(-)-aspergilazine A

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (-)-aspergilazine A
• 英文别名: (3S,8aS)-3-[[6-[3-[[(3S,8aS)-1,4-dioxo-2,3,6,7,8,8a-hexahydropyrrolo[1,2-a]pyrazin-3-yl]methyl]indol-1-yl]-1H-indol-3-yl]methyl]-2,3,6,7,8,8a-hexahydropyrrolo[1,2-a]pyrazine-1,4-dione
• 化学式: C₃₂H₃₂N₆O₄
• 分子量: 564.644
• InChiKey: NSYGZMOQHOPGSY-XEZODYMFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.7
• 重原子数：
  42
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  120
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  6-溴-1-甲苯磺酰-1H-吲哚 在 sodium dihydrogenphosphate 、 copper(l) iodide 、 三甲基氯硅烷 、 碘代三甲硅烷 、 sodium amalgam 、 mercury(II) diacetate 、 碘 、 四丁基硫酸氢铵 、 silica gel 、 potassium carbonate 、 potassium hydroxide 、 N,N'-二甲基乙二胺 、 锌 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 1,2-二溴乙烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 、 乙腈 为溶剂， 反应 84.0h， 生成 (-)-aspergilazine A
  参考文献：
  名称：

  CAr–N键形成的吲哚-吲哚乌尔曼交叉偶联：（-）-曲霉嗪A的全合成

  摘要：

  开发了一种新的合成方法，用于异二聚体bis-Trp / Pro-diketopiperazine生物碱（-）-aspergilazineA。该方法基于先前优化的Cu I催化的吲哚单元的C Ar -N Ullmann偶联。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201700842

文献信息

• A Mild and General Larock Indolization Protocol for the Preparation of Unnatural Tryptophans
  作者：Kangway V. Chuang、Madeleine E. Kieffer、Sarah E. Reisman

  DOI：10.1021/acs.orglett.6b02477

  日期：2016.9.16

  A mild and general protocol for the Pd(0)-catalyzed heteroannulation of o-bromoanilines and alkynes is described. Application of a Pd(0)/P(tBu)3 catalyst system enables the efficient coupling of o-bromoanilines at 60 °C, mitigating deleterious side reactions and enabling access to a broad range of useful unnatural tryptophans. The utility of this new protocol is demonstrated in the highly convergent

  描述了一种温和而通用的协议，用于Pd（0）催化邻溴代苯胺和炔烃的杂环化反应。Pd（0）/ P（t Bu）3催化剂体系的应用使邻溴代苯胺在60°C时能有效偶联，从而减轻了有害的副反应并能接触到各种有用的非天然色氨酸。该新方案的效用在双吲哚天然产物（-）-aspergilazine A的高度收敛的全合成中得到了证明。
• Structure and Function of NzeB, a Versatile C–C and C–N Bond-Forming Diketopiperazine Dimerase
  作者：Vikram V. Shende、Yogan Khatri、Sean A. Newmister、Jacob N. Sanders、Petra Lindovska、Fengan Yu、Tyler J. Doyon、Justin Kim、K. N. Houk、Mohammad Movassaghi、David H. Sherman

  DOI：10.1021/jacs.0c06312

  日期：2020.10.14

  To identify the molecular basis for the flexible site-, stereo-, and chemoselectivity of NzeB, we obtained high-resolution crystal structures (1.5Å) of the protein in complex with native and non-native substrates. This, to our knowledge, represents the first crystal structure of an oxidase catalyzing direct, intermolecular C-H amination. Site-directed mutagenesis was employed to assess the role individual

  二聚二酮哌嗪 (DKPs) 生物碱是一个多样化的天然产物 (NPs) 家族，其独特的结构结构和生物活性激发了开发新的合成方法来获取这些分子。然而，缺乏能够从单个单体选择性形成结构和立体异构二聚体的催化剂控制方法。为了解决这一长期存在的合成挑战，我们试图表征组装这些 NPs 以用于生物催化合成的生物合成酶。基因组挖掘能够鉴定细胞色素 P450、NzeB（源自 Streptomyces sp. NRRL F-5053），它催化分子间碳 - 碳（CC）和碳 - 氮（CN）键的形成，生成所有目前已知的分离的 DKP 二聚体支架从细菌来源。为了确定 NzeB 灵活的位点、立体和化学选择性的分子基础，我们获得了与天然和非天然底物复合的蛋白质的高分辨率晶体结构 (1.5Å)。据我们所知，这代表了催化直接分子间 CH 胺化的氧化酶的第一个晶体结构。采用定点诱变来评估单个活性位点残基在指导选择性 DKP 二
• Total Synthesis of (−)-Aspergilazine A
  作者：Emily M. Boyd、Jonathan Sperry

  DOI：10.1021/ol5024097

  日期：2014.10.3

  The total synthesis of (-)-aspergilazine A, an alkaloid possessing a rare N1' to C6 bisindole bond, is described. A palladium-catalyzed N-arylation was used to selectively install the N1'-C6 bond in the presence of three other possible arylation sites. The ligand XPhos displayed a unique capability to efficiently carry out the N-arylation while simultaneously suppressing epimerization of the sensitive C9 stereocenters. This total synthesis has confirmed that aspergilazine A is a dimer of brevianamide F.
• Two Cytochrome P450 Enzymes from <i>Streptomyces</i> sp. NRRL S-1868 Catalyze Distinct Dimerization of Tryptophan-Containing Cyclodipeptides
  作者：Huili Yu、Shu-Ming Li

  DOI：10.1021/acs.orglett.9b02666

  日期：2019.9.6

  Heterologous expression in Streptomyces coelicolor and in vitro enzyme characterization proved that two P450 enzymes, AspB and NasB, from Streptomyces sp. NRRL S-1868 catalyze two new dimerization patterns of tryptophan-containing cyclodipeptides. Structure elucidation of the metabolites revealed an N1-C7' dimer of two cWP molecules as the predominant product of AspB and C3-C7' connected cWP with cWA as that of NasB.