methyl (1-adamantanyl 5-acetamido-4,7,8,9-tetra-O-acetyl-3,5-dideoxy-2-thio-D-glycero-β-D-galacto-non-2-ulopyranosid)onate | 956107-37-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: methyl (1-adamantanyl 5-acetamido-4,7,8,9-tetra-O-acetyl-3,5-dideoxy-2-thio-D-glycero-β-D-galacto-non-2-ulopyranosid)onate
• 英文别名: methyl (2R,4S,5R,6R)-5-acetamido-4-acetyloxy-2-(1-adamantylsulfanyl)-6-[(1S,2R)-1,2,3-triacetyloxypropyl]oxane-2-carboxylate
• CAS: 956107-37-2
• 化学式: C₃₀H₄₃NO₁₂S
• 分子量: 641.737
• InChiKey: BTSKOXYCXLWGMY-MMQLUSCTSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.7
• 重原子数：
  44
• 可旋转键数：
  16
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.8
• 拓扑面积：
  195
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (1-adamantanyl 5-acetamido-4,7,8,9-tetra-O-acetyl-3,5-dideoxy-2-thio-D-glycero-β-D-galacto-non-2-ulopyranosid)onate 在 吡啶 、 5%-palladium/activated carbon 、 氢气 、 sodium isopropylate 、 溶剂黄146 、 barium(II) hydroxide 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 二氯甲烷 、 2,2,2-三氟乙醇 、 水 、 异丙醇 、 乙腈 为溶剂， -78.0~60.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 反应 35.3h， 生成 methyl O-(5-acetamido-3,5-dideoxy-D-glycero-α-D-galacto-2-nonulopyranosylonic acid)-(2->3)-O-β-D-galactopyranoside
  参考文献：
  名称：

  与假氨基酸苷相关的 5-epi-α-Sialoside 的立体选择性合成。 5-叠氮基-5-去乙酰氨基唾液酸硫代糖苷立体选择性的重新评估以及三氟甲磺酸酯作为亲核试剂在唾液酸 Zbiral 脱氨中的应用

  摘要：

  为了最终合成用于立体控制合成假氨基酸糖苷的糖基供体，描述了在5-位携带轴向叠氮化物的d-甘油-d-古洛糖唾液酸金刚烷基硫糖苷的立体控制合成。该合成采用乙酰丙酸作为亲核试剂，对N-乙酰神经氨酸硫代糖苷进行氧化脱氨，从而形成选择性保护为 5- O的 3-脱氧-d-甘油-d-半乳糖-2-nonulosonic 酸 (KDN) 衍生物-乙酰丙酸。用三氟甲磺酸酯替代乙酰丙酸酯能够引入轴向叠氮化物，从而形成糖基供体。当直接获得 5- O-三氟甲磺酸基 KDN 衍生物时，更短的合成在氧化脱氨步骤中使用三氟甲磺酸盐作为亲核试剂。在-78℃下用5-叠氮基-d-甘油-d- gulo配置的唾液酸金刚烷基硫代糖苷进行的糖基化反应对于赤道糖苷的形成具有选择性，这表明赤道伪胺酸糖苷的合成将有可能作为合适的供体变得可用。还发现在 5 位带有赤道叠氮化物的类似N-乙酰神经氨酸金刚烷硫糖苷在相同条件下对赤道糖苷形成具有选择

  DOI：

  10.1021/acs.joc.6b02221
• 作为产物：
  描述：

  N-acetyl neuraminic acid 在 三氟化硼 作用下， 生成 methyl (1-adamantanyl 5-acetamido-4,7,8,9-tetra-O-acetyl-3,5-dideoxy-2-thio-D-glycero-β-D-galacto-non-2-ulopyranosid)onate
  参考文献：
  名称：

  通过侧链交换从 N-乙酰神经氨酸合成 Legionaminic 酸、Pseudaminic 酸、乙酰氨基酸、8-epi-乙酰氨基酸和 8-epi-Legionaminic 酸糖基供体

