C8-phenyl-2'-deoxyadenosine | 603106-83-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: C8-phenyl-2'-deoxyadenosine
• 英文别名: 8-phenyl-2'-deoxyadenosine；Adenosine, 2'-deoxy-8-phenyl-；(2R,3S,5R)-5-(6-amino-8-phenylpurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol
• CAS: 603106-83-8
• 化学式: C₁₆H₁₇N₅O₃
• 分子量: 327.343
• InChiKey: BLYRKJBYXSDVJO-QJPTWQEYSA-N

物化性质

• 沸点：
  682.3±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1?+-.0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.1
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  119
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N,N-二甲基甲酰胺二甲基缩醛 、 C8-phenyl-2'-deoxyadenosine 以 甲醇 为溶剂， 反应 48.0h， 以64%的产率得到N6-(N,N-dimethylformamidine)-C8-phenyl-2'-deoxyadenosine
  参考文献：
  名称：

  A General Synthesis of C8-Arylpurine Phosphoramidites

  摘要：

  我们开发了一种合成 C8 芳基嘌呤磷酰胺的通用方案。C8-溴-2′-脱氧鸟苷的 C8-芳基化是关键步骤，是通过使用铃木偶联法实现的。由于偶联反应是在水性条件下进行的，因此不需要先保护羟基，然后再去保护羟基，从而节省了多个步骤，提高了总产率。一旦引入 C8 芳基，糖苷键就会对酸催化裂解变得非常敏感。用相应的 N,N-二甲基甲酰胺衍生物保护氨基基团可提高衍生物的稳定性。合成的 C8 芳基嘌呤被成功用于制备合成寡核苷酸。

  DOI：

  10.3390/molecules14093339
• 作为产物：
  描述：

  碘苯 、 2'-脱氧腺苷 在 哌啶 、 copper(l) iodide 、 palladium diacetate 、 caesium carbonate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 15.0h， 以65%的产率得到C8-phenyl-2'-deoxyadenosine
  参考文献：
  名称：

  Pd(0)/Cu(I)-介导的 2'-脱氧腺苷的直接芳基化：Cu(I) 的机制作用和与相关嘌呤核苷的反应性比较

  摘要：

  Pd/Cu 介导的 2'-脱氧腺苷与各种芳基碘化物的直接芳基化以良好的产率提供了 8-芳基化的 2'-脱氧腺苷衍生物。在显着的反应优化之后，已经确定亚化学计量的哌啶（仲胺）与碳酸铯的组合对于有效的直接芳基化是必要的。一般合成方案允许较低温度的直接芳基化，从而最大限度地减少去糖基化。哌啶效应的起源主要来自原位生成 Pd(OAc) 2 [(CH 2 ) 5 NH] 2. 已经评估了各种铜（I）盐；只有 CuI 能提供良好的 8-芳基化-2'-脱氧腺苷产率。铜 (I) 似乎对 2'-脱氧腺苷具有高结合亲和力，这解释了对这一关键成分的化学计量数量的强制性要求。这些条件与更一般的直接芳基化方案进行比较，例如催化 Pd、配体、酸添加剂，它们不使用铜 (I)。在每种情况下，均未发现可检测到的 2'-脱氧腺苷芳基化。8-芳基-2'-脱氧腺苷产物的构象偏好已通过详细的光谱 (NMR) 和单晶 X 射线衍射研

  DOI：

  10.1021/jo9012282

文献信息

• Pd(0)/Cu(I)-Mediated Direct Arylation of 2′-Deoxyadenosines: Mechanistic Role of Cu(I) and Reactivity Comparisons with Related Purine Nucleosides
  作者：Thomas E. Storr、Christoph G. Baumann、Robert J. Thatcher、Sara De Ornellas、Adrian C. Whitwood、Ian J. S. Fairlamb

