Methyl 2,3,6-tri-O-benzyl-4-deoxy-α-D-lyxo-hexopyranoside | 141936-75-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: Methyl 2,3,6-tri-O-benzyl-4-deoxy-α-D-lyxo-hexopyranoside
• 英文别名: (2S,3S,4S,6S)-2-methoxy-3,4-bis(phenylmethoxy)-6-(phenylmethoxymethyl)oxane
• CAS: 141936-75-6
• 化学式: C₂₈H₃₂O₅
• 分子量: 448.559
• InChiKey: OPOSOZAEZRCTBP-LJWNLINESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.5
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  46.2
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Methyl 2,3,6-tri-O-benzyl-4-deoxy-α-D-lyxo-hexopyranoside 在 palladium on activated charcoal 氢气 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 19.0h， 以316 mg的产率得到methyl 4-deoxy-α-D-lyxo-hexopyranoside
  参考文献：
  名称：

  双脱氧五糖的化学合成酶法合成，用于研究N-乙酰基-氨基葡萄糖氨基转移酶-III的特异性。

  摘要：

  双天线寡糖苷β-D-GlcpNAc-（1 ---- 2）-alpha-D-Manp-（1 ---- 3）-[β-D-GlcpNAc-（1 ---- 2）- α-D-Manp-（（1 ---- 6）]-β-D-Manp-OR是N-乙酰氨基葡萄糖基转移酶（GlcNAcTs）III-V的潜在底物。双脱氧五糖苷β-D-GlcpNAc-（1 ---- 2）-4-脱氧α-D-lyxo-Hexp-（1 ---- 3）-[β-DGlcpNAc-（1 ---- 2）-6-脱氧-α-D-Manp-（（1 ---- 6）] beta-D-Manp-O（CH2）7CH3（5），其中GlcNAcT IV和V已被除去，被制备为GlcNAcT-III的可能的特异性受体。该策略涉及β-D-GlcpNAc-（1 ---- 2）-4-deoxy-alpha-D-lyxo-Hexp-（1 ---- 3）-] 6-deoxy-a

  DOI：

  10.1016/0008-6215(92)84069-5
• 作为产物：
  描述：

  methyl-4,6-O-phenylmethylene-α-D-mannopyranoside 在 咪唑 、 盐酸 、 三正丁基氢锡 、 sodium hydride 、 sodium cyanoborohydride 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 正己烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 14.0h， 生成 Methyl 2,3,6-tri-O-benzyl-4-deoxy-α-D-lyxo-hexopyranoside
  参考文献：
  名称：

  Pradimicin A的甘露糖结合几何

  摘要：

  Pradimicins（PRMs）和benanomicins是唯一具有类凝集素特性的非肽类天然产物家族，也就是说，它们在存在Ca 2+的情况下识别D-甘露吡喃糖苷（Man）。离子。结合其独特的Man结合能力，它们通过与病原体的Man聚糖结合而具有抗真菌和抗HIV的活性。尽管PRM作为凝集素模拟物和治疗先导具有巨大潜力，但它们对Man识别的分子基础尚未建立。它们的聚集体形成倾向阻碍了溶液中的常规相互作用分析，并且由于PRM中存在两个Man结合位点，加剧了分析难度。在这项工作中，我们通过最近开发的分析策略，使用由PRM‐A和Man的1：1配合物组成的固体聚集体，研究了PRMs的原始成员PRM‐A的主要Man结合的几何形状。通过固态NMR光谱对分子间距离的评估表明，Man的C2-C4区与PRM-A的主要结合位点紧密接触，而Man的C1和C6位置相对较远。通过使用脱氧曼衍生物的共沉淀实验进一步验证

  DOI：

  10.1002/chem.201301368

文献信息

• Combined chemical-enzymic synthesis of a dideoxypentasaccharide for use in a study of the specificity of N-acetyl-glucosaminyltransferase-III
  作者：Kanwal J. Kaur、Ole Hindsgaul

