3-[(1-甲基-4-硝基-1H-吡咯-2-羰基)-氨基]-丙酸叔丁酯 | 1007859-81-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: 3-[(1-甲基-4-硝基-1H-吡咯-2-羰基)-氨基]-丙酸叔丁酯
• 英文名称: 3-[(1-Methyl-4-nitro-1H-pyrrole-2-carbonyl)-amino]-propionic acid tert-butyl ester
• 英文别名: tert-butyl 3-(1-Methyl-4-nitro-1H-pyrrole-2-carboxamido)propanoate
• CAS: 1007859-81-5
• 化学式: C₁₃H₁₉N₃O₅
• 分子量: 297.311
• InChiKey: OZWBGFOFHJTQRE-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.39
• 重原子数：
  21.0
• 可旋转键数：
  5.0
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.54
• 拓扑面积：
  103.47
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  6.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-[(1-甲基-4-硝基-1H-吡咯-2-羰基)-氨基]-丙酸叔丁酯 在 palladium on activated charcoal 4-二甲氨基吡啶 、 三异丙基硅烷 、 氢气 、 1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 20.0h， 生成 N-[1-methyl-4-(1-methyl-4-nitro-pyrrole-2-carbonylamino)-pyrrole-2-carbonyl]-β-alanine
  参考文献：
  名称：

  5‘-Tethered Stilbene Derivatives as Fidelity- and Affinity-Enhancing Modulators of DNA Duplex Stability

  摘要：

  A series of 5'-linked stilbene-DNA conjugates with different substituents in the distal aromatic ring of the stilbene was prepared, and the effect of the modifications on duplex stability was determined via UV-melting curves. A trimethoxystilbene derivative as a 5'-substituent increases duplex melting points by up to 12.2 degrees C per modification. With this alkoxystilbene substituent, terminal mismatches in DNA duplexes lower the melting point by up to 23.4 degrees C over the perfectly matched control, whereas terminal mismatches in unmodified DNA cause melting point depressions of no more than 6.1 degrees C. An aminomethylstilbene substituent linked to an oligopyrrolamide minor groove binder increases the melting point of an all-A/T decamer by up to 32.7 degrees C, thus shifting the melting point into a range typical for duplexes with statistical G/C-content. An affinity- and selectivity-enhancing effect was also observed when the trimethoxystilbene cap was employed on a small DNA microarray. The phosphoramidite of the trimethoxystilbene can be readily employed in automatic DNA synthesis, facilitating the generation of DNA chips with improved fidelity.

  DOI：

  10.1021/ja0394434
• 作为产物：
  描述：

  beta-丙氨酸乙酯盐酸盐 、 1-甲基-4-硝基-2-(三氟乙酰)-1H-吡咯 在 三乙胺 作用下， 以 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 63.0h， 以90%的产率得到3-[(1-甲基-4-硝基-1H-吡咯-2-羰基)-氨基]-丙酸叔丁酯
  参考文献：
  名称：

  靶向神经胶质瘤细胞上的葡萄糖转运蛋白的糖结合位点选择性DNA甲基化剂。

  摘要：

  脱氧核糖核酸烷基化药物继续仍然是抵抗癌症的武器库中的重要武器。然而，由于它们引起的不加区别的DNA损伤以及它们不能特异性地靶向癌细胞，它们通常遭受若干缺点。我们已经开发出一种策略，通过设计一种可以靶向癌细胞的位点特异性DNA甲基化剂来克服当前DNA烷基化化疗药物的不足，因为它可以通过葡萄糖转运蛋白选择性地摄取，而葡萄糖转运蛋白在大多数癌症中都是过表达的。本文报道了该分子的设计特征，其合成，与DNA的反应性及其在人胶质母细胞瘤细胞中的毒性。在该分子中，可通过葡萄糖转运蛋白促进摄取的葡萄糖胺单元与双吡咯三酰胺单元的一端偶联，已知它会在富含A / T的区域与DNA的小沟结合。磺酸甲酯部分被束缚在双吡咯单元的另一端，以用作DNA甲基化剂。该分子与DNA反应后仅产生N3-甲基腺嘌呤加合物，并且对抗治疗的人成胶质细胞瘤细胞的毒性要比食品和药物管理局批准的糖化DNA甲基化药物链霉菌素高。使用我们分子的荧

  DOI：

  10.1021/acs.biochem.6b01075

文献信息

• Mechanistic Investigation of Site-specific DNA Methylating Agents Targeting Breast Cancer Cells
  作者：Leah L. Lowder、Matthew Powell、Sean E. Miller、Rigel J. Kishton、Charles B. Kelly、Connor B. Cribb、Kelly Mastro-Kishton、Manoj Chelvanambi、Phat T. Do、Rajeshwar Reddy Govindapur、Suzanne E. Wardell、Donald P. McDonnell、Libero J. Bartolotti、Giridhar R. Akkaraju、Arthur R. Frampton、Sridhar Varadarajan

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.1c00615

  日期：2021.9.9

  the essential role of ERα in modulating the toxicity. Minor alterations in the compound structure significantly affects the DNA binding ability, which correlates to the DNA-methylating ability. These studies demonstrate the utility of DNA-alkylating compounds to accomplish targeted inhibition of the growth of specific cancer cells; an approach that may overcome shortcomings of currently used chemotherapy

  我们之前描述了一种 DNA 烷基化化合物的开发，该化合物在乳腺癌细胞中显示出选择性毒性。该化合物含有雌激素受体 α (ERα) 结合配体和 DNA 结合/甲基化成分，可选择性甲基化 DNA 腺嘌呤-胸腺嘧啶丰富区域的腺嘌呤 N3 位。在此，我们描述了机制研究，证明此类化合物促进 ERα-化合物复合物向细胞核的易位并诱导 ERα 靶基因的表达。我们证实这些化合物在表达 ERα 的细胞中显示出选择性毒性，诱导 ERα 在细胞核中的定位，并验证了 ERα 在调节毒性中的重要作用。化合物结构的微小改变会显着影响 DNA 结合能力，这与 DNA 甲基化能力有关。这些研究证明了 DNA 烷基化化合物可用于实现对特定癌细胞生长的靶向抑制；一种可以克服目前使用的化疗药物缺点的方法。