methyl 4-isobutoxy-1H-indole-2-carboxylate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: methyl 4-isobutoxy-1H-indole-2-carboxylate
• 英文别名: methyl 4-(2-methylpropoxy)-1H-indole-2-carboxylate
• 化学式: C₁₄H₁₇NO₃
• 分子量: 247.294
• InChiKey: MGEDXXJQBIVDNV-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.5
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  51.3
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 4-isobutoxy-1H-indole-2-carboxylate 在 lithium hydroxide monohydrate 、 水 、 1-羟基苯并三唑 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 17.0h， 生成 N-((S)-1-(((S)-1-(benzo[d]thiazol-2-yl)-1-oxo-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propan-2-yl)amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl)-4-isobutoxy-1H-indole-2-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  开发具有新型 P3 支架的有效二肽型 SARS-CoV 3CL 蛋白酶抑制剂：设计、合成、生物学评估和对接研究。

  摘要：

  我们报告了一系列具有新型 P3 支架的二肽型抑制剂的设计和合成，这些抑制剂对 SARS-CoV 3CLpro 显示出有效的抑制活性。一项涉及二肽先导化合物 4 和 3CLpro 之间结合的对接研究表明，用 4 中的各种刚性 P3 部分对结构灵活的 P3 N-(3-甲氧基苯基)甘氨酸进行修饰。这些修饰导致了几种有效衍生物的鉴定，包括 5c -k 和 5n 的抑制活性（Ki 或 IC50）在亚微摩尔至纳摩尔范围内。尤其是化合物 5h，显示出最有效的抑制活性，Ki 值为 0.006 μM。该效力比先导化合物 4 的效力高 65 倍 (Ki=0.39 μM)。此外，5h 的 Ki 值与等温滴定量热法 (ITC) 中观察到的结合亲和力 (16 nM) 非常吻合。围绕先导 4 中 P3 基团的 SAR 研究发现刚性吲哚-2-羰基单元是最佳 P3 部分之一 (5c)。进一步优化表明，吲哚单元4位的甲氧基取代非常有利于增强抑制效力。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2013.07.037
• 作为产物：
  描述：

  4-甲氧吲哚-2-羧酸甲脂 在 三溴化硼 、 三苯基膦 、 偶氮二甲酸二乙酯 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.5h， 生成 methyl 4-isobutoxy-1H-indole-2-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  开发具有新型 P3 支架的有效二肽型 SARS-CoV 3CL 蛋白酶抑制剂：设计、合成、生物学评估和对接研究。

  摘要：

  我们报告了一系列具有新型 P3 支架的二肽型抑制剂的设计和合成，这些抑制剂对 SARS-CoV 3CLpro 显示出有效的抑制活性。一项涉及二肽先导化合物 4 和 3CLpro 之间结合的对接研究表明，用 4 中的各种刚性 P3 部分对结构灵活的 P3 N-(3-甲氧基苯基)甘氨酸进行修饰。这些修饰导致了几种有效衍生物的鉴定，包括 5c -k 和 5n 的抑制活性（Ki 或 IC50）在亚微摩尔至纳摩尔范围内。尤其是化合物 5h，显示出最有效的抑制活性，Ki 值为 0.006 μM。该效力比先导化合物 4 的效力高 65 倍 (Ki=0.39 μM)。此外，5h 的 Ki 值与等温滴定量热法 (ITC) 中观察到的结合亲和力 (16 nM) 非常吻合。围绕先导 4 中 P3 基团的 SAR 研究发现刚性吲哚-2-羰基单元是最佳 P3 部分之一 (5c)。进一步优化表明，吲哚单元4位的甲氧基取代非常有利于增强抑制效力。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2013.07.037

文献信息

• TRICYCLIC INDOLE DERIVATIVES AND METHODS OF USE THEREOF
  申请人：Venkatraman Srikanth

  公开号：US20110189127A1

  公开（公告）日：2011-08-04

  The present invention relates to Tricyclic Indole Derivatives, compositions comprising at least one Tricyclic Indole Derivatives, and methods of using the Tricyclic Indole Derivatives for treating or preventing a viral infection or a virus-related disorder in a patient.

