N^α-(fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)-O-(3,4,6-tri-O-acetyl-2-deoxy-2-dithiasuccinimido-β-D-glucopyranosyl)-L-serine pentafluorophenyl ester | 162894-84-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子
• 英文名称: N^α-(fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)-O-(3,4,6-tri-O-acetyl-2-deoxy-2-dithiasuccinimido-β-D-glucopyranosyl)-L-serine pentafluorophenyl ester
• 英文别名: N^α-Fmoc-Ser(3,4,6-tri-O-acetyl-2-deoxy-2-(dithiasuccinoylamino)-β-D-glucopyranose)-OPfp；N^α-Fmoc-Ser(Ac3-β-D-GlcNDts)-OPfp；(2,3,4,5,6-pentafluorophenyl) (2S)-3-[(2R,3R,4R,5S,6R)-4,5-diacetyloxy-6-(acetyloxymethyl)-3-(3,5-dioxo-1,2,4-dithiazolidin-4-yl)oxan-2-yl]oxy-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)propanoate
• CAS: 162894-84-0
• 化学式: C₃₈H₃₁F₅N₂O₁₄S₂
• 分子量: 898.793
• InChiKey: CATYVQOVSMFCHQ-GAMKIHMTSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5
• 重原子数：
  61
• 可旋转键数：
  18
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.34
• 拓扑面积：
  250
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  21

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N^α-(fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)-O-(3,4,6-tri-O-acetyl-2-deoxy-2-dithiasuccinimido-β-D-glucopyranosyl)-L-serine pentafluorophenyl ester 在 溶剂黄146 、 锌 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 1.5h， 以90%的产率得到N^α-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-3-O-(2-amino-2-deoxy-3,4,6-tri-O-acetyl-β-D-glucopyranosyl)-L-serine 1,2'-lactam
  参考文献：
  名称：

  从 N-二硫代琥珀酰保护衍生物合成 2-乙酰氨基-2-脱氧-β-d-吡喃葡萄糖O-糖肽1-3

  摘要：

  2-乙酰氨基-2-脱氧-β-d-吡喃葡萄糖 (β-d-GlcpNAc)，在与丝氨酸 (Ser) 和苏氨酸 (Thr) 残基侧链羟基的 O-糖苷键中，经常在细胞核和细胞质中发现蛋白质。固相糖肽合成的“活性酯”方法需要 Nα-(9-芴基甲氧羰基)氨基酸五氟苯基酯 (Nα-Fmoc-AA-OPfp's) 的直接糖基化。所需的 Ser(β-d-GlcpNAc) 和 Thr(β-d-GlcpNAc) 结构单元的合成带来了由相应糖基供体中的 2-氨基取代基引起的特殊问题。用 2-N-酰基基团激活供体提供了相对不活泼的恶唑啉中间体，而原本有希望的邻苯二甲酰基 (Phth) 基团需要在高温下长时间进行碱处理才能将其去除，并且经常遇到不完全脱保护。二硫代琥珀酰基 (Dts) 基团以与 Phth 基团相同的方式提供二价保护，但具有在温和条件下快速去除的优点...

  DOI：

  10.1021/ja953529i
• 作为产物：
  描述：

  3,4,6-tri-O-acetyl-2-deoxy-2-dithiasuccinimido-β-D-glucopyranose 在 3 A molecular sieve 、 potassium carbonate 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 12.0h， 生成 N^α-(fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)-O-(3,4,6-tri-O-acetyl-2-deoxy-2-dithiasuccinimido-β-D-glucopyranosyl)-L-serine pentafluorophenyl ester
  参考文献：
  名称：

