(αS,βS)-β-hydroxy-α-[(methoxycarbonyl)amino]-4,6-dimethyl-9-oxo-3-β-D-ribofuranosyl-4,9-dihydro-3H-imidazo[1,2-a]purine-7-butanoic acid methyl ester | 189103-83-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 核苷和核苷酸类似物
• 英文名称: (αS,βS)-β-hydroxy-α-[(methoxycarbonyl)amino]-4,6-dimethyl-9-oxo-3-β-D-ribofuranosyl-4,9-dihydro-3H-imidazo[1,2-a]purine-7-butanoic acid methyl ester
• 英文别名: β-hydroxywybutosine；(αS,βS)-α-[(methoxycarbonyl)amino]-β-hydroxy-4,6-dimethyl-9-oxo-3-β-D-ribofuranosyl-4,9-dihydro-3H-imidazo[1,2-α]purine-7-butanoic acid methyl ester；methyl (2S,3S)-4-[3-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-4,6-dimethyl-9-oxoimidazo[1,2-a]purin-7-yl]-3-hydroxy-2-(methoxycarbonylamino)butanoate
• CAS: 189103-83-1
• 化学式: C₂₁H₂₈N₆O₁₀
• 分子量: 524.488
• InChiKey: OBCAXUIWCCSJPT-RTSZMQGOSA-N

物化性质

• 密度：
  1.75±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.5
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.57
• 拓扑面积：
  211
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (αS,βS)-β-hydroxy-α-[(methoxycarbonyl)amino]-4,6-dimethyl-9-oxo-3-β-D-ribofuranosyl-4,9-dihydro-3H-imidazo[1,2-a]purine-7-butanoic acid methyl ester 在 盐酸 作用下， 反应 1.0h， 以1.5 mg的产率得到-β-hydroxywybutine
  参考文献：
  名称：

  大鼠肝脏苯丙氨酸转移核糖核酸超修饰核苷的合成与结构。

  摘要：

  （αS，βS）-β-羟基-α-[（甲氧羰基）氨基] -4,6-二甲基-9-氧代-3-β-D-呋喃呋喃糖基-4,9-二氢-3H-咪唑的首次合成通过[S-（E）]-4- [4,6-二甲基]的OsO（4）氧化获得[1,2-a]嘌呤-7-丁酸甲酯[（alphaS，betaS）-11] -9-氧代-3- [2,3,5-三-O-（叔丁基二甲基甲硅烷基）-β-D-呋喃呋喃糖基] -4,9-二氢-3H-咪唑并[1,2-a]嘌呤-7 -基] -2-[（（甲氧羰基羰基）氨基] -3-丁烯酸甲酯（13），然后通过环碳酸酯依次进行γ-脱氧，通过快速色谱从（αS，betaR）异构体中分离出来，并脱保护。另一方面，通过用核酸酶P（1）部分消化未分级的tRNA（1 g），然后以反相柱色谱法分离大鼠肝tRNA（Phe）的小核苷，其规模为100微克。用核酸酶P（1）/碱性磷酸酶完全消化，并进行反相HPLC。该核苷与合成核苷

  DOI：

  10.1248/cpb.50.1318
• 作为产物：
  描述：

  (2S)-2-amino-4-bromo-butyric acid methyl ester hydrobromide 在 吡啶 、 sodium tetrahydroborate 、 Isobutylmagnesium chloride 、 双氧水 、 sodium methylate 、 碳酸氢钠 、 间氯过氧苯甲酸 、 magnesium iodide 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 乙醚 、 二氯甲烷 、 水 、 甲苯 为溶剂， 反应 176.58h， 生成 (αS,βS)-β-hydroxy-α-[(methoxycarbonyl)amino]-4,6-dimethyl-9-oxo-3-β-D-ribofuranosyl-4,9-dihydro-3H-imidazo[1,2-a]purine-7-butanoic acid methyl ester
  参考文献：
  名称：

  植物材料中超修饰RNA碱基Wybutosine和Hydroxywywybutosine的全合成及其与其他修饰RNA碱基的定量

  摘要：

  我们报告了高效合成的超修饰天然tRNA修饰wybutosine（yW）和hydroxywybutosine（OHyW）。我们还描述了同位素标记类似物的制备，用于在包括植物材料在内的不同组织中精确定量yW和OHyW。合成涉及通过使用催化的分子内加氢胺化反应，形成异常的碱基三环结构。合成的基础也是立体选择性偶联反应，其允许将完全取代的侧链引入三环核心结构。yW和OHyW的同位素，以及其他同位素标记的tRNA修饰，最终用于LC-MS定量实验中，以研究修饰碱基在翻译过程中的作用。拟南芥。

  DOI：

  10.1002/chem.201204209

文献信息

• Structures of condensed tricyclic nucleosides of phenylalanine transfer ribonucleic acids
  作者：Taisuke Itaya、Tae Kanai

  DOI：10.1016/s0040-4039(99)01624-x

  日期：1999.11

  The unstable minor nucleosides, wyosine, wybutosine, and β-hydroxywybutosine, were isolated from tRNAs in sufficient amounts for determination of their structures.

  从tRNA中分离出足以确定其结构的不稳定次要核苷，wyosine，wybutosine和β-hydroxywybutosine。
• Synthesis of [R-(R,S)]- and [S-(R,R)]β-, the most probable alternatives for the hypermodified nucleoside of rat liver phenylalanine transfer ribonucleic acid
  作者：Taisuke Itaya、Tae Kanai、Takehiko Iida

  DOI：10.1016/s0040-4039(97)00253-0

  日期：1997.3

  The synthesis of the title compounds started with the Vilsmeier reaction of (5b) and proceeded through the Wittig reaction with (R)-N-(methoxycarbonyl)-3-(triphenylphosphonio)alaninate (4), methylation with trimethylsilyldiazomethane, OsO4 oxidation, cyclocondensation with triphosgene, and catalytic hydrogenolysis. Chromatographic separation of the resulting diastereomeric mixture and subsequent deprotection

  标题化合物的合成始于（5b）的Vilsmeier反应，并通过与（R）-N-（甲氧基羰基）-3-（三苯基膦酰基）丙氨酸的Wittig反应（4），三甲基甲硅烷基重氮甲烷甲基化，OsO 4氧化，用三光气进行环缩合和催化氢解。色谱分离得到的非对映异构体混合物，然后进行脱保护，首次获得了两个所需的核苷[[R-（R ∗，S ∗）]-和]。