diethyl α-acetamido-α-homopropargylmalonate | 209474-96-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: diethyl α-acetamido-α-homopropargylmalonate
• 英文别名: diethyl 2-acetamido-2-(but-3-yn-1-yl)malonate；Diethyl 2-acetamido-2-but-3-ynylpropanedioate；diethyl 2-acetamido-2-but-3-ynylpropanedioate
• CAS: 209474-96-4
• 化学式: C₁₃H₁₉NO₅
• 分子量: 269.298
• InChiKey: WAZHHSXVZYXUEI-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  410.5±45.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.122±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.1
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  81.7
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  diethyl α-acetamido-α-homopropargylmalonate 生成 D,L-2-amino-5-hexynoic acid
  参考文献：
  名称：

  通过非天然氨基酸体内掺入的蛋白质工程：通过蛋氨酸-tRNA合成酶控制蛋氨酸类似物的掺入

  摘要：

  将非天然氨基酸掺入是将新的化学和物理性质工程化为天然和人工蛋白质的重要​​策略。体内氨基酸向蛋白质中的掺入在很大程度上受氨酰基-tRNA合成酶（AARS）的控制。我们已经测量了通过甲硫基-tRNA合成酶（MetRS）通过ATP-PP i交换反应体外激活一组甲硫氨酸类似物的动力学常数。蛋氨酸类似物的体外活化与这些类似物在体内支持蛋白质合成的能力密切相关，从而证实了AARS在控制将非天然氨基酸掺入蛋白质中的关键作用。k cat / K m的蛋氨酸类似物该值比蛋氨酸的值低2000倍，可以支持在蛋白质表达的标准条件下合成典型目标蛋白质（mDHFR）。动力学常数与从常规细菌表达宿主观察到的蛋白质产量密切相关，表明宿主的MetRS活性可以在某些条件下控制蛋白质合成的水平。此外，增加细菌宿主的MetRS活性会导致补充蛋氨酸类似物高烯丙基甘氨酸和正亮氨酸的培养基中蛋白质的合成增加。这些结果表明了通过操纵细

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(00)00833-4
• 作为产物：
  描述：

  对甲苯磺酸 3-丁炔酯 、 乙酰氨基丙二酸二乙酯 在 potassium tert-butylate 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 50.0h， 生成 diethyl α-acetamido-α-homopropargylmalonate
  参考文献：
  名称：

  在体内将不饱和蛋氨酸类似物有效掺入蛋白质中

  摘要：

  在大肠杆菌中测定了一组八种甲硫氨酸类似物的翻译活性。市售的正缬氨酸和正亮氨酸与 2-氨基-5-己烯酸 (2)、2-氨基-5-己烯酸 (3)、顺式-2-氨基-4-己烯酸 (4) 一起测定、反式-2-氨基-4-己烯酸（5）、6,6,6-三氟-2-氨基己酸（6）和2-氨基庚酸（7），均由乙酰氨基丙二酸二乙酯烷基化制备用适当的甲苯磺酸盐，然后水解。用质粒 pREP4 和 pQE15 转化的大肠杆菌甲硫氨酸营养缺陷型 CAG18491 作为表达宿主，通过测定类似物在不存在的情况下支持测试蛋白质二氢叶酸还原酶 (DHFR) 合成的能力来测定翻译活性添加的蛋氨酸。与正亮氨酸 (9) 相比，正缬氨酸 (8) 和 7 均不显示翻译活性，这说明了氨基酸侧链长度的重要性，正亮氨酸 (9) 在测定条件下支持蛋白质合成。4 和 5 的内部烯烃功能阻止这些类似物掺入测试蛋白质中，氟化类似物 6 没有产生翻译活性的证据。然而，末端不饱和化合物

  DOI：

  10.1021/ja992749j

文献信息

• Copper-Free Sonogashira Cross-Coupling for Functionalization of Alkyne-Encoded Proteins in Aqueous Medium and in Bacterial Cells
  作者：Nan Li、Reyna K. V. Lim、Selvakumar Edwardraja、Qing Lin

  DOI：10.1021/ja2066913

  日期：2011.10.5

  Bioorthogonal reactions suitable for functionalization of genetically or metabolically encoded alkynes, for example, copper-catalyzed azide-alkyne cycloaddition reaction ("click chemistry"), have provided chemical tools to study biomolecular dynamics and function in living systems. Despite its prominence in organic synthesis, copper-free Sonogashira cross-coupling reaction suitable for biological applications

