4-amino-N-(2-((3-(dimethylamino)propyl)carbamoyl)-1-methyl-1H-imidazol-4-yl)-1-methyl-1H-imidazole-2-carboxamide | 463326-47-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 唑类
• 英文名称: 4-amino-N-(2-((3-(dimethylamino)propyl)carbamoyl)-1-methyl-1H-imidazol-4-yl)-1-methyl-1H-imidazole-2-carboxamide
• CAS: 463326-47-8
• 化学式: C₁₅H₂₄N₈O₂
• 分子量: 348.408
• InChiKey: URSYUXYEUJJYMK-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.33
• 重原子数：
  25.0
• 可旋转键数：
  7.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  123.1
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-amino-N-(2-((3-(dimethylamino)propyl)carbamoyl)-1-methyl-1H-imidazol-4-yl)-1-methyl-1H-imidazole-2-carboxamide 在 palladium on activated charcoal 氢气 、 1-羟基苯并三唑 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 18.0h， 生成 N-(2-{2-[2-(3-Dimethylamino-propylcarbamoyl)-1-methyl-1H-imidazol-4-ylcarbamoyl]-1-methyl-1H-imidazol-4-ylcarbamoyl}-1-methyl-1H-imidazol-4-yl)-terephthalamic acid methyl ester
  参考文献：
  名称：

  几何约束的不对称双（聚酰胺）与抗病毒性双霉素的合成。

  摘要：

  分析分别对（AT）4和（AT）5的寡肽小沟结合剂netropsin（I）和distamycin（II）的严格DNA碱基序列识别的结构和立体化学要求导致了对合理的结构修饰，以改变碱基识别。在本文中，我们报告了与天然抗病毒剂双歧霉素在结构上相关且带有非天然（25-27）或天然（31-33）的不对称咪唑并吡咯并双（聚酰胺）的合成）由柔性或刚性接头链接的末端。这是关于在连接的双（聚酰胺）中具有二甲基氨基丙基或am基末端的带有咪唑的结构的合成的首次报道。

  DOI：

  10.1002/1099-0690(200006)2000:11<2095::aid-ejoc2095>3.0.co;2-j
• 作为产物：
  描述：

  N-[3-(dimethylamino)propyl]-1-methyl-4-[(1-methyl-4-nitroimidazole-2-carbonyl)amino]imidazole-2-carboxamide 在 palladium on activated charcoal 氢气 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 4-amino-N-(2-((3-(dimethylamino)propyl)carbamoyl)-1-methyl-1H-imidazol-4-yl)-1-methyl-1H-imidazole-2-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  几何约束的不对称双（聚酰胺）与抗病毒性双霉素的合成。

  摘要：

  分析分别对（AT）4和（AT）5的寡肽小沟结合剂netropsin（I）和distamycin（II）的严格DNA碱基序列识别的结构和立体化学要求导致了对合理的结构修饰，以改变碱基识别。在本文中，我们报告了与天然抗病毒剂双歧霉素在结构上相关且带有非天然（25-27）或天然（31-33）的不对称咪唑并吡咯并双（聚酰胺）的合成）由柔性或刚性接头链接的末端。这是关于在连接的双（聚酰胺）中具有二甲基氨基丙基或am基末端的带有咪唑的结构的合成的首次报道。

  DOI：

  10.1002/1099-0690(200006)2000:11<2095::aid-ejoc2095>3.0.co;2-j

文献信息

• Highly Efficient Sequence-Specific DNA Interstrand Cross-Linking by Pyrrole/Imidazole CPI Conjugates
  作者：Toshikazu Bando、Akihiko Narita、Isao Saito、Hiroshi Sugiyama

  DOI：10.1021/ja028459b

  日期：2003.3.1

  of DNA interstrand cross-linking agent by synthesizing dimers of a pyrrole (Py)/imidazole (Im)-diamide-CPI conjugate, ImPyLDu86 (1), connected using seven different linkers. The tetramethylene linker compound, 7b, efficiently produces DNA interstrand cross-links at the nine-base-pair sequence, 5'-PyGGC(T/A)GCCPu-3', only in the presence of a partner triamide, ImImPy. For efficient cross-linking by

  我们通过合成吡咯 (Py)/咪唑 (Im)-二酰胺-CPI 偶联物 ImPyLDu86 (1) 的二聚体，使用七种不同的接头连接，开发了一种新型 DNA 链间交联剂。四亚甲基接头化合物 7b 仅在伴侣三酰胺 ImImPy 存在的情况下有效地在九个碱基对序列 5'-PyGGC(T/A)GCCPu-3' 处产生 DNA 链间交联。为了通过 7b 与 ImImPy 进行有效交联，需要两个识别位点之间的一个 AT 碱基对来容纳接头区域。消除 AT 碱基对和插入额外的 AT 碱基对并用 GC 碱基对替换显着降低了交联程度。在存在各种三酰胺的情况下，还检查了 7b 的链间交联的序列特异性。与 ImImPy 相比，ImImIm 的存在略微减少了交联产物的形成。错配伙伴 ImPyPy 和 PyImPy 不与 7b 产生链间交联产物，而 ImPyPy 和 PyImPy 在其与 7b 的匹配位点诱导有效烷基化。使用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和
• The Synthesis of Some Head to Head Linked DNA Minor Groove Binders
  作者：Abedawn I. Khalaf、Andrew R. Pitt、Martin Scobie、Colin J. Suckling、John Urwin、Roger D. Waigh、Robert V. Fishleigh、Steven C. Young、William A. Wylie

