N4-{[2-(4-nitrophenyl)ethoxy]carbonyl}-2'-O-(tetrahydro-4-methoxy-2H-pyran-4-yl)cytidine 3'-(2-cyanoethyl N,N-diisopropylphosphoramidite) 5'-[2-(2-nitrophenyl)propyl carbonate] | 1293390-75-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 核苷和核苷酸类似物
• 英文名称: N4-{[2-(4-nitrophenyl)ethoxy]carbonyl}-2'-O-(tetrahydro-4-methoxy-2H-pyran-4-yl)cytidine 3'-(2-cyanoethyl N,N-diisopropylphosphoramidite) 5'-[2-(2-nitrophenyl)propyl carbonate]
• CAS: 1293390-75-6
• 化学式: C₄₃H₅₆N₇O₁₆P
• 分子量: 957.929
• InChiKey: ZZCDOLSXNWOSTN-MGZJJGOOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.9
• 重原子数：
  67.0
• 可旋转键数：
  23.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  277.44
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  20.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  N⁴-<2-(4-nitrophenyl)ethoxycarbonyl>-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)cytidine 在 吡啶 、 四氮唑 、 D(+)-10-樟脑磺酸 、 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 46.17h， 生成 N4-{[2-(4-nitrophenyl)ethoxy]carbonyl}-2'-O-(tetrahydro-4-methoxy-2H-pyran-4-yl)cytidine 3'-(2-cyanoethyl N,N-diisopropylphosphoramidite) 5'-[2-(2-nitrophenyl)propyl carbonate]
  参考文献：
  名称：

  核苷酸。第LXXIX部分

  摘要：

  两个系列的新的核糖核苷3'-亚磷酰胺（参见36 - 42）承载光不稳定[2-（2-硝基苯基）丙氧基]羰基处的5'- Ò位上被合成和表征作为用于光刻合成单体结构单元RNA芯片。通过2-（4-硝基苯基）乙基（npe）和[2-（4-硝基苯基）乙氧基]羰基（npeoc）基团以众所周知的方式实现了碱保护。碳水化合物部分还带有2' - O-（四氢-4-甲氧基-2 H-吡喃-4-基）基团以阻断2'-OH功能。

  DOI：

  10.1002/hlca.201000403