chains became more extended than the aromatic/hydrophobic side chains, at which point
先前对肽/拟肽杂交体的优化研究通常包括比较显示不同寡聚体长度和不同侧链的结构相关类似物。目前的工作涉及系统构建的一系列 16 个密切相关的 12 聚体低聚物,具有交替的阳离子/疏水设计,代表了广泛的疏水性和相对侧链长度的差异。目的是探索和合理化显示三个结构特征变化的低聚物亚类内的结构 - 活性关系:(i)阳离子侧链长度,(ii)疏水侧链长度,以及(iii)残基类型具有灵活的拟肽性质。阳离子残基侧链长度的增加导致疏水性降低,直到侧链变得比芳香族/疏水性侧链更长,此时疏水性略有增加。抗菌活性评估表明,具有最低疏水性的类似物对大肠杆菌的活性降低,而具有最短阳离子侧链的低聚物对铜绿假单胞菌最有效。因此,与铜绿假单胞菌的膜破坏相互作用似乎是由低聚物的疏水表面(由保护阳离子侧链的芳族基团组成)促进的。具有短阳离子侧链的肽模拟物表现出增加的溶血特性以及降低 HepG2(肝母细胞瘤 G2 细胞系)细胞活力。