5-[((1H-indol-2-yl)carbonyl)amino]-1H-indole-2-carboxylic acid | 101134-91-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 5-[((1H-indol-2-yl)carbonyl)amino]-1H-indole-2-carboxylic acid
• 英文别名: 1H-Indole-2-carboxylic acid, 5-[(1H-indol-2-ylcarbonyl)amino]-；5-(1H-indole-2-carbonylamino)-1H-indole-2-carboxylic acid
• CAS: 101134-91-2
• 化学式: C₁₈H₁₃N₃O₃
• 分子量: 319.32
• InChiKey: UGSFWARHEQMCHX-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  310 °C (decomp)(Solv: methanol (67-56-1))
• 沸点：
  591.6±35.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.552±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.2
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.0
• 拓扑面积：
  98
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-[((1H-indol-2-yl)carbonyl)amino]-1H-indole-2-carboxylic acid 在 sodium hydride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 23.5h， 生成 (+)-(8bR,9aS)-1,2,9,9a-2-<<5-<(1H-indol-2ylcarbonyl)amino>-1H-indol-2-yl>carbonyl>tetrahydrocyclopropabenzindol-4-one <(+)-CBI-bis-indole>
  参考文献：
  名称：

  CBI-PDE-I-二聚体的合成和生化评估，CBI-PDE-I-二聚体是（+）-CC-1065的苯甲酰化类似物，在小鼠中也产生延迟的毒性。

  摘要：

  开发了一种实用的CBI（2）合成方法，并将其应用于CC-1065的苯甲酰化类似物的合成，包括CBI-PDE-I-二聚体（13）和CBI-双吲哚[（+）-A'BC]。显示CBI-PDE-I-二聚体具有与（+）-CC-1065类似的DNA序列选择性和对DNA的结构作用。特别重要的是观察到的与（+）-CC-1065的未烷基化亚基的吡咯烷环相关的双链缠绕效应，并可能与其延迟的毒性作用有关。还比较了CBI-PDE-I-二聚体与（+）-CC-1065在解旋酶II抑制双链解开和T4连接酶进行切口密封方面的效果，发现在数量上相似。CBI化合物的体外和体内效力与相应的CPI衍生物非常接近。最后，

  DOI：

  10.1021/jm00066a004
• 作为产物：
  描述：

  5-氨基吲哚-2-甲酸乙酯 在 1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 5-[((1H-indol-2-yl)carbonyl)amino]-1H-indole-2-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  以cc-1065为模型的U- 71,184是一种有效的新型抗肿瘤药的全合成

  摘要：

  描述了新型抗肿瘤抗生素CC-1065的高效类似物U-71,184（2）的合成，其倒数第二步涉及对甲氧基苯甲酸羟乙酯的解掩蔽，后者经过分子内容易的消除以提供反应性环丙基螺环己二酮。还制备了其对映异构体U-71,185，并显示其对生物无活性。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)84921-7

文献信息

• Synthesis and evaluation of duocarmycin SA analogs incorporating the methyl 1,2,8,8a-tetrahydrocyclopropa[c]imidazolo[4,5-e]indol-4-one-6-carboxylate (CImI) alkylation subunit
  作者：Prem B. Chanda、Kristopher E. Boyle、Daniel M. Brody、Vyom Shukla、Dale L. Boger

  DOI：10.1016/j.bmc.2016.04.050

  日期：2016.10

  The design, synthesis, and evaluation of methyl 1,2,8,8a-tetrahydrocyclopropa[c]imidazolo[4,5-e]indol-4-one-6-carboxylate (CImI) derivatives are detailed representing analogs of duocarmycin SA and yatakemycin containing an imidazole replacement for the fused pyrrole found in the DNA alkylation subunit.

  1,2,8,8a-四氢环丙烷[ c ]咪唑并[4,5 - e ]吲哚-4-一-6-羧酸盐（CImI）衍生物的设计，合成和评估详细描述了杜卡霉素SA和yatakemycin含有咪唑替代品，用于取代DNA烷基化亚基中的稠合吡咯。
• Conjugates between minor groove binders and Zn(II)-tach complexes: Synthesis, characterization, and interaction with plasmid DNA
  作者：Claudia Sissi、Luca Dovigo、Maria Laura Greco、Antonella Ciancetta、Stefano Moro、Jakub W. Trzciński、Fabrizio Mancin、Paola Rossi、Giampiero Spalluto、Paolo Tecilla

  DOI：10.1016/j.tet.2017.04.013

  日期：2017.5

  of conjugates between a Zn(II)-tach complex and (indole)2 or benzofuran-indole amide minor groove binders connected through alkyl or oxyethyl linkers of different lengths has been prepared. The conjugates bind strongly to DNA. However, the complexation to DNA to promote the Zn(II) catalyzed hydrolytic cleavage of the DNA results instead in its inhibition. This inhibition effect has been confirmed also

  Zn（II）-tach络合物和（吲哚）2之间的新的共轭物家族已经制备了通过不同长度的烷基或氧乙基接头连接的苯并呋喃-吲哚酰胺或苯并呋喃-吲哚酰胺小沟粘合剂。结合物与DNA牢固结合。但是，与DNA的络合促进了Zn（II）催化的DNA的水解裂解，反而导致了对DNA的抑制。使用Cu（II）也已经证实了这种抑制作用。建模研究表明，在最稳定的复合物构象中，小沟结合剂和接头位于小沟中，阻碍了金属配合物与DNA磷酸盐骨架之间的相互作用。因此，小沟槽粘合剂-连接剂-金属络合物的线性排列似乎对于确保紧密结合是有效的，但是从水解的观点来看是无效的。
• [EN] CYCLIC PRODRUGS OF DUOCARMYCIN ANALOGS<br/>[FR] PROMÉDICAMENTS CYCLIQUES D'ANALOGUES DE DUOCARMYCINE
  申请人：SCRIPPS RESEARCH INST