  DOI：10.1021/jo9012282

  日期：2009.8.21

  8-arylated-2′-deoxyadenosines. Copper(I) appears to have a high binding affinity for 2′-deoxyadenosine, which explains the mandatory requirement for stoichiometric amounts of this key component. The conditions are compared with more general direct arylation protocols, e.g., catalytic Pd, ligand, acid additives, which do not employ copper(I). In each case, no detectable arylation of 2′-deoxyadenosine was noted

  Pd/Cu 介导的 2'-脱氧腺苷与各种芳基碘化物的直接芳基化以良好的产率提供了 8-芳基化的 2'-脱氧腺苷衍生物。在显着的反应优化之后，已经确定亚化学计量的哌啶（仲胺）与碳酸铯的组合对于有效的直接芳基化是必要的。一般合成方案允许较低温度的直接芳基化，从而最大限度地减少去糖基化。哌啶效应的起源主要来自原位生成 Pd(OAc) 2 [(CH 2 ) 5 NH] 2. 已经评估了各种铜（I）盐；只有 CuI 能提供良好的 8-芳基化-2'-脱氧腺苷产率。铜 (I) 似乎对 2'-脱氧腺苷具有高结合亲和力，这解释了对这一关键成分的化学计量数量的强制性要求。这些条件与更一般的直接芳基化方案进行比较，例如催化 Pd、配体、酸添加剂，它们不使用铜 (I)。在每种情况下，均未发现可检测到的 2'-脱氧腺苷芳基化。8-芳基-2'-脱氧腺苷产物的构象偏好已通过详细的光谱 (NMR) 和单晶 X 射线衍射研
• Efficient One-Step Suzuki Arylation of Unprotected Halonucleosides, Using Water-Soluble Palladium Catalysts
  作者：Elizabeth C. Western、Jonathan R. Daft、Edward M. Johnson、Peter M. Gannett、Kevin H. Shaughnessy

  DOI：10.1021/jo034289p

  日期：2003.8.1

  modification of unprotected halonucleosides is reported herein. Using a catalyst derived from tris(3-sulfonatophenyl)phosphine (TPPTS) and palladium acetate, 8-bromo-2'-deoxyguanosine (8-BrdG) is coupled with arylboronic acids to give 8-aryl-2'-deoxyguanosine adducts (8-ArdG) in excellent yield in a 2:1 water:acetonitrile solvent mixture. The TPPTS ligand was found to be superior to water-soluble alkylphosphines

  修饰核苷以产生药物活性化合物，诱变模型和寡核苷酸结构探针仍然是令人非常感兴趣的。本文报道了未保护的卤代核苷的水相修饰。使用衍生自三（3-磺酰基苯基）膦（TPPTS）和乙酸钯的催化剂，将8-溴2'-脱氧鸟苷（8-BrdG）与芳基硼酸偶合，得到8-芳基-2'-脱氧鸟苷加合物（8 -ArdG）在2：1的水：乙腈溶剂混合物中以优异的收率。对于该偶联反应，发现TPPTS配体优于水溶性烷基膦。偶联化学已扩展到8-溴-2'-脱氧腺苷（8-BrdA）和5-碘-2'-脱氧尿苷（5-IdU），以及核糖核苷8-溴鸟苷和8-溴腺苷。在所有情况下均获得芳基化加合物的良好至优异的收率。使用三（4,6-二甲基-3-磺酰基苯基）膦（TXPTS），可以在室温下不到1小时的时间内完成8-BrdA和5-IdU的Suzuki偶联。该方法学代表了不需要预先保护核苷的卤代核苷芳基化的有效且通用的方法。
• Site-selective direct arylation of unprotected adenine nucleosides mediated by palladium and copper: insights into the reaction mechanism
  作者：Thomas E. Storr、Andrew G. Firth、Karen Wilson、Kate Darley、Christoph G. Baumann、Ian J.S. Fairlamb

  DOI：10.1016/j.tet.2008.01.062

  日期：2008.6

  Reaction conditions facilitating the site-selective direct aryl functionalisation at the C-8 position of adenine nucleosides have been identified. Many different aromatic components may be effectively cross-coupled to provide a diverse array of arylated adenine nucleoside products without the need for ribose or adenine protecting groups. The optimal palladium catalyst loading lies between 0.5 and 5 mol %

