N-[3-(dimethylamino)propyl]-5-isopropyl-2-{[(1-methyl-4-nitro-1H-pyrrol-2-yl)carbonyl]amino}-1,3-thiazole-4-carboxamide | 566946-84-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 唑类
• 英文名称: N-[3-(dimethylamino)propyl]-5-isopropyl-2-{[(1-methyl-4-nitro-1H-pyrrol-2-yl)carbonyl]amino}-1,3-thiazole-4-carboxamide
• 英文别名: N-[3-(dimethylamino)propyl]-2-[(1-methyl-4-nitropyrrole-2-carbonyl)amino]-5-propan-2-yl-1,3-thiazole-4-carboxamide
• CAS: 566946-84-7
• 化学式: C₁₈H₂₆N₆O₄S
• 分子量: 422.508
• InChiKey: LZDDYSQGNYXTCK-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.2
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  153
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-[3-(dimethylamino)propyl]-5-isopropyl-2-{[(1-methyl-4-nitro-1H-pyrrol-2-yl)carbonyl]amino}-1,3-thiazole-4-carboxamide 在 palladium on activated charcoal 氢气 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 2-[(4-amino-1-methylpyrrole-2-carbonyl)amino]-N-[3-(dimethylamino)propyl]-5-propan-2-yl-1,3-thiazole-4-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  具有增强的亲脂性的双歧霉素类似物：合成和抗菌活性。

  摘要：

  描述了四十八个杂环氨基酸三聚体，它是二霉素的类似物，具有许多增强亲脂性的特征。它们含有比甲基大的烷基或环烷基；一些被乙酰胺或甲氧基苯甲酰胺N端基，并且被二甲氨基丙基或脂族杂环甲基氨基丙基取代基C端基。使用毛细管区带电泳已经评估了这些化合物主要结合至DNA AT束的能力。几种化合物，特别是那些含有噻唑的化合物，显示出对关键生物如MRSA和白色念珠菌的显着抗菌活性。而且，这些化合物对几种哺乳动物细胞系具有低毒性。

  DOI：

  10.1021/jm031089x
• 作为产物：
  描述：

  2-氨基-5-异丙基-1,3-噻唑-4-羧酸甲酯 在 N-甲基吗啉 、 氢氧化钾 、 氯化亚砜 作用下， 以 乙醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 N-[3-(dimethylamino)propyl]-5-isopropyl-2-{[(1-methyl-4-nitro-1H-pyrrol-2-yl)carbonyl]amino}-1,3-thiazole-4-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  具有增强的亲脂性的双歧霉素类似物：合成和抗菌活性。

  摘要：

  描述了四十八个杂环氨基酸三聚体，它是二霉素的类似物，具有许多增强亲脂性的特征。它们含有比甲基大的烷基或环烷基；一些被乙酰胺或甲氧基苯甲酰胺N端基，并且被二甲氨基丙基或脂族杂环甲基氨基丙基取代基C端基。使用毛细管区带电泳已经评估了这些化合物主要结合至DNA AT束的能力。几种化合物，特别是那些含有噻唑的化合物，显示出对关键生物如MRSA和白色念珠菌的显着抗菌活性。而且，这些化合物对几种哺乳动物细胞系具有低毒性。

  DOI：

  10.1021/jm031089x

文献信息

• Synthesis and antimicrobial activity of some netropsin analogues
  作者：Abedawn I. Khalaf、Abdolrasoul H. Ebrahimabadi、Allan J. Drummond、Nahoum G. Anthony、Simon P. Mackay、Colin J. Suckling、Roger D. Waigh

  DOI：10.1039/b408386p

  日期：——

  Nine novel lexitropsins were synthesized by linking two netropsin-like moieties through three different dicarboxylic acids; 9,10-dihydro-2,7-phenanthrenedicarboxylic acid; [(3-[(carboxymethyl)amino]carbonyl}benzoyl)amino]acetic acid and indole-2,5-dicarboxylic acid. The netropsin residues were modified by the use of N-isopentylpyrrole, 5-methylthiophene or 5-isopropylthiazole heterocyclic building blocks in place of the usual N-methylpyrrole. The compounds were tested against five gram-positive bacteria: Staphylococcus aureus, Streptomyces faecalis, methicillin resistant Staphylococcus aureus, Enterobacter cloacae, Mycobacterium fortuitum, three gram-negative bacteria: Klebsiella aerogenes, Proteus vulgaris, Escherichia coli and three fungi: Aspergillus niger, Candida albicans and Aspergillus nidulans. Some of the compounds showed significant inhibitory effects on the growth of the microorganisms.

  合成了九种新型lexitropsin，通过三种不同的二羧酸（9,10-二氢-2,7-菲二羧酸；[(3-[(羧甲基)氨基]羰基}苯甲酰)氨基]乙酸和吲哚-2,5-二羧酸）将两个类似netropsin的部分连接在一起。通过使用N-异戊基吡咯、5-甲基噻吩或5-异丙基噻唑异构体构建单元替代通常的N-甲基吡咯，对netropsin残基进行修饰。将这些化合物分别针对五种革兰阳性菌：金黄色葡萄球菌、肠球菌、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、克雷伯氏菌和偶然分枝杆菌，三种革兰阴性菌：气单胞菌、变形杆菌、大肠杆菌，以及三种真菌：黑曲霉、白念珠菌和安氏曲霉进行了测试。其中一些化合物对微生物的生长表现出显著的抑制作用。
• Distamycin Analogues with Enhanced Lipophilicity:  Synthesis and Antimicrobial Activity
  作者：Abedawn I. Khalaf、Roger D. Waigh、Allan J. Drummond、Breffni Pringle、Ian McGroarty、Graham G. Skellern、Colin J. Suckling

