4',6'-O-benzylidene-penta-N-benzyloxycarbonyl-paromomycin | 55728-89-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 4',6'-O-benzylidene-penta-N-benzyloxycarbonyl-paromomycin
• 英文别名: 4',6'-O-benzylidene-per-N-Cbz-paromomycin；O⁴-(O⁴,O⁶-(R)-benzylidene-2-benzyloxycarbonylamino-α-D-2-deoxy-glucopyranosyl)-O⁵-[O³-(2,6-bis-benzyloxycarbonylamino-β-L-2,6-dideoxy-idopyranosyl)-β-D-ribofuranosyl]-N,N'-bis-benzyloxycarbonyl-1D-2-deoxy-streptamine；4',6'-O-benzylidene-penta-N-benzyloxycarbonylparomomycin；4',6'-O-benzylidene-per-Cbz-paromomycin；O^4'_,O6'-(R)-benzylidene-N¹,N³,N^{2'_,N2'''_,N6'''}-pentakis-benzyloxycarbonyl-paromomycin-I；benzyl N-[(4aR,6S,7R,8R,8aS)-6-[(1R,2R,3S,4R,6S)-2-[(2S,3R,4S,5R)-4-[(2R,3R,4R,5S,6S)-4,5-dihydroxy-3-(phenylmethoxycarbonylamino)-6-(phenylmethoxycarbonylaminomethyl)oxan-2-yl]oxy-3-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]oxy-3-hydroxy-4,6-bis(phenylmethoxycarbonylamino)cyclohexyl]oxy-8-hydroxy-2-phenyl-4,4a,6,7,8,8a-hexahydropyrano[3,2-d][1,3]dioxin-7-yl]carbamate
• CAS: 55728-89-7
• 化学式: C₇₀H₇₉N₅O₂₄
• 分子量: 1374.42
• InChiKey: YKDWCDZYYWBGPW-IFHFADRGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4
• 重原子数：
  99
• 可旋转键数：
  29
• 环数：
  11.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  387
• 氢给体数：
  11
• 氢受体数：
  24

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  叔丁基二甲硅基三氟甲磺酸酯 、 4',6'-O-benzylidene-penta-N-benzyloxycarbonyl-paromomycin 在 2,4,6-三甲基吡啶 作用下， 以 二氯甲烷 、 甲苯 为溶剂， 反应 24.0h， 以75%的产率得到benzyl N-[(4aR,6S,7R,8R,8aS)-6-[(1R,2R,3S,4R,6S)-2-[(2S,3R,4S,5R)-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-4-[(2R,3R,4R,5S,6S)-4,5-dihydroxy-3-(phenylmethoxycarbonylamino)-6-(phenylmethoxycarbonylaminomethyl)oxan-2-yl]oxy-3-hydroxyoxolan-2-yl]oxy-3-hydroxy-4,6-bis(phenylmethoxycarbonylamino)cyclohexyl]oxy-8-hydroxy-2-phenyl-4,4a,6,7,8,8a-hexahydropyrano[3,2-d][1,3]dioxin-7-yl]carbamate
  参考文献：
  名称：

  功能新颖的氨基糖苷类抗生素的结构化设计，合成和A位rRNA共结晶复合物：巴龙霉素的C2“醚类似物。

  摘要：

  根据新的位点选择性功能化，制备了一系列2'-O-取代的巴龙霉素醚类似物。几种类似物的X射线共晶复合物揭示了在A位rRNA中的新结合方式，即环I和II采用了以前对巴龙霉素观察到的熟悉的方向和位置，但环III和IV的取向不同，除少数例外，所有这些新类似物对敏感的金黄色葡萄球菌均表现出与巴龙霉素相同或更好的抑制活性。获得了针对大肠杆菌的MIC值，其中一些醚附件含有极性或碱性端基；两种类似物在小鼠败血病保护试验中显示出优异的存活率；对肾脏的初步组织病理学分析未显示明显的毒性迹象，而使用新霉素和卡那霉素的对照组在较低剂量下有毒。

  DOI：

  10.1021/jm061200+
• 作为产物：
  描述：

  苯甲醛 、 penta-N-Cbz-paromomycin 在 甲酸 、 sodium carbonate 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 12.0h， 生成 4',6'-O-benzylidene-penta-N-benzyloxycarbonyl-paromomycin
  参考文献：
  名称：