  已经确定了促进在腺嘌呤核苷的C-8位上的位点选择性直接芳基官能化的反应条件。许多不同的芳族成分可以有效地交叉偶联，以提供多种阵列的芳基化腺嘌呤核苷产物，而无需核糖或腺嘌呤保护基。钯催化剂的最佳负载量为0.5至5mol％。向反应中添加过量的汞对催化的影响可忽略不计，表明均质催化物质的参与。透射电子显微镜（TEM）的研究表明，含金属的纳米粒子约占 在反应的后面阶段形成具有良好均匀性的3nm。稳定的PVP钯胶体（PVP = N-聚乙烯吡咯烷酮）在直接芳基化过程中具有催化活性，将均相钯释放到溶液中。已经研究了各种取代的2-吡啶配体添加剂的作用。提出了一种腺苷的位点选择性芳构化的机制。
• Inhibitory Effects of the Guanine Moiety on Suzuki Couplings of Unprotected Halonucleosides in Aqueous Media
  作者：Elizabeth C. Western、Kevin H. Shaughnessy

  DOI：10.1021/jo050832l

  日期：2005.8.1

  In the Suzuki arylations of unprotected halonucleosides in aqueous media, 8-bromo-2'-deoxyguanosine (8BrdG) couplings were slower to reach completion than the corresponding 8-bromo-2'deoxyadenosine (8BrdA) couplings. The guanine moiety has an acidic proton, which under our Suzuki conditions (PH congruent to 10) may be deprotonated to give an anion that can coordinate to palladium. The possibility that guanine coordination was responsible for the observed slower rates was explored using additive experiments in which nonhalogenated nucleosides were added to the Suzuki coupling reaction of 8BrdA or 4-bromotoluene and PhB(OH)(2) and the reaction progress monitored by HPLC or GC. Adding dG slowed these reactions, and an induction period was observed. The addition of dA or 1-methyl-2'-deoxyguanosine (lMedG) to these couplings did not affect the rate of conversion to product. Guanine coordination was further explored using C-13 and P-31 NMR spectroscopy, which implies that guanine is coordinating to palladium through N-1 or O-6, or both. Furthermore, the presence of dG inhibited the formation of the active palladium(0) catalytic species, which may account for both the observed induction period and the sluggishness of reactions where guanine is involved.
• Formation and propagation of well-defined Pd nanoparticles (PdNPs) during C–H bond functionalization of heteroarenes: are nanoparticles a moribund form of Pd or an active catalytic species?
  作者：Christoph G. Baumann、Sara De Ornellas、Jonathan P. Reeds、Thomas E. Storr、Thomas J. Williams、Ian J.S. Fairlamb

  DOI：10.1016/j.tet.2014.06.002

  日期：2014.9

  benzimidazole and purine derivatives) mediated by Pd(OAc)2, a commonly used C–H bond functionalization catalyst, reveals that well-defined Pd nanoparticles (PdNPs) are rapidly formed under working catalyst conditions. The PdNPs can be characterized ex situ after entrapment in a polymer matrix (polyvinylpyrrolidinone, PVP). Independently synthesized Pd(PVP)NPs are catalytically competent species, exhibiting catalyst

  对常用芳烃键官能化催化剂Pd（OAc）2介导的杂芳烃（例如，吲哚，苯并恶唑，苯并噻唑，苯并咪唑和嘌呤衍生物）的一系列CH键官能化反应的研究表明，定义明确的钯纳米粒子（PdNPs）在工作催化剂条件下迅速形成。PdNPs可以在包裹在聚合物基质（聚乙烯吡咯烷酮，PVP）中后异位表征。独立合成的Pd（PVP）NPs是具有催化作用的物质，其催化活性与Pd（OAc）2相称在几个CH键的官能化反应中。在一系列反应中，Pd浓度是一个共同变量，可以使用极性溶剂（例如DMF，DMSO和乙酸）在工作催化条件下与PdNP的扩散相关。