Going beyond Binary: Rapid Identification of Protein–Protein Interaction Modulators Using a Multifragment Kinetic Target-Guided Synthesis Approach
作者:Katya Nacheva、Sameer S. Kulkarni、Mintesinot Kassu、David Flanigan、Andrii Monastyrskyi、Iredia D. Iyamu、Kenichiro Doi、Megan Barber、Niranjan Namelikonda、Jeremiah D. Tipton、Prakash Parvatkar、Hong-Gang Wang、Roman Manetsch
DOI:10.1021/acs.jmedchem.3c00108
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Kinetic target-guided synthesis (KTGS) is a powerful screening approach that enables identification of small molecule modulators for biomolecules. While many KTGS variants have emerged, a majority of the examples suffer from limited throughput and a poor signal/noise ratio, hampering reliable hit detection. Herein, we present our optimized multifragment KTGS screening strategy that tackles these limitations
动力学靶标引导合成 (KTGS) 是一种强大的筛选方法,能够识别生物分子的小分子调节剂。虽然已经出现了许多 KTGS 变体,但大多数示例都受到吞吐量有限和信噪比较差的影响,从而妨碍了可靠的命中检测。在此,我们提出了解决这些限制的优化多片段 KTGS 筛选策略。该方法利用选定的反应监测液相色谱串联质谱法进行命中检测,从而能够在每个筛选孔中孵育 190 个片段组合。因此,我们的片段库从 81 个可能的组合扩展到 1710 个,代表迄今为止组装的最大的 KTGS 筛选库。对扩展的文库进行了针对 Mcl-1 的筛选,最终发现了 24 种抑制剂。这项工作揭示了 KTGS 在快速、可靠地鉴定命中物方面的真正潜力,进一步凸显了其作为药物发现中现有筛选方法的补充的实用性。