1,2-O-isopropylidene-N-(9-fluorenylmethoxy-carbonyl)-3-amino-3-deoxy-α-D-ribofuranuronic acid | 380911-36-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: 1,2-O-isopropylidene-N-(9-fluorenylmethoxy-carbonyl)-3-amino-3-deoxy-α-D-ribofuranuronic acid
• 英文别名: (3aR,5S,6S,6aR)-6-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-2,2-dimethyl-3a,5,6,6a-tetrahydrofuro[2,3-d][1,3]dioxole-5-carboxylic acid
• CAS: 380911-36-4
• 化学式: C₂₃H₂₃NO₇
• 分子量: 425.438
• InChiKey: BZHMMHJJANADFG-RCLSDMTESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.4
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.39
• 拓扑面积：
  103
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1,2-O-isopropylidene-N-(9-fluorenylmethoxy-carbonyl)-3-amino-3-deoxy-α-D-ribofuranuronic acid 在 哌啶 、 2,4,6-三甲基吡啶 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 26.5h， 生成 (1S,8S,9R,13R,15S,22S,23R,27R,29S,36S,37R,41R)-11,11,25,25,39,39-hexamethyl-10,12,14,24,26,28,38,40,42-nonaoxa-3,7,17,21,31,35-hexazaheptacyclo[34.6.0.08,15.09,13.022,29.023,27.037,41]dotetracontane-2,6,16,20,30,34-hexone
  参考文献：
  名称：

  包含新型呋喃糖氨基酸的线性和环状低聚物的设计，合成和NMR结构。

  摘要：

  糖氨基酸（SAA）是含有至少一个氨基和一个羧基的糖部分。两种呋喃类SAA的简单合成方法，即3-氨基-3-脱氧-1,2-异亚丙基-α-D-呋喃呋喃甲酸（f-SAA1）和3-氨基-3-脱氧-1,2-异亚丙基-α-描述了从双丙酮葡萄糖开始的D-铝呋喃甲酸（f-SAA2）。这些SAA用作结构模板，旨在用于拟肽药物设计的新结构。f-SAA1与β-氨基酸类似，而f-SAA2与g-氨基酸类似。因此，为了合成f-SAA1的混合，线性和环状低聚物，选择β-高-甘氨酸（β-hGly，也称为β-丙氨酸）作为氨基酸对应物，而选择f-SAA2的低聚物选择了γ-氨基丁酸（GABA）。Fmoc- [f-SAA1-β-hGly]（3）-OH（3）和环[f-SAA1-β-hGly]（3）（5）类似于线性和环状β肽，具有非常不同的取代方式，与迄今文献中已知的β肽相比，Fmoc- [f-SAA2-GABA]（3）-OH（4）与

  DOI：

  10.1002/1521-3765(20021004)8:19<4365::aid-chem4365>3.0.co;2-u
• 作为产物：
  描述：

  双丙酮葡萄糖 在 吡啶 、 sodium tetrahydroborate 、 potassium permanganate 、 sodium periodate 、 sodium azide 、 2,2,6,6-四甲基哌啶氧化物 、 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 碳酸氢钠 、 溶剂黄146 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 水 、 二甲基亚砜 为溶剂， 135.0 ℃ 、1.0 MPa 条件下， 反应 256.0h， 生成 1,2-O-isopropylidene-N-(9-fluorenylmethoxy-carbonyl)-3-amino-3-deoxy-α-D-ribofuranuronic acid
  参考文献：
  名称：