  二硫代琥珀酰（Dts）氨基保护基，用于合成1,2-反-氨基糖苷

  摘要：

  具有氨基官能团的N-二硫代琥珀酰（N- Dts）保护基的合适的受保护的D-葡糖胺衍生物已经以新的替代途径应用于1，2-反式-糖基化。所述ø - （3,4,6-三- ø -乙酰基-2-脱氧-2- dithiasuccinoylamino-β- d吡喃葡萄糖基）三- chloroacetimidate 7已被用于制备相应的以良好的收率由路易斯酸促进β糖苷。所述Ñ -dithiasuccinoyl保护基团是很容易通过硫解使用2- sulfanylethanol或二硫苏糖醇或还原使用boranuide钠，从而得到去除，之后Ñ-乙酰化，相应的N-乙酰基-β - D-葡糖胺糖苷。已经证明，可以在使用叠氮基的情况下，通过硼氢化钠选择性地还原Dts基团，或者通过二硫苏糖醇通过二硫苏糖醇同时还原Dts-和叠氮基团，使用二异丙基乙胺作为催化剂。构建块的合成。Ñ α -Fmoc-SER（AC 3 -β- d -GlcNDts）-OPfp

  DOI：

  10.1039/p19950000405

文献信息

• Versatile solid-phase thiolytic reduction of azido and N-Dts groups in the synthesis of haemoglobin (67–76) O-glycopeptides and photoaffinity labelled analogues to study glycan T-cell specificity
  作者：Ernst Meinjohanns、Morten Meldal、Teis Jensen、Ole Werdelin、Luisa Galli-Stampino、Søren Mouritsen、Klaus Bock

  DOI：10.1039/a606725e

  日期：——

  A series of O-glycosylated peptides and photoaffinity labelled glycopeptide analogues of the mouse haemoglobin-derived decapeptide Hb (67–76), VITAFNEGLK, which binds well to the MHC class II Ek molecule and is non-immunogenic in CBA/J mice, was synthesized by multiple-column peptide synthesis employing the glycosylated building blocks 1–4 and 7–21. The non-immunogenic peptide VITAFNEGLK was converted into an immunogen by introducing different tumour-associated carbohydrate moieties [β-D-GlcNAc-O -Ser/Thr, α-D-GalNAc-O-Ser/Thr (TN-antigen) core 1 (T-antigen), core 2, core 3 and core 4] to the central position Asn-72 in the decapeptide. Previous studies suggest that T cells may be capable of recognizing epitopes which are partially defined by glycans and may be in direct contact with the T-cell receptor. In order to study the specificity of glycan interactions with the T-cell receptor a series of corresponding glycopeptides labelled with 2-azidobenzamide on the carbohydrate amino function was synthesized. The glycan structure was varied with respect to O-GlcNAc, T and TN-antigen moieties and anomeric configuration. Throughout, efficient reduction of the N-dithiasuccinyl- and azido-functionality-containing building blocks 1, 2, 7, 8, 11, 12, 13, 16, 18 and 20 could be achieved either (i) in solution by utilizing simultaneous in situ reduction with Zn in THF–HOAc–Ac2O or (ii) on solid-phase upon treatment with diisopropylethylamine and an excess of dithiothreitol or α-mercapto-N-methylacetamide. N-Acetylation of the resin-bound glycopeptides furnished the O-glycopeptides 24, 25 and 31–36. No further modification of the carbohydrate moiety on the solid phase was required when utilizing the N-acetylated building blocks 3, 4, 9, 10, 14, 15, 17, 19 and 21. In addition, comparative studies with solid-phase reduction were conducted for the syntheses of the O-linked glycopeptides 24, 25 and 31–36 by employing any of the building blocks 1–4 and 7–21. The photoaffinity labelled glycopeptides 39–45 were synthesized by employing building blocks 1, 2, 7, 8 and 11–13 by reduction of azido or N-Dts functionalities by thiolysis with dithiothreitol and subsequent coupling of the activated photoaffinity label 38 to the glycanamino group of the resin-bound glycopeptides. The synthesized mucin O-glycopeptides 24, 25 and 31–36 and the photoaffinity labelled analogues 39–45 were fully characterized by 1D and 2D 1H NMR spectroscopy and by electrospray mass spectrometry.