  DOI：10.1016/s0040-4020(00)00432-4

  日期：2000.7

  A series of head to head linked dimers of heterocyclic amino acids has been prepared for investigation of affinity and selectivity in binding to the minor groove of DNA. The selection of targets for synthesis was led by computer based design. Several novel dicarboxylic acid linkers including indoles, phenanthrenes, a fluorenone, and a bisbenzothiophene have been included. Analysis of binding to DNA

  已经制备了一系列首尾相连的杂环氨基酸二聚体，用于研究与DNA小沟结合的亲和力和选择性。合成目标的选择由基于计算机的设计主导。已经包括几种新颖的二羧酸连接基，包括吲哚，菲，芴酮和双苯并噻吩。通过印迹分析与DNA的结合表明对衍生自2,7-二氢菲二羧酸的化合物具有很高的亲和力，并且对包含至少4个AT对的AT富集区域具有主要选择性，但具有跨越两个CG碱基对的能力。
• Design, synthesis and in vitro cytotoxicity studies of novel pyrrolo [2,1][1,4] benzodiazepine-glycosylated pyrrole and imidazole polyamide conjugates
  作者：Rohtash Kumar、J. William Lown

  DOI：10.1039/b306685a

  日期：——

  The design, synthesis and biological evaluation of novel pyrrolo [2,1][1,4] benzodiazepine-water insoluble 31-38 and water soluble 39-46 glycosylated pyrrole and imidazole polyamide conjugates are described that involved mercuric chloride mediated cyclization of the corresponding amino diethyl thioacetals. The compounds were prepared with varying numbers of pyrrole and imidazole containing polyamides

  描述了新型吡咯并[2,1] [1,4]苯二氮杂-水不溶性31-38和水溶性39-46糖基化吡咯和咪唑聚酰胺共轭物的设计，合成和生物学评价，涉及氯化汞介导的相应环化反应氨基二乙基硫缩醛。为了提高PBD-聚酰胺共轭物的水溶性并探究最佳体外抗肿瘤活性的结构要求，制备了具有不同数量的含吡咯和咪唑的聚酰胺并掺入葡萄糖部分的化合物。这些化合物由美国国家癌症研究所针对60个人类癌细胞进行了测试，证明了水溶性PBD-聚酰胺化合物比现有的天然和合成吡咯并[2,1-c]具有更高的细胞毒性。 1，4]苯并二氮杂.。这些化合物的乙酰化对应物水解后，其细胞毒性活性急剧增加。表1和表2中总结的活性数据表明，PBD-聚酰胺的溶解度以及杂环的类型在影响PBD-聚酰胺缀合物的细胞毒性活性中起重要作用。与PBD-聚酰胺（水不溶型）结合物相比，PBD-糖基化聚酰胺（水溶性）结合物39-46对许多人类癌细胞系具有高度的细胞毒性。
• Design and Synthesis of Novel Pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepine - Imidazole Containing Polyamide Conjugates
  作者：Rohtash Kumar、B.S.Narayan Reddy、J.William Lown

  DOI：10.1515/hc.2002.8.1.19

  日期：2002.1

  A series of novel pyrrolo[2,l-c][l,4]benzodiazepine (PBD) polyamide conjugates (1-5) containing imidazole units was synthesized as DNA minor groove bining agents. Introduction There is presently an interest in both the synthetic aspects and the mechanism of the biological action of the carbinolamine containing pyrrolo[2,l-c][l,^benzodiazepine (PBD) group of antitumor antibiotics, members of which include

  合成了一系列含有咪唑单元的新型吡咯并 [2,1c][1,4] 苯并二氮杂 (PBD) 聚酰胺缀合物 (1-5) 作为 DNA 小沟结合剂。引言 目前，人们对含有吡咯并[2,lc][l,^苯并二氮杂 (PBD) 基团的抗肿瘤抗生素的甲醇胺的合成方面和生物作用机制感兴趣，其成员包括蒽霉素、托美霉素、新霉素A 和 B，西伯霉素、马西霉素、奇卡霉素、原丝菌素 DC-81 和右旋霉素 (1)。它们的不同之处在于芳族 Aring 和吡咯烷 C 环中取代基的数量、类型和位置，以及 Cring 的饱和度，Cring 可以在 C2-C3（内环）上完全饱和或不饱和或 C2（外环）。这些分子在其作用机制方面的一个关键特征是 N10-C11 甲醇胺（或亚胺等效物）部分。这是一个负责 DNA 烷基化的亲电中心。插入小沟后，通过亲核攻击 PBD 亲电子 Cl 1 位置的鸟嘌呤碱基 N2 形成氨基键，从而在 DNA 的小沟中形成共价加合物
• A General Solution- and Solid-Phase Synthetic Procedure for Incorporating Three Contiguous Imidazole Moieties into DNA Sequence Reading Polyamides
  作者：Sanjay K. Sharma、Manju Tandon、J. William Lown

  DOI：10.1021/jo001034s

  日期：2001.2.1