  [EN] ANTIBACTERIAL AMINOGLYCOSIDE ANALOGS
  [FR] ANALOGUES D'AMINOGLYCOSIDE ANTIBACTÉRIENS

  摘要：

  揭示了具有抗菌活性的化合物。这些化合物具有以下结构（I）：（I）包括立体异构体、药学上可接受的盐和前药，其中Q1、Q2、R1、R2和R3如本文所定义。还公开了与制备和使用这些化合物相关的方法，以及包含这些化合物的药物组合物。

  公开号：

  WO2010042851A1

文献信息

• Aminoglycoside antibiotics: The formation and characterization of dihydrooxazine derivatives in the paromomycin series
  作者：Stephen Hanessian、Robert Massé、Goran Ekborg

  DOI：10.1139/v78-243

  日期：1978.6.1

  Treatment of penta-N-benzyloxycarbonylparomomycin with benzaldehyde and excess zinc chloride gives a dibenzylidene derivative in high yield. This consists of the 4′,6′-O-benzylidene 4′′′,6′′′-N,O-benzylidene (dihydrooxazine) derivative of penta-N-benzyloxycarbonylparomomycin. Chemical evidence is presented to support this structure and model studies are reported for the formation of dihydrooxazine and oxazolidine derivatives of benzyloxycarbonylamino sugars containing suitably situated hydroxyl groups. The easily obtained dihydrooxazine derivative of paromomycin constitutes an interesting, preferentially blocked derivative, that is useful for the chemical modification of the parent antibiotic.

  对五重N-苄氧羰基帕罗莫霉素进行苯甲醛和过量氯化锌处理，可以高产得到二苄亚甲基衍生物。这包括五重N-苄氧羰基帕罗莫霉素的4′，6′-O-苄亚甲基4′′′，6′′′-N，O-苄亚甲基（二氢噁唑）衍生物。化学证据支持这种结构，并报道了模型研究，以形成含有适当位置羟基的苄氧羰基氨基糖的二氢噁唑和噁唑烷衍生物。易于获得的帕罗莫霉素二氢噁唑衍生物是一种有趣的、优先阻断的衍生物，可用于对亲本抗生素进行化学修饰。
• Hybrid Aminoglycoside Antibiotics <i>via</i> Tsuji Palladium-Catalyzed Allylic Deoxygenation
  作者：Stephen Hanessian、Juan Pablo Maianti、Rowena D. Matias、Lee Ann Feeney、Eliana S. Armstrong

  DOI：10.1021/ol2027703

  日期：2011.12.16

  Biosynthetically inspired manipulation of the antibiotic paromomycin led, in six high-yielding steps, to a ring A harboring an alpha,beta-unsaturated 6'-aldehyde and an allylic 3'-methylcarbonate group. Tsuji deoxygenation in the presence of 5 mol % Pd-2(dba)(3) and Bu3P granted access to a novel series of 3',4'-dideoxy-4',5'-dehydro ring A hybrids. The neomycin-sisomicin hybrid exhibited superior in vitro antibacterial activity to the parent compound neomycin.
• [EN] ANTIBACTERIAL AMINOGLYCOSIDE ANALOGS<br/>[FR] ANALOGUES ANTIBACTÉRIENS D'AMINOGLYCOSIDES
  申请人：ACHAOGEN INC

  公开号：WO2011044498A9

  公开（公告）日：2012-02-09
• WO2008/124821
  申请人：——

  公开号：——

  公开（公告）日：——
• [EN] ANTIBACTERIAL AMINOGLYCOSIDE ANALOGS<br/>[FR] ANALOGUES D'AMINOGLYCOSIDES ANTIBACTÉRIENS
  申请人：ACHAOGEN INC

  公开号：WO2010030704A2

  公开（公告）日：2010-03-18

  Compounds having antibacterial activity are disclosed. The compounds have the following structure (I) including stereoisomers, pharmaceutically acceptable salts and prodrugs thereof, wherein Q1, Q2, Z1, Z2, Z3, Z4, R1, R2 and R3 are as defined herein. Methods associated with preparation and use of such compounds, as well as pharmaceutical compositions comprising such compounds, are also disclosed.