4-[(4-Amino-2-Methylpyrimidin-5-Yl)methyl]-3-Methylthiophene-2-Carbaldehyde

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 4-[(4-Amino-2-Methylpyrimidin-5-Yl)methyl]-3-Methylthiophene-2-Carbaldehyde
• 英文别名: 4-[(4-amino-2-methylpyrimidin-5-yl)methyl]-3-methylthiophene-2-carbaldehyde
• 化学式: C₁₂H₁₃N₃OS
• 分子量: 247.321
• InChiKey: NWGVSSQLYKZANM-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.25
• 拓扑面积：
  97.1
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-金刚烷甲胺 、 4-[(4-Amino-2-Methylpyrimidin-5-Yl)methyl]-3-Methylthiophene-2-Carbaldehyde 在 magnesium sulfate 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 20.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  通过化学和遗传突变了解ThiT的完整底物结合口袋

  摘要：

  能量耦合因子（ECF）转运蛋白参与细菌中微量营养素的吸收。转运蛋白通过高亲和力结合蛋白（所谓的S成分）捕获底物。在这里，我们目前对乳酸乳球菌中硫胺素特异性S组分的底物结合口袋的两个区域进行分析，ThiT。首先，研究了硫胺素的噻唑鎓环与Trp34，His125和Glu84残基通过π-π堆积和阳离子-π的相互作用，其次是结合口袋从羟基延伸的部分。我们使转运的配体（化学地）或蛋白质（遗传地）突变。出人意料的是，通过引入具有相反电子效应的取代基对噻唑鎓环进行的修饰对结合亲和力具有相似的作用。我们假设电子效应被所加取代基的空间效应所掩盖，这使得研究孤立的相互作用变得困难。ThiT中的氨基酸取代表明，由ThiT残基Glu84和硫胺素促进的静电相互作用对于皮摩尔亲和力是必需的。探索从硫胺素的羟基延伸的结合位点的亚口袋的脱氮硫胺素衍生物对ThiT具有高亲和力，并且可以通过ECF转运蛋白发展为硫胺素转运的选

  DOI：

  10.1039/c7md00079k
• 作为产物：
  描述：

  2,4,-二溴-3-甲基噻吩 在 manganese(IV) oxide 、 sodium tetrahydroborate 、 异丙基氯化镁 、 sodium ethanolate 、 (2-methylpropyl)lithium 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙醚 、 乙醇 、 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 23.17h， 生成 4-[(4-Amino-2-Methylpyrimidin-5-Yl)methyl]-3-Methylthiophene-2-Carbaldehyde
  参考文献：
  名称：

  硫胺素ECF转运蛋白S组分的强力小分子结合剂的基于结构的设计

  摘要：

  ThiT的强项：设计并合成了能够与ThiT相互作用的硫胺衍生物，ThiT是硫胺素特异性ECF转运蛋白的S组分。已经确定了结合亲和力和共晶体结构。

  DOI：

  10.1002/cbic.201402673

文献信息

• Dynamic Combinatorial Chemistry to Identify Binders of ThiT, an S-Component of the Energy-Coupling Factor Transporter for Thiamine
  作者：Leticia Monjas、Lotteke J. Y. M. Swier、Inda Setyawati、Dirk J. Slotboom、Anna K. H. Hirsch

  DOI：10.1002/cmdc.201700440

  日期：2017.10.20

  We applied dynamic combinatorial chemistry (DCC) to identify ligands of ThiT, the S‐component of the energy‐coupling factor (ECF) transporter for thiamine in Lactococcus lactis. We used a pre‐equilibrated dynamic combinatorial library (DCL) and saturation‐transfer difference (STD) NMR spectroscopy to identify ligands of ThiT. This is the first report in which DCC is used for fragment growing to an

  我们应用动态组合化学 (DCC) 来鉴定 ThiT 的配体，ThiT 是乳酸乳球菌中硫胺素能量耦合因子 (ECF) 转运蛋白的 S 组分。我们使用预平衡的动态组合库 (DCL) 和饱和转移差 (STD) NMR 光谱来识别 ThiT 的配体。这是第一份使用 DCC 将片段生长到不明确的口袋的报道，也是第一份关于其以整合膜蛋白为靶点的应用的报道。