  本发明涉及三环吲哚衍生物、包含至少一种三环吲哚衍生物的组合物，以及使用三环吲哚衍生物治疗或预防患者的病毒感染或与病毒相关的疾病的方法。
• Design, synthesis and antiproliferative activity of a novel class of indole-2-carboxylate derivatives
  作者：Xing-yue Ji、Si-tu Xue、Yue-chen Zhan、Jia-jia Shen、Lin-tao Wu、Jie Jin、Zhen Wang、Zhuo-rong Li

  DOI：10.1016/j.ejmech.2014.05.043

  日期：2014.8

  Based on the chemical structure of Pyrroloquinoline quinone (PQQ), a novel class of indole-2-carboxylate derivatives was designed, synthesized and assayed for antiproliferative activity in cancer cells in vitro. The biological results showed that some derivatives exhibited significant antiproliferative activity against HepG2, A549 and MCF7 cells. Notably, the novel compounds, methyl 6-amino-4-cyclohexylmethoxy-1H-indole-2-carboxylate (6e) and methyl 4-isopropoxy-6-methoxy-1H-indole-2-carboxylate (9l) exhibited more potent antiproliferative activity than the reference drugs PQQ and etoposide in vitro, with IC50 values ranging from 3.78 ± 0.58 to 24.08 ± 1.76 μM. Further biological assay showed that both compounds 6e and 9l increased ROS generation dose-dependently, and induced PARP cleavage in A549 cells. Consequently, 6e and 9l appeared as promising anticancer lead compounds for further optimization.
• US8901139B2
  申请人：——

  公开号：US8901139B2

  公开（公告）日：2014-12-02
• Development of potent dipeptide-type SARS-CoV 3CL protease inhibitors with novel P3 scaffolds: Design, synthesis, biological evaluation, and docking studies
  作者：Pillaiyar Thanigaimalai、Sho Konno、Takehito Yamamoto、Yuji Koiwai、Akihiro Taguchi、Kentaro Takayama、Fumika Yakushiji、Kenichi Akaji、Shen-En Chen、Aurash Naser-Tavakolian、Arne Schön、Ernesto Freire、Yoshio Hayashi

  DOI：10.1016/j.ejmech.2013.07.037

  日期：2013.10

  We report the design and synthesis of a series of dipeptide-type inhibitors with novel P3 scaffolds that display potent inhibitory activity against SARS-CoV 3CLpro. A docking study involving binding between the dipeptidic lead compound 4 and 3CLpro suggested the modification of a structurally flexible P3 N-(3-methoxyphenyl)glycine with various rigid P3 moieties in 4. The modifications led to the identification

  我们报告了一系列具有新型 P3 支架的二肽型抑制剂的设计和合成，这些抑制剂对 SARS-CoV 3CLpro 显示出有效的抑制活性。一项涉及二肽先导化合物 4 和 3CLpro 之间结合的对接研究表明，用 4 中的各种刚性 P3 部分对结构灵活的 P3 N-(3-甲氧基苯基)甘氨酸进行修饰。这些修饰导致了几种有效衍生物的鉴定，包括 5c -k 和 5n 的抑制活性（Ki 或 IC50）在亚微摩尔至纳摩尔范围内。尤其是化合物 5h，显示出最有效的抑制活性，Ki 值为 0.006 μM。该效力比先导化合物 4 的效力高 65 倍 (Ki=0.39 μM)。此外，5h 的 Ki 值与等温滴定量热法 (ITC) 中观察到的结合亲和力 (16 nM) 非常吻合。围绕先导 4 中 P3 基团的 SAR 研究发现刚性吲哚-2-羰基单元是最佳 P3 部分之一 (5c)。进一步优化表明，吲哚单元4位的甲氧基取代非常有利于增强抑制效力。