  DOI：10.1016/0008-6215(92)84069-5

  日期：1992.3

  beta-D-Manp-O(CH2)7CH3 (5), where the hydroxyl groups that would be acted on by GlcNAcTs IV and V have been removed, was prepared as a possible specific acceptor for GlcNAcT-III. The strategy involved the chemical synthesis of beta-D-GlcpNAc-(1----2)-4-deoxy-alpha-D-lyxo-Hexp-(1----3)-] 6- deoxy-alpha-D-Manp-(1----6)]-beta-D-Manp-O)CH2)7CH3 and then addition of the last GlcpNAc residue using partially purified GlcNAcT-II

  双天线寡糖苷β-D-GlcpNAc-（1 ---- 2）-alpha-D-Manp-（1 ---- 3）-[β-D-GlcpNAc-（1 ---- 2）- α-D-Manp-（（1 ---- 6）]-β-D-Manp-OR是N-乙酰氨基葡萄糖基转移酶（GlcNAcTs）III-V的潜在底物。双脱氧五糖苷β-D-GlcpNAc-（1 ---- 2）-4-脱氧α-D-lyxo-Hexp-（1 ---- 3）-[β-DGlcpNAc-（1 ---- 2）-6-脱氧-α-D-Manp-（（1 ---- 6）] beta-D-Manp-O（CH2）7CH3（5），其中GlcNAcT IV和V已被除去，被制备为GlcNAcT-III的可能的特异性受体。该策略涉及β-D-GlcpNAc-（1 ---- 2）-4-deoxy-alpha-D-lyxo-Hexp-（1 ---- 3）-] 6-deoxy-a
• Preparation and reactions of 2-allyl-5-deoxymannose derivatives
  作者：Twana Saleh、Gérard Rousseau

  DOI：10.1016/s0040-4020(02)00150-3

  日期：2002.4

  Reaction of Danishefsky diene with benzyloxyethanal led to a pyrone which was transformed in 4-6 steps to different 5-deoxymannose derivatives, useful intermediates for the synthesis of natural product such as hemibrevetoxin. (C) 2002 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.
• Saleh, Twana; Rousseau, Gerard, Synlett, 1999, # 5, p. 617 - 619
  作者：Saleh, Twana、Rousseau, Gerard

  DOI：——

  日期：——
• Mannose-Binding Geometry of Pradimicin A
  作者：Yu Nakagawa、Takashi Doi、Takara Taketani、K. Takegoshi、Yasuhiro Igarashi、Yukishige Ito

  DOI：10.1002/chem.201301368

  日期：2013.8.5

  solid‐state NMR spectroscopy revealed that the C2–C4 region of Man is in close contact with the primary binding site of PRM‐A, while the C1 and C6 positions of Man are relatively distant. The binding geometry was further validated by co‐precipitation experiments using deoxy‐Man derivatives, leading to the proposal that PRM‐A binds not only to terminal Man residues at the non‐reducing end of glycans, but

  Pradimicins（PRMs）和benanomicins是唯一具有类凝集素特性的非肽类天然产物家族，也就是说，它们在存在Ca 2+的情况下识别D-甘露吡喃糖苷（Man）。离子。结合其独特的Man结合能力，它们通过与病原体的Man聚糖结合而具有抗真菌和抗HIV的活性。尽管PRM作为凝集素模拟物和治疗先导具有巨大潜力，但它们对Man识别的分子基础尚未建立。它们的聚集体形成倾向阻碍了溶液中的常规相互作用分析，并且由于PRM中存在两个Man结合位点，加剧了分析难度。在这项工作中，我们通过最近开发的分析策略，使用由PRM‐A和Man的1：1配合物组成的固体聚集体，研究了PRMs的原始成员PRM‐A的主要Man结合的几何形状。通过固态NMR光谱对分子间距离的评估表明，Man的C2-C4区与PRM-A的主要结合位点紧密接触，而Man的C1和C6位置相对较远。通过使用脱氧曼衍生物的共沉淀实验进一步验证