  适用于遗传或代谢编码炔烃功能化的生物正交反应，例如铜催化的叠氮化物-炔烃环加成反应（“点击化学”），为研究生物分子动力学和生命系统中的功能提供了化学工具。尽管它在有机合成中占有突出地位，但适用于生物应用的无铜 Sonogashira 交叉偶联反应尚未见报道。在这项工作中，我们报告了一种用于无铜 Sonogashira 交叉偶联的稳健氨基嘧啶-钯 (II) 复合物的发现，该复合物能够在水性介质中选择性功能化高丙炔基甘氨酸 (HPG) 编码的泛素蛋白。在温和的条件下，包括荧光团和氟化芳族化合物在内的各种芳族基团可以很容易地引入到含 HPG 的泛素中，并具有良好的产率。还证明了该反应适用于大肠杆菌中 HPG 编码的泛素功能化。这种新型催化系统的高效性将大大提高 Sonogashira 交叉偶联在生物正交化学中的效用。
• Protein Engineering by In Vivo Incorporation of Non-Natural Amino Acids: Control of Incorporation of Methionine Analogues by Methionyl-tRNA Synthetase
  作者：Kristi L. Kiick、David A. Tirrell

  DOI：10.1016/s0040-4020(00)00833-4

  日期：2000.11

  non-natural amino acids is an important strategy for engineering novel chemical and physical properties into natural and artificial proteins. The incorporation of amino acids into proteins in vivo is controlled in large part by the aminoacyl-tRNA synthetases (AARS). We have measured kinetic constants for in vitro activation of a set of methionine analogues by methionyl-tRNA synthetase (MetRS) via the

  将非天然氨基酸掺入是将新的化学和物理性质工程化为天然和人工蛋白质的重要​​策略。体内氨基酸向蛋白质中的掺入在很大程度上受氨酰基-tRNA合成酶（AARS）的控制。我们已经测量了通过甲硫基-tRNA合成酶（MetRS）通过ATP-PP i交换反应体外激活一组甲硫氨酸类似物的动力学常数。蛋氨酸类似物的体外活化与这些类似物在体内支持蛋白质合成的能力密切相关，从而证实了AARS在控制将非天然氨基酸掺入蛋白质中的关键作用。k cat / K m的蛋氨酸类似物该值比蛋氨酸的值低2000倍，可以支持在蛋白质表达的标准条件下合成典型目标蛋白质（mDHFR）。动力学常数与从常规细菌表达宿主观察到的蛋白质产量密切相关，表明宿主的MetRS活性可以在某些条件下控制蛋白质合成的水平。此外，增加细菌宿主的MetRS活性会导致补充蛋氨酸类似物高烯丙基甘氨酸和正亮氨酸的培养基中蛋白质的合成增加。这些结果表明了通过操纵细
• Synthesis of ω-(Hetero)arylalkynylated α-Amino Acid by Sonogashira-Type Reactions in Aqueous Media
  作者：Roberto J. Brea、M. Pilar López-Deber、Luis Castedo、Juan R. Granja

  DOI：10.1021/jo061300n

  日期：2006.9.1

  Mild conditions are described that allow the palladium-catalyzed cross-coupling of Cα-alkynylated glycine with a wide variety of electron-rich and electron-poor aryl and heteroaryl halides in aqueous media.

  温和的条件被描述，其允许C的钯-催化的交叉偶联α -alkynylated甘氨酸与各种在含水介质中富电子和缺电子的芳基和杂芳基卤化物的。
• Protein Glycosylation
  申请人：Davis Benjamin Guy

  公开号：US20110059501A1

  公开（公告）日：2011-03-10

  The present invention relates to methods for glycosylating a protein in which the protein is modified to include an alkyne and/or an azide group. The invention further relates to a protein glycosylated by these methods.
• Gold-Catalyzed Cycloisomerization of Alkyne-Containing Amino Acids: Controlled Tuning of C-N vs. C-O Reactivity
  作者：Noelia S. Medran、Matías Villalba、Ernesto G. Mata、Sebastián A. Testero

  DOI：10.1002/ejoc.201600429

  日期：2016.8

  Medran, Noelia Soledad. Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Rosario. Instituto de Quimica Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquimicas y Farmaceuticas. Instituto de Quimica Rosario; Argentina

  菲尔：梅德兰，诺埃莉亚·索莱达。Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas。Centro Cientifico Tecnologico Conicet - 罗萨里奥。Instituto de Quimica Rosario。罗萨里奥国立大学。Facultad de Ciencias Bioquimicas y Farmaceuticas。Instituto de Quimica Rosario；阿根廷