  摘要：

  N-乙酰神经氨酸衍生的硫代糖苷甘油侧链的高碘酸裂解，并与 Ellman 亚磺酰胺的两种对映体缩合，得到两种非对映体N-亚磺酰亚胺，细菌唾液酸供体具有军团胺酸和乙酰氨基酸构型及其 8-表异构体是通过碘化钐介导的与乙醛的偶联和随后的操作获得的。主题的变体，在 C5 处反转配置，类似地提供了两个不同保护的假氨基酸供体。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.2c00894

文献信息

• Synthesis and intramolecular glycosylation of sialyl mono-esters of o-xylylene glycol. The importance of donor configuration and nitrogen protecting groups on cyclization yield and selectivity; isolation and characterization of a N-sialyl acetamide indicative of participation by acetonitrile
  作者：Harsha Amarasekara、David Crich

  DOI：10.1016/j.carres.2016.09.019

  日期：2016.11

  The synthesis and cyclization reactions, leading to spirocyclic medium ring-sized diolides, of o-(hydroxymethyl)xylylene monoesters of sialyl thioglycosides is described. Cyclization yields and stereoselectivities are found to vary as a function of the anomeric stereochemistry of the thioglycoside and of the N5 protecting group, and these effects are discussed in terms of the reaction mechanism. Cyclization

  描述了合成和环化反应，导致唾液酸基硫代糖苷的邻-（羟甲基）二甲苯基单酯形成螺环中等大小的环糊精。发现环化产率和立体选择性根据硫代糖苷和N5保护基的异头立体化学而变化，并且根据反应机理讨论了这些作用。在乙腈存在下的环化导致Ritter型N-唾液酸乙酰胺的分离和表征，这为乙腈以唾液酸腈离子的形式参与提供了有力的证据。
• Synthesis and Stereocontrolled Equatorially Selective Glycosylation Reactions of a Pseudaminic Acid Donor: Importance of the Side-Chain Conformation and Regioselective Reduction of Azide Protecting Groups
  作者：Bibek Dhakal、David Crich

  DOI：10.1021/jacs.8b09654

  日期：2018.11.7

  Pseudaminic acid is an amino deoxy sialic acid whose glycosides are essential components of many pathogenic Gram-negative bacterial cell walls including those from Pseudomonas aeruginosa, Vibrio cholerae, Campylobacter jejuni, Campylobacter coli, Vibrio vulnificus, and Pseudoalteromonas distincta. The study of pseudaminic acid glycosides is however hampered by poor availability from nature and the

  Pseudaminic acid 是一种氨基脱氧唾液酸，其糖苷是许多致病性革兰氏阴性细菌细胞壁的必需成分，包括来自铜绿假单胞菌、霍乱弧菌、空肠弯曲杆菌、大肠杆菌、创伤弧菌和不同假交替单胞菌的细胞壁。然而，对伪胺酸糖苷的研究受到自然界可用性差和缺乏良好合成方法的阻碍，并且仅限于不了解控制立体选择性的因素。对各种立体异构唾液酸侧链的构象分析表明，与 N-乙酰神经氨酸的 gauche、gauche 构象和 gauche 构象相反，假氨基酸的侧链将占据最多的吸电子反式、gauche 构象。 , 7-epi N-乙酰神经氨酸的反式构象，导致高赤道选择性的预测。这一预测是通过从 N-乙酰神经氨酸以 20 步和 5% 的总产率合成适当保护的假氨酸供体以及它在与典型糖基受体的偶联反应中表现出的精细赤道选择性而得到证实的。糖基化反应的选择性进一步得到了从相应叠氮化物区域选择性释放两种胺的条件的发展和实施的支
• Influence of Side Chain Conformation and Configuration on Glycosyl Donor Reactivity and Selectivity as Illustrated by Sialic Acid Donors Epimeric at the 7-Position
  作者：Pavan K. Kancharla、David Crich