  糖氨基酸的C-3差向异构体作为foldameric的组成部分：改进的合成，有用的衍生物，偶联策略

  摘要：

  为了获得用于制备同聚寡聚体或α/β-嵌合体肽的关键糖衍生物，正在开发经济和多克级的合成方法。尽管在文献中有描述，但3-氨基-3-脱氧-呋喃呋喃糖醛酸（H– t X– OH）及其C-3异构体立体异构体3-氨基-3-脱氧-呋喃呋喃糖醛酸的制备具有成本效益。此处描述了来自d-葡萄糖的（H– C X– OH）。阐述的本合成路线是（1）适用于大规模合成；（2）降低了试剂成本（例如降低了400倍）；（3）对于所有连续六个步骤（包括– t X –或– c X），优化后的产量约为80％或更高 –和（4）反应时间缩短。因此，一种新的合成路线一步工序的产量，成本，时间和纯化优化给出既为d -xylo和d -ribo氨基furanuronic氨基酸使用可持续化学（例如用有机溶剂较少色谱;使用连续-流动反应器）。我们的研究涵盖了必要的构建基块（例如– X –OMe，– X– O i Pr，– X –NHMe，Fmoc–

  DOI：

  10.1007/s00726-016-2346-5

文献信息

• Unwanted hydrolysis or α/β-peptide bond formation: how long should the rate-limiting coupling step take?
  作者：Viktória Goldschmidt Gőz、Adrienn Nagy、Viktor Farkas、Ernő Keszei、András Perczel

  DOI：10.1039/c9ra06124j

  日期：——

  branched amino acids (Ile, Thr) with slowly hydrolyzing (6 < t < 24 h) propensities, and (iii) non-hydrolyzing ones, such as the hard-to-couple β-amino acids or β-sugar amino acid derivatives, stable for longer times (t > 24 h) in solution. The current insight into the kinetics of this key hydrolysis side reaction serves as a guide to optimize the coupling conditions of α- and β-amino acids, thereby

  如今，在固相肽合成 (SPPS) 中，无论是手动、自动、连续流动还是微波辅助，与各种偶联试剂的反应都是通过原位活性酯形成进行的。在本研究中，通过使用用于 α-和 β-氨基酸的常见 PyBOP/DIEA 和 HOBt/DIC 偶联试剂，使用时间分辨1 H NMR研究了这些关键活性酯的形成和稳定性。与酰胺键形成平行，研究了 α/β-活性酯的水解，这是一个相当大的功效限制因素的副反应。根据活性酯的化学性质/组成，确定了三种氨基酸类别：（i）快速水解的（t< 6 h) 具有较小 (Ala) 甚至更长的侧链 (Arg) 具有较大的保护基团；(ii) 具有缓慢水解 (6 < t < 24 h) 倾向的支链氨基酸 (Ile, Thr) ，以及 (iii) 非水解氨基酸，例如难以偶联的 β-氨基酸或 β-糖氨基酸衍生物，在溶液中稳定较长时间 ( t > 24 h)。目前对这一关键水解副反应动力学的深入了解可作为优化
• Synthesis of chimera oligopeptide including furanoid β-sugar amino acid derivatives with free OHs: mild but successful removal of the 1,2-O-isopropylidene from the building block
  作者：Kim Hoang Yen Duong、Viktória Goldschmidt Gőz、István Pintér、András Perczel

  DOI：10.1007/s00726-020-02923-3

  日期：2021.2

  Complementary to hydrophobic five membered ring β-amino acids (e.g. ACPC), β-sugar amino acids (β-SAAs) have found increasing application as hydrophilic building blocks of foldamers and α/β chimeric peptides. Fmoc-protected β-SAAs [e.g. Fmoc-RibAFU(ip)-OH] are indeed useful Lego elements, ready to use for SPPS. The removal of 1,2-OH isopropylidene protecting group increasing the hydrophilicity of such SAA is

  作为疏水性五元环β-氨基酸（例如ACPC）的补充，β-糖氨基酸（β-SAA）作为折叠体和α/β嵌合肽的亲水性构件的应用越来越多。 Fmoc 保护的 β-SAA [例如 Fmoc-RibAFU(ip)-OH] 确实是有用的乐高元素，可用于 SPPS。本文介绍了去除 1,2-OH 异亚丙基保护基团以增加此类 SAA 的亲水性。我们首先使用 N 3 -RibAFU(ip)-OH 模型化合物来优化温和的脱保护条件。通过RP-HPLC监测1,2-OH游离产物N 3 -RibAFU- OH及其甲基糖苷甲酯N 3 -RibAFU(Me) -OMe的形成，发现50% TFA或8当量。甲醇中的 Amberlite IR-120 H +树脂是有效脱保护的最佳试剂。然后将这些条件成功地应用于嵌合寡肽的合成：-GG- X- GG-[X=RibAFU(ip)]。我们发现所建立的条件是有效的，同时足够温和，可以去除 1
• Origin of problems related to Staudinger reduction in carbopeptoid syntheses
  作者：Barbara Csordás、Adrienn Nagy、Veronika Harmat、Virág Zsoldos-Mády、Ibolya Leveles、István Pintér、Viktor Farkas、András Perczel

  DOI：10.1007/s00726-016-2289-x

  日期：2016.11

  We report the solid phase synthesis of -GG-X-GG- type alpha/beta-carbopeptoids incorporating RibAFU(ip) (1a, tX) or XylAFU(ip) (2a, cX) sugar amino acids. Though coupling efficacy is moderate, both the lengthier synthetic route using Fmoc derivative (e.g., Fmoc-RibAFU(ip)-OH) and the azido derivative (e.g., N3-RibAFU(ip)-OH) via Staudinger reaction with nBu3P can be successfully applied. Both X-ray

  我们报告了结合RibAFU（ip）（1a，tX）或XylAFU（ip）（2a，cX）糖氨基酸的-GG-X-GG-型α/β-类肽的固相合成。尽管偶联效力适中，但通过Staudinger反应与nBu3P的Fmoc衍生物（例如Fmoc-RibAFU（ip）-OH）和叠氮基衍生物（例如N3-RibAFU（ip）-OH）的较长合成路线均可成功应用。X射线衍射，1H-NMR和31P-NMR以及理论（QM）数据均支持并解释了在顺式立体异构体的情况下，如果将cX连接到前面的残基上，将Ph3P作为施陶丁格试剂的应用为何“无效”的原因带有（-CONH-）肽键 N3-cX多肽链断裂的失败源于“巧合” 空间拥挤和电子效应导致准五配位三苯基膦亚胺水解过程中无法进行强制亲核攻击。尽管如此，上述α/β-嵌合体肽的合成现已通过1,2-O-异亚丙基-3-叠氮基-3-脱氧-核糖-和-二呋喃呋喃糖醛酸（H-RibAFU（ ip）-OH
• Application of Sugar Amino Acids: Flow Chemistry Used for α/β‐Chimera Synthesis
  作者：Viktória Goldschmidt Gőz、Kim Hoang Yen Duong、Dániel Horváth、Kristóf Ferentzi、Viktor Farkas、András Perczel

  DOI：10.1002/ejoc.202100943

  日期：2021.11.25

  Tuned protocols including acid concentration (50 %/95 %) and type (TFA/HF) allow the efficient synthesis and protecting group removal from different Lego elements of β-Sugar Amino Acids, to enlarge the pool of biocompatible chimera constructs made by flow chemistry.

  包括酸浓度 (50 %/95 %) 和类型 (TFA/HF) 在内的调整方案允许从 β-糖氨基酸的不同乐高元素中高效合成和去除保护基团，以扩大由流动化学制成的生物相容性嵌合体结构的池.
• Sugar Amino Acid Containing Somatostatin Analogues that Induce Apoptosis in Both Drug-Sensitive and Multidrug-Resistant Tumor Cells
  作者：Sibylle A. W. Gruner、Gyorgy Kéri、Richard Schwab、Aniko Venetianer、Horst Kessler

  DOI：10.1021/ol0166698

  日期：2001.11.1

  [GRAPHICS]Resistance to chemotherapy has become a major problem in cancer therapy. The new sugar amino acid (SAA) containing somatostatin analogues presented possess antiproliferative and apoptotic activity against both multidrug-resistant and drug-sensitive hepatoma carcinoma cells. Synthesis, design, and biological evaluation of the cyclic analogues and of the furanoid SAA used will be discussed. Four analogues have IC50 values in the low muM range, making them promising leads for chemotherapeutic drugs against multidrug-resistant carcinoma.