  利用糖基化结构单元 1â4 和 7â21 通过多柱肽合成法合成了一系列 O-糖基化肽和光亲和标记的小鼠血红蛋白衍生十肽 Hb（67â76）的糖肽类似物 VITAFNEGLK，它能很好地与 MHC II 类 Ek 分子结合，并且对 CBA/J 小鼠无免疫原性。通过在十肽的中心位置 Asn-72 引入不同的肿瘤相关碳水化合物分子 [δ-D-GlcNAc-O-Ser/Thr、δ-D-GalNAc-O-Ser/Thr（TN 抗原）核心 1（T 抗原）、核心 2、核心 3 和核心 4]，将非免疫原性肽 VITAFNEGLK 转化为免疫原。 以往的研究表明，T 细胞可能能够识别部分由聚糖定义的表位，并可能与 T 细胞受体直接接触。为了研究聚糖与 T 细胞受体相互作用的特异性，我们合成了一系列在碳水化合物氨基功能上用 2- 叠氮苯甲酰胺标记的相应聚糖肽。聚糖结构随 O-GlcNAc、T 和 TN 抗原分子以及异构体构型的不同而变化。自始至终，含 N-二硫代丁二酰基和叠氮官能团的结构单元 1、2、7、8、11、12、13、16、18 和 20 都可以通过以下两种方法实现高效还原：(i) 在溶液中用 Zn 在 THFâHOAcâAc2O 中同时原位还原；或 (ii) 在固相上用二异丙基乙胺和过量的二硫苏糖醇或δ-巯基-N-甲基乙酰胺处理。对树脂结合的糖肽进行 N-乙酰化，可得到 O-糖肽 24、25 和 31â36。在使用 N-乙酰化结构单元 3、4、9、10、14、15、17、19 和 21 时，不需要在固相上进一步修饰碳水化合物分子。此外，在合成 O-连接糖肽 24、25 和 31â36 时，还进行了固相还原比较研究，采用的是 1â4 和 7â21 中的任何一种构建模块。光亲和标记的糖肽 39â45 是通过使用构建模块 1、2、7、8 和 11â13 合成的，方法是用二硫苏糖醇进行硫醇分解还原叠氮或 N-Dts 官能，然后将活化的光亲和标记 38 与树脂结合的糖肽的甘氨酸基偶联。通过一维和二维 1H NMR 光谱以及电喷雾质谱法，对合成的粘蛋白 O 型糖肽 24、25 和 31â36 以及光亲和标记的类似物 39â45 进行了全面鉴定。
• Comparison of N-Dts and N-Aloc in the solid-phase syntheses of O-GlcNAc glycopeptide fragments of RNA-polymerase II and mammalian neurofilaments
  作者：Ernst Meinjohanns、Antonio Vargas-Berenguel、Morten Meldal、Hans Paulsen、Klaus Bock

  DOI：10.1039/p19950002165

  日期：——

  The application of the glycosylated building blocks N-alpha-Fmoc-Ser(Ac-3-beta-D-GlcNAc)-OPfp 5, N-alpha-Fmoc-Thr(Ac-3-beta-D-GlcNAc)-OPfp 6, N-alpha-Fmoc-Ser(Ac-3-beta-D-GlcNDts)-OPfp 7 and N-alpha-Fmoc-Thr(Ac-3-beta-D-GlcNDts)-OPfp 8 in the solid-phase synthesis-of O-GlcNAc glycopeptides from the C-terminal domain repeating unit of RNA-polymerase II and the NF-L chain of mammalian neurofilaments is described. The removal of the N-dithiasuccinoyl (N-Dts) amino-protecting group was achieved rapidly and quantitatively by thiolysis with 2-sulfanylethanol or dithiothreitol after the incorporation of the building blocks into the resin-bound peptide. The O-GlcNAc glycopeptides 9-11, 13 and 15-21 were synthesised in good yields by comparative studies employing any of the building blocks 5-8. The O-GlcNAc glycopeptides were fully characterised by 1D- and 2D-H-1 NMR spectroscopy and ES-MS.