  公开号：WO2013148631A1

  公开（公告）日：2013-10-03

  The invention provides prodrugs of DNA-reactive analogs of duocarmycin and CC-1065 anticancer agents, wherein a cyclic prodrug form, such as carbamate, thionocarbamate, or carbamimidate, can be hydrolyzed by the patient in vivo to yield a respective bioactive agent comprising a DNA-alkylating moiety and a binding/targeting moiety. The DNA-reactive moiety is a γ-spirocyclohexenone fused to a heterocyclyl group which can be produced by endogenous hydrolysis of a cyclic carbamate prodrug of the invention. The cyclic carbamate prodrug produces no residual byproduct during activation in vivo. Methods of synthesis and biological methods and data are also provided.

  该发明提供了DNA-反应性类似物duocarmycin和CC-1065抗癌药物的前药，其中循环前药形式，如氨基甲酸酯，硫代氨基甲酸酯或氨基甲酸酰胺，可以在体内被患者水解，产生包含DNA烷基化基团和结合/靶向基团的生物活性剂。DNA-反应性基团是与异环丙环己酮融合的杂环基团，可以通过该发明的循环氨基甲酸酯前药的内源水解产生。在体内激活过程中，循环氨基甲酸酯前药不产生任何残留副产物。还提供了合成方法和生物学方法和数据。
• Synthesis and Properties of Substituted CBI Analogs of CC-1065 and the Duocarmycins Incorporating the 7-Methoxy-1,2,9,9a-tetrahydrocyclopropa[<i>c</i>]benz[<i>e</i>]indol-4-one (MCBI) Alkylation Subunit:  Magnitude of Electronic Effects on the Functional Reactivity
  作者：Dale L. Boger、Jeffrey A. McKie、Hui Cai、Barbara Cacciari、P. G. Baraldi

  DOI：10.1021/jo952033g

  日期：1996.1.1

  radical-alkene cyclization (24 --> 25, 32 --> 33) for completion of the synthesis of the 1,2-dihydro-3H-benz[e]indole skeleton and final Ar-3' alkylation of 28 for introduction of the activated cyclopropane. Two approaches to the implementation of the key 5-exo-trig free radical cyclization are detailed with the former proceeding with closure of 24 to provide 25 in which the required product functionalization was

  在以下文献中描述了7-甲氧基-1,2,9,9a-四氢环丙烷[c]苯并[e]吲哚-4-酮（MCBI）的合成，MCBI是带有对C4羰基的C7甲氧基的取代的CBI衍生物。努力确定对试剂的化学和功能反应性的潜在电子效应的大小。通过修饰的Stobbe缩合/ Friedel-Crafts酰化反应制备MCBI烷基化亚基的核心结构，以生成适当官能化的萘前体（15和20），然后进行5-exo-trig芳基自由基-烯烃环化（24-> 25、32-> 33）完成1，2-二氢-3H-苯并[e]吲哚骨架的合成，最后28的Ar-3'烷基化，以引入活化的环丙烷。详细介绍了实现关键的5-exo-trig自由基环化的两种方法，前者以24结束，以提供25，其中在环化之前引入了所需的产品功能化，而后者则用了环化产物的Tempo捕集器官能化的未反应的烯烃底物32提供33％。后一种简洁的方法以极好的总转化率（27-30％）以12-
• Rational Design, Synthesis, and Evaluation of Key Analogues of CC-1065 and the Duocarmycins
  作者：Mark S. Tichenor、Karen S. MacMillan、James S. Stover、Scott E. Wolkenberg、Maria G. Pavani、Lorenzo Zanella、Abdel N. Zaid、Gianpiero Spalluto、Thomas J. Rayl、Inkyu Hwang、Pier Giovanni Baraldi、Dale L. Boger

  DOI：10.1021/ja073989z

  日期：2007.11.1

  be as potent as or slightly more potent than the natural product duocarmycin SA (DSA-TMI, IC50 = 5 vs 8 pM), and MeCTI-PDE2 proved to be 3-fold more potent than the natural product CC-1065 (MeCPI-PDE2, IC50 = 7 vs 20 pM). Both exhibited efficiencies of DNA alkylation that correlate with this enhanced potency without impacting the intrinsic selectivity characteristic of this class of antitumor agents

  设计、合成和评估 CC-1065 的可预测更有效的类似物，需要替换烷基化亚基中的单个骨架原子，并基于从化学物质之间的基本抛物线关系中出现的设计原则进行。反应性和细胞毒性。与预测一致，7-甲基-1,2,8,8a-四氢环丙[c]噻吩并[3,2-e]吲哚-4-酮（MeCTI）烷基化亚基及其异构体6-甲基-1,2，发现 8,8a-四氢环丙 [c] 噻吩并 [2,3-e]indol-4-one (iso-MeCTI) 比 CC-1065 中发现的 MeCPI 烷基化亚基稳定 5-6 倍，并且更稳定甚至比在 duocarmycin SA 中发现的 DSA 烷基化亚基还要好，使其处于此类抗肿瘤药物的最佳平衡稳定性和反应性点。它们与天然产物的关键类似物的结合提供了超过 MeCPI 衍生物效力的衍生物（3-10 倍），匹配或略微超过相应 DSA 衍生物的效力，与基于抛物线关系的预测一致. 其中值得注意的是，MeCTI-TMI