  DOI：10.1021/ja410683y

  日期：2013.12.18

  selectivity is also attributed to the side conformation, which in the unnatural 7R-series is placed perpendicularly above the α-face of the donor and so shields it to a greater extent than in the 7S-series. These observations are consistent with earlier conclusions on the influence of the side chain conformation on reactivity and selectivity derived from conformationally locked models in the glucose and galactose

  合成了两个 N-乙酰基 4O,5N-恶唑烷酮保护的 7 位唾液酸硫糖苷差向异构体，并比较了它们在糖基化反应中的反应性和立体选择性。结果表明，天然 7S 供体比非天然 7R 异构体更具反应性和 α 选择性。反应性的差异归因于侧链构象，特别是 O7 与异头中心的接近程度。在天然 7S 异构体中，O7 比在其非天然 7R 差向异构体中更靠近异头异构体中心，因此能够更好地支持反应位点处的初始正电荷。选择性的差异也归因于侧构象，在非自然的 7R 系列中，它垂直放置在供体的 α 面上方，因此比 7S 系列更大程度地屏蔽它。这些观察结果与从葡萄糖和半乳糖系列中的构象锁定模型得出的侧链构象对反应性和选择性影响的早期结论一致，并证实了这些影响主要是立体电子而不是扭转的建议。讨论了侧链构象作为远程保护基团影响糖基化立体选择性的一个因素以及作为糖苷键形成和水解酶促过程中的控制元素的可能相关性。对唾液酸糖苷中异头
• Oxidative Deamination of <i>N</i>-Acetyl Neuraminic Acid: Substituent Effects and Mechanism
  作者：Szymon Buda、David Crich

  DOI：10.1021/jacs.5b13015

  日期：2016.1.27

  mechanism of the oxidative deamination of the N-nitroso-N-acetyl sialyl glycosides leading with overall retention of configuration to the corresponding 2-keto-3-deoxy-D-glycero-D-galacto-nonulopyranosidonic acid (KDN) glycosides is described, making use of a series of differentially O-protected N-nitroso-N-acetyl sialyl glycosides and of isotopic labeling studies. No evidence is found for stereodirecting participation

  研究 N-亚硝基-N-乙酰基唾液酸糖苷的氧化脱氨机制，从而整体保留相应的 2-酮-3-脱氧-D-甘油-D-半乳糖-壬基吡喃糖苷酸 (KDN)利用一系列差异性 O-保护的 N-亚硝基-N-乙酰基唾液酸糖苷和同位素标记研究描述了糖苷。没有发现 4- 和 7- 位酯基参与立体定向的证据。比较了 4-氨基-4-脱氧和 2-氨基-2-脱氧吡喃己糖苷的氧化脱氨反应，并制定了一个共同机制，涉及吡喃糖苷参与后 1-氧杂双环[3.1.0]己基氧鎓离子的中介作用环氧。通过对 β-硫唾液酸苷的标记研究发现了一条次要反应途径，该途径导致 4-O-乙酰基被冰醋酸交换，冰醋酸在一般氧化脱氨过程中充当外部亲核试剂。提出了一种涉及硫代糖苷在中间体重氮烷水平参与的交换机制。
• Chemical Diversification of Sialic Acid Glycosides by Stereospecific, Chemoselective Deamination
  作者：Chandrasekhar Navuluri、David Crich

  DOI：10.1002/anie.201303781

  日期：2013.10.18

  Late bloomer: Nitrosation of peracetylated sialic acid glycosides followed by treatment with sodium trifluoroethoxide and then a suitable nucleophile enables the late‐stage modification of these glycosides with stereospecific replacement of the acetamido group. This method should enable access to many glycoside derivatives with a minimum of synthetic effort.

  大器晚成：全乙酰化的唾液酸糖苷的亚硝化，接着用三氟乙醇钠处理，然后合适的亲核使这些甙与立体有择更换乙酰胺基的后期阶段修饰。这种方法应该能够以最少的合成工作获得许多糖苷衍生物。