肠道病毒 D68 (EV-D68) 病毒是一种非脊髓灰质炎肠道病毒,通常会导致呼吸道疾病,严重时可导致儿童瘫痪和死亡。目前尚无针对 EV-D68 的疫苗或抗病毒药物。我们之前发现病毒 2A
蛋白酶 (2Apro) 是一种可行的抗病毒药物靶点,并确定 telaprevir 是一种 2Apro
抑制剂。2Apro 是一种病毒半胱
氨酸
蛋白酶,可裂解病毒 VP1-2A 多蛋白连接。在这项研究中,我们报道了野生型 EV-D68 2Apro 和 C107A 突变体的 X 射线晶体结构以及
特拉匹韦基于结构的先导化合物优化。在 X 射线晶体结构的引导下,我们使用分子动力学模拟预测了 telaprevir 在 2Apro 中的结合姿势。然后,我们利用该模型为
特拉匹韦的反应性弹头和 P1-P4 替换的基于结构的优化提供信息。这些努力导致发现了 2Apro
抑制剂,其抗病毒活性优于 telaprevir。这些化合物代表了作为