(S)-6-amino-2-((S)-2-(2-((S)-2-((R)-2-amino-3-mercaptopropanamido)-3-phenylpropanamido)acetamido)-5-guanidinopentanamido)hexanamide | 1327337-27-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (S)-6-amino-2-((S)-2-(2-((S)-2-((R)-2-amino-3-mercaptopropanamido)-3-phenylpropanamido)acetamido)-5-guanidinopentanamido)hexanamide
• 英文别名: H-CFGRK-NH₂
• CAS: 1327337-27-8
• 化学式: C₂₆H₄₄N₁₀O₅S
• 分子量: 608.765
• InChiKey: PXIJAQPOVWHJHJ-MUGJNUQGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.07
• 重原子数：
  42.0
• 可旋转键数：
  20.0
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.54
• 拓扑面积：
  273.43
• 氢给体数：
  11.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (S)-6-amino-2-((S)-2-(2-((S)-2-((R)-2-amino-3-mercaptopropanamido)-3-phenylpropanamido)acetamido)-5-guanidinopentanamido)hexanamide 、 C₃₆H₅₅N₁₁O₉S 在 4-巯基苯基乙酸 、 三(2-羰基乙基)磷盐酸盐 作用下， 反应 72.0h， 生成 C₄₇H₇₆N₁₈O₁₂S
  参考文献：
  名称：

  N -Fmoc氨基酰基-N-硫烷基乙基苯胺接头作为隐肽硫酯前体的合成方法及其在天然化学连接中的应用

  摘要：

  可使用基于Fmoc的固相肽合成（Fmoc SPPS）获得的N-硫烷基乙基苯胺（SEAlide）肽1在天然化学连接（NCL）中用作隐硫酯，可产生多种肽/蛋白质。它们在N端半胱氨酰肽2上的酰化潜力可通过存在或不存在磷酸盐来调节，从而导致一锅/多片段连接，并在动力学控制的条件下运行。已经证明SEAlide肽有望用于蛋白质合成。然而，一种广泛适用的合成N -Fmoc氨基酰基-N-硫烷基乙基苯胺接头的方法4无法获得制备SEAlide肽所需的。本研究解决了20种天然存在的氨基酸衍生物与N-硫烷基乙基苯胺接头5的有效缩合方案的发展。通过将POCl 3-或SOCl 2活化的Fmoc氨基酸衍生物与钠偶合，成功合成了NCL化学中实际使用的N -Fmoc氨基酰基苯胺接头4苯胺类6，但不伴随外消旋作用和侧链保护作用的丧失。此外，SEAlide肽7 具有各种C末端氨基酸（Gly，His，Phe，Ala，Asn，Se

  DOI：

  10.1021/jo3011107
• 作为产物：
  描述：

  Fmoc-甘氨酸 、 Fmoc-L-苯丙氨酸 、 N-alpha-芴甲氧羰基-N-epsilon-叔丁氧羰基-L-赖氨酸 、 Fmoc-S-三苯甲基-L-半胱氨酸 、 Fmoc-Pbf-L-精氨酸 在 4-二甲氨基吡啶 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 哌啶 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 12.17h， 以6%的产率得到(S)-6-amino-2-((S)-2-(2-((S)-2-((R)-2-amino-3-mercaptopropanamido)-3-phenylpropanamido)acetamido)-5-guanidinopentanamido)hexanamide
  参考文献：
  名称：

  CPaseY介导的肼解作用制备不依赖序列的无痕方法制备肽/蛋白质硫酯

  摘要：

  结合了人工部分（例如荧光团和药物）的蛋白质已在化学生物学和药物开发研究中得到越来越多的使用。这种人工蛋白质衍生物的制备主要依赖于天然化学连接，其中肽/蛋白质硫酯与N-末端半胱氨酸（Cys）肽化学选择性反应以提供蛋白质分子。衍生自表达蛋白质的蛋白质硫酯代表硫酯，通过与具有N端Cys的合成肽进行天然化学连接，对于制备人工蛋白质非常有用。我们最近开发了一种使用羧肽酶Y（CPaseY）的无痕硫代酸酯生产协议，该协议可与表达的蛋白质相容。通过CPaseY介导的C端Xaa（X）-Cys-脯氨酸（Pro）-亮氨酸（Leu）-OH序列的肼解反应，然后自动处理Cys-Pro（CP）二肽单元，确保了无痕特征。得到相应的X-硫酯（X-SR）。但是，脯氨酰亮氨酸连接处酰胺键的肼解作用很大程度上取决于X的性质。在疏水性X残基的情况下，肼解反应会过度反应生成数个酰肼，而亲水性X残基的反应则缓慢进行。在这项研究中，我们

  DOI：

  10.1248/cpb.c20-00674
• 作为试剂：
  描述：

  4-巯基苯基乙酸 、 在 sodium nitrite 、 (S)-6-amino-2-((S)-2-(2-((S)-2-((R)-2-amino-3-mercaptopropanamido)-3-phenylpropanamido)acetamido)-5-guanidinopentanamido)hexanamide 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 反应 0.55h， 生成 、 、
  参考文献：
  名称：

  使用酶介导的肼解反应和随后的半胱氨酰基脯氨酰序列的自我编辑实现痕量蛋白质硫代酯的合成†

  摘要：

  已经开发出了一种无痕硫酯生产方案，该方案以羧基肽酶Y介导的半胱氨酸脯氨酰亮氨酸标记的肽的肼解作用为特征。肼解，然后硫酯化得到半胱氨酰基脯氨酰基硫酯。标签的自编辑和随后的反式硫代酯化产生肽硫酯。所开发的方案已成功应用于重组蛋白向硫酯的转化。

  DOI：

  10.1039/c9cc03583d

文献信息

• Resin-Bound Crypto-Thioester for Native Chemical Ligation
  作者：Naoto Naruse、Kento Ohkawachi、Tsubasa Inokuma、Akira Shigenaga、Akira Otaka

  DOI：10.1021/acs.orglett.8b00795

  日期：2018.4.20

  absence of phosphate salts to afford ligated products, whereas soluble SEAlide peptides do not. This unexpected difference in reactivity of the SEAlide peptides allows for a one-pot/three-fragment ligation using resin-bound and unbound peptides.

  发现与树脂结合的N-硫烷基乙基苯胺（SEAlide）肽起隐硫基硫酯肽的作用。将肽树脂在硫醇的存在下于中性条件下暴露于水溶液中，可得到硫酯，而不会伴随C末端氨基酸的消旋化。此外，在不存在磷酸盐的情况下，树脂结合的SEAlide肽与N端半胱氨酸肽反应生成连接产物，而可溶性SEAlide肽则没有。SEAlide肽反应性的这种出乎意料的差异允许使用树脂结合和未结合的肽进行一锅/三片段连接。