  DOI：10.1021/jm031089x

  日期：2004.4.1

  Forty-eight heterocyclic amino acid trimers, analogues of distamycin, with a number of features that enhance lipophilicity are described. They contain alkyl or cycloalkyl groups larger than methyl; some are N-terminated by acetamide or methoxybenzamide and are C-terminated by dimethylaminopropyl or aliphatic heterocylic aminopropyl substituents. The ability of these compounds to bind principally to

  描述了四十八个杂环氨基酸三聚体，它是二霉素的类似物，具有许多增强亲脂性的特征。它们含有比甲基大的烷基或环烷基；一些被乙酰胺或甲氧基苯甲酰胺N端基，并且被二甲氨基丙基或脂族杂环甲基氨基丙基取代基C端基。使用毛细管区带电泳已经评估了这些化合物主要结合至DNA AT束的能力。几种化合物，特别是那些含有噻唑的化合物，显示出对关键生物如MRSA和白色念珠菌的显着抗菌活性。而且，这些化合物对几种哺乳动物细胞系具有低毒性。
• An evaluation of Minor Groove Binders as anti-lung cancer therapeutics
  作者：Fraser J. Scott、Mireia Puig-Sellart、Abedawn I. Khalaf、Catherine J. Henderson、Gareth Westrop、David G. Watson、Katharine Carter、M. Helen Grant、Colin J. Suckling

  DOI：10.1016/j.bmcl.2016.06.040

  日期：2016.8

  activity by screening against the melanoma cancer cell line B16-F10. Five compounds have been found to possess significant activity, more so than a standard therapy, Gemcitabine. Moreover, one compound has been found to have an activity around 70-fold that of Gemcitabine and has a favourable selectivity index of greater than 125. Furthermore, initial studies have revealed this compound to be metabolically

  通过针对黑素瘤癌细胞系B16-F10进行筛选，评估了一系列47种结构多样的MGB（源自天然产物双歧霉素）的抗肺癌活性。已经发现有五种化合物具有显着的活性，比标准疗法吉西他滨具有更多的活性。此外，已发现一种化合物的活性约为吉西他滨的70倍，且选择性指数大于125。此外，初步研究表明该化合物具有代谢稳定性，因此代表了进一步优化的先导寻求一种新型的肺癌治疗方法。
• Dna minor groove binding compounds
  申请人：Khalaf Abedawn

  公开号：US20070117760A1

  公开（公告）日：2007-05-24

  There is provided an oligopeptide compound comprising: (a) at least one nitrogen-containing basic group attached to at least one end of the oligopeptide; and (b) two or more heterocyclic monomers, at least one of which is substituted in the heterocyclic part by a branched, cyclic or part cyclic C 3-5 alkyl group, or a pharmaceutically acceptable salt or solvate thereof; which compound, salt or solvate binds to the minor groove of DNA.

  提供一种寡肽化合物，包括：（a）至少一个含氮的碱性基团连接到寡肽的至少一个末端；以及（b）两个或更多的杂环单体，其中至少一个在杂环部分被支链、环状或部分环状的C3-5烷基取代，或其药学上可接受的盐或溶剂；该化合物、盐或溶剂与DNA的小沟结合。
• 10.1016/j.bioorg.2024.107414
  作者：Alniss, Hasan Y.、Kemp, Bryony M.、Holmes, Elizabeth、Hoffmann, Joanna、Ploch, Rafal M.、Ramadan, Wafaa S.、Msallam, Yousef A.、Al-Jubeh, Hadeel M.、Madkour, Moustafa M.、Celikkaya, Bekir C.、Scott, Fraser J.、El-Awady, Raafat、Parkinson, John A.

  DOI：10.1016/j.bioorg.2024.107414

  日期：——

  ligands were reflected in the line shape and intensity of 1D H and P-H} NMR spectra. Rapid visual inspection of these 1D NMR spectra proves to be beneficial in providing valuable insights on MGB binding molecules. The NMR results were consistent with the findings from both UV DNA denaturation and molecular modelling studies. Both the NMR spectroscopic and computational analyses indicate that the investigated

  光谱、生化和计算模型研究已用于评估一组小沟结合 (MGB) 配体对自我互补 DNA 序列 5'-d(CGCGCG)-3' 和 5'-d( CGCGCG)-3′。配体经过精心设计，以 DNA 响应元件 5'-WGWWCW-3' 为靶点，它是几种核受体的结合位点。用三种 MGB 配体制备的 DNA 样品的基本 1D H NMR 谱显示出细微的变化，表明每种配体如何与两种 DNA 序列的双螺旋结构结合。所研究的配体之间的变化反映在 1D H 和 P-H} NMR 谱的线形和强度中。事实证明，对这些 1D NMR 谱进行快速目视检查有助于提供有关 MGB 结合分子的宝贵见解。 NMR 结果与 UV DNA 变性和分子建模研究的结果一致。核磁共振波谱和计算分析均表明，所研究的配体以头尾相连的方式作为反平行并排二聚体与小沟结合。此外，与生化研究结果的比较为了解 MGB 的作用机制以及与其结构相关的抗肿瘤活性提供了宝贵的见解，这是未来优化