根据常规肝素的结构,我们通过在序列α- D- GlcNS-(1-4)-α- L - Ido2S-(1-4)中引入一些硫酸盐基团,制备了一个智能的肝素样三糖文库)-α- D‐GlcN。根据肝素的3D结构(其特征为每四个残基旋转一个螺旋),该片段对应于最小结合基序。我们已经进行了完整的NMR研究,发现三糖具有与常规肝素本身相似的3D结构,但是它们的光谱特性使它们可以提取关于距离和偶联常数的非常详细的信息,因为它们是各向同性的分子。结合核磁共振和分子动力学分析了中央异丁酸酯环的特征构象平衡,并计算了中央异丁酸酯环的构象体。我们已经发现,在那些还原端葡糖胺的6位上没有硫酸盐基团的化合物中,2 S 0的种群在278 K时,中央艾杜糖酸酯残基的残基对温度降低至19%敏感。相反,还原端葡糖胺中含6- O-硫酸盐的三糖在温度约为2 S 0的40%时保持种群恒定。类似于在室温下观察到的情况。通过该分析揭示的另一个结构特征是,与D‐
根据常规肝素的结构,我们通过在序列α- D- GlcNS-(1-4)-α- L - Ido2S-(1-4)中引入一些硫酸盐基团,制备了一个智能的肝素样三糖文库)-α- D‐GlcN。根据肝素的3D结构(其特征为每四个残基旋转一个螺旋),该片段对应于最小结合基序。我们已经进行了完整的NMR研究,发现三糖具有与常规肝素本身相似的3D结构,但是它们的光谱特性使它们可以提取关于距离和偶联常数的非常详细的信息,因为它们是各向同性的分子。结合核磁共振和分子动力学分析了中央异丁酸酯环的特征构象平衡,并计算了中央异丁酸酯环的构象体。我们已经发现,在那些还原端葡糖胺的6位上没有硫酸盐基团的化合物中,2 S 0的种群在278 K时,中央艾杜糖酸酯残基的残基对温度降低至19%敏感。相反,还原端葡糖胺中含6- O-硫酸盐的三糖在温度约为2 S 0的40%时保持种群恒定。类似于在室温下观察到的情况。通过该分析揭示的另一个结构特征是,与D‐
Effect of the Substituents of the Neighboring Ring in the Conformational Equilibrium of Iduronate in Heparin-like Trisaccharides
作者:Juan Carlos Muñoz-García、Javier López-Prados、Jesús Angulo、Irene Díaz-Contreras、Niels Reichardt、José L. de Paz、Manuel Martín-Lomas、Pedro M. Nieto
DOI:10.1002/chem.201202770
日期:2012.12.14
detailed information about distances and coupling constants as they are isotropic molecules. The characteristic conformational equilibrium of the central iduronate ring has been analyzed combining NMR and molecular dynamics and the populations of the conformers of the central iduronate ring have been calculated. We have found that in those compounds lacking the sulfate group at position 6 of the reducing
根据常规肝素的结构,我们通过在序列α- D- GlcNS-(1-4)-α- L - Ido2S-(1-4)中引入一些硫酸盐基团,制备了一个智能的肝素样三糖文库)-α- D‐GlcN。根据肝素的3D结构(其特征为每四个残基旋转一个螺旋),该片段对应于最小结合基序。我们已经进行了完整的NMR研究,发现三糖具有与常规肝素本身相似的3D结构,但是它们的光谱特性使它们可以提取关于距离和偶联常数的非常详细的信息,因为它们是各向同性的分子。结合核磁共振和分子动力学分析了中央异丁酸酯环的特征构象平衡,并计算了中央异丁酸酯环的构象体。我们已经发现,在那些还原端葡糖胺的6位上没有硫酸盐基团的化合物中,2 S 0的种群在278 K时,中央艾杜糖酸酯残基的残基对温度降低至19%敏感。相反,还原端葡糖胺中含6- O-硫酸盐的三糖在温度约为2 S 0的40%时保持种群恒定。类似于在室温下观察到的情况。通过该分析揭示的另一个结